Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  419  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128463738--128463920
95
1.9
96
89
1
287
32
27
14
26
1.94
128465071--128465170
8
13.0
7
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21
53
72
0
5
23
1.04
128465070--128465141
20
3.8
19
75
24
71
69
0
5
25
1.10
128465079--128465168
33
2.7
34
84
8
105
73
0
4
22
1.01
128465119--128465168
5
10.4
5
76
23
54
80
0
2
18
0.82
128465079--128465168
45
2.0
43
85
4
117
73
0
4
22
1.01
128465079--128465167
16
5.4
16
76
14
74
73
0
4
22
1.02
128468893--128468942
10
5.0
10
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9
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70
2
6
22
1.20
128472933--128472987
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2.2
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27
14
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128473654--128473696
20
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21
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4
61
74
0
2
23
0.93
128475743--128476065
131
2.5
131
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4
330
34
18
20
26
1.95
128476881--128476924
23
1.9
23
81
9
54
56
4
2
36
1.32
128478768--128478812
22
2.0
24
86
8
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2
2
15
80
0.92
128479225--128479313
45
2.0
45
82
8
110
26
28
15
29
1.96
128479173--128479437
133
2.0
133
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2
363
29
24
18
27
1.98
128491019--128491392
131
2.8
131
77
4
335
33
18
19
28
1.95
128495503--128495632
62
2.1
62
88
0
188
21
25
26
26
1.99
128498811--128498849
13
3.0
13
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53
74
5
10
10
1.21
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2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
128501736--128501788
26
2.0
28
89
10
85
22
3
11
62
1.45
128501743--128501797
27
2.1
26
86
3
74
21
7
10
60
1.55
128502573--128502621
22
2.0
25
85
14
68
63
14
2
20
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128506468--128506552
44
1.9
44
100
0
170
49
10
9
30
1.69
128507990--128508057
16
4.4
16
79
3
68
45
25
1
27
1.62
128513167--128513212
22
2.0
23
83
4
58
26
2
4
67
1.21
128516410--128516503
38
2.4
38
92
1
152
21
23
17
38
1.93
128516693--128516812
24
5.0
23
80
12
136
25
23
21
29
1.99
128516694--128516812
47
2.5
48
87
8
163
26
23
21
28
1.99
128516863--128516922
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
128516863--128516917
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
128516965--128517012
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
128524500--128524592
37
2.4
38
92
3
152
21
23
16
38
1.92
128524805--128524899
23
4.1
23
91
4
147
28
22
21
28
1.99
128524784--128524900
46
2.5
47
87
8
159
27
23
21
28
1.99
128524951--128525004
11
5.4
11
70
20
55
31
20
11
37
1.88
128524951--128525009
19
3.0
20
95
5
111
33
20
10
35
1.86
128540035--128540146
43
2.6
42
80
4
116
38
24
17
19
1.93
128540557--128540613
24
2.4
23
80
8
60
45
42
1
10
1.49
128540556--128540612
16
3.6
16
71
15
55
45
42
1
10
1.49
128550761--128550794
2
17.5
2
93
6
61
50
0
0
50
1.00
128554458--128554593
26
5.2
26
95
0
227
36
23
5
34
1.77
128554927--128554951
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
128556915--128556955
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2.1
19
86
4
55
68
0
2
29
1.03
128559148--128559180
17
2.0
17
88
5
50
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128559750--128559797
2
24.0
2
100
0
96
50
0
0
50
1.00
128560707--128560752
23
2.0
24
86
4
67
73
2
8
15
1.16
128566047--128566097
11
4.7
11
81
9
52
35
0
1
62
1.06
128566056--128566094
9
4.3
9
87
6
53
35
0
0
64
0.94
128566047--128566122
18
4.4
18
74
19
65
32
1
2
63
1.17
128566251--128566287
2
18.5
2
94
0
56
48
5
0
45
1.25
128566277--128566316
20
2.0
20
85
9
55
32
10
0
57
1.32
128566463--128566515
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2.0
27
84
0
70
26
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5
60
1.46
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3
20.3
3
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1
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1.12
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22
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1.92
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101
2.3
102
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376
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15
22
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1.93
128568761--128568863
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1.9
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4
143
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23
22
1.96
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53
4.8
53
73
11
207
35
16
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24
1.95
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0
0
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18
51
29
0
4
66
1.12
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15
2.7
15
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25
10
1.41
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24
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25
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0
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2.0
20
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24
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1.93
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26
5.2
26
92
1
227
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10
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8.2
26
95
0
365
36
25
5
32
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
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13
5
50
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
2
2
67
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
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1
0
34
1.03

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433