Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  400  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124214576--124215272
88
8.4
84
75
13
501
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19
16
30
1.94
124214809--124214942
71
1.9
70
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4
180
31
20
17
30
1.96
124214906--124215143
90
2.6
91
84
4
311
36
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1.91
124215047--124215290
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3.3
74
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296
34
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1.93
124227351--124227398
19
2.5
19
81
18
64
56
4
6
33
1.44
124227370--124227412
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2.1
20
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12
52
55
6
4
32
1.47
124227472--124227539
34
2.1
32
83
10
84
52
1
5
39
1.34
124227585--124227629
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3.8
12
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11
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4
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124227479--124227629
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24
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35
1.46
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3.5
11
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20
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2
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0
0.74
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3.5
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74
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15
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26
6
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1.15
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29
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1.17
124231574--124231671
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3.9
24
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13
72
31
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3
58
1.41
124235531--124235595
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2.1
32
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13
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1
1
49
1.20
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1.20
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17
2.1
16
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50
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5
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2.1
30
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50
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2.0
34
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44
2
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46
1.43
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38
2.1
39
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2
126
38
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2.2
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0
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4
0
34
1.15
124261218--124261266
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2.0
24
88
8
71
65
6
0
28
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124261252--124261280
12
2.5
12
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5
51
79
6
0
13
0.93
124264597--124264687
38
2.5
35
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16
94
28
3
1
67
1.14
124273143--124273203
32
1.9
32
100
0
122
32
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13
47
1.68
124273706--124273834
15
8.9
14
73
17
70
25
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1
65
1.26
124273706--124273813
29
3.8
28
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18
78
25
7
1
64
1.30
124273746--124273860
21
5.2
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20
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28
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0
62
1.25
124273906--124273942
15
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0
0
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52
23
2
0
74
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3
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28
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1.9
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0
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25
1.9
25
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22
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21
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2
71
1.17
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34
2.7
34
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3
130
26
12
16
45
1.82
124298269--124298311
22
2.0
22
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4
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16
2
37
1.60
124298388--124298430
22
2.0
22
86
4
61
44
16
2
37
1.60
124298454--124298627
94
1.9
94
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0
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17
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35
2.1
35
86
2
99
30
16
5
46
1.70
124301870--124301899
12
2.5
12
94
0
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36
10
13
40
1.78
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2.2
12
100
0
52
76
0
0
23
0.78
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24
1.9
25
83
12
62
6
42
2
48
1.40
124307315--124307680
163
2.3
161
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442
34
7
16
41
1.76
124307315--124307680
160
2.3
158
83
7
436
34
7
16
41
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124311111--124311150
19
2.0
20
85
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55
32
5
10
52
1.56
124311354--124311400
21
2.2
21
82
10
60
27
0
6
65
1.16
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2.4
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15
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1.95
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72
2.1
72
92
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248
23
20
17
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13
2.2
13
100
0
56
21
17
35
25
1.95
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19
2.2
20
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59
26
19
7
47
1.74
124334979--124335280
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3.6
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86
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1.95
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21
20
1.96
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20
1.95
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34
22
21
22
1.97
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4.5
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36
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22
20
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23
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1.96
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22
29
1.96
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1.9
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2
100
0
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0
0
50
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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238
25
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26
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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0
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1.89
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42
4
4
50
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433