Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  426  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130816981--130817012
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0
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0
0
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1.10
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57
3
0
38
1.17
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1.9
40
89
5
120
63
5
3
27
1.33
130834106--130834197
40
2.3
39
77
19
98
65
5
3
26
1.30
130840146--130840198
24
2.3
23
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12
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0
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2.1
24
85
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24
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1.31
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2.3
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19
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0
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2
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36
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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6
613
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12
29
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14
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100
0
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2.1
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0
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14
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46
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10
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19
27
27
1.99
130923356--130923560
108
1.9
108
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0
275
25
19
27
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130928552--130928612
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1.32
130928893--130928932
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1.9
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90
10
64
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5
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2.0
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1.58
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0
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Period
Size
Copy
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
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60
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
238
24
26
13
36
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433