Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr06 132263754 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  424  of  433  ( 51894 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130120570--130120701
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4.6
29
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0
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25
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130123685--130123735
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0
1
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2.0
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0
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35
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2.1
14
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0
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40
26
0
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1.57
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0
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0
0
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15
53
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10
17
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130154328--130154409
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2.9
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0
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2.1
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0
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1.8
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3.8
46
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11
198
28
27
21
22
1.99
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46
3.1
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136
29
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1.98
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1.9
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644
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10
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37
1.87
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0
0
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102
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0
59
0.97
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12
2.8
12
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9
50
33
0
0
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0.92
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2.8
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2
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1
57
1.19
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12.0
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0
78
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0
80
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3.3
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43
0
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49
1.29
130178654--130178695
20
2.1
20
82
8
50
38
2
2
57
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130178630--130178729
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3.0
33
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2
2
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1.23
130178705--130178756
20
2.6
20
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11
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0
0
46
1.00
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2.5
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17
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0
41
1.22
130178892--130178965
16
4.0
18
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25
57
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2
17
0.94
130178892--130178967
24
3.2
24
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14
79
77
1
2
18
0.95
130179026--130179080
22
2.5
22
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1
0
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1
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2.6
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18
19
18
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19
2.1
19
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20
2
5
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18
2.0
18
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48
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132
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0
60
1.24
130201616--130201681
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19
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1
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1.9
21
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20
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2.0
26
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57
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38
1.17
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2.3
23
81
12
58
38
3
5
51
1.43
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2.2
39
82
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98
39
2
13
44
1.56
130210132--130210167
14
2.7
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87
8
54
83
2
5
8
0.89
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19
15
0
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1.29
130210600--130210632
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11.0
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100
0
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33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130214383--130214449
29
2.2
31
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15
79
37
11
23
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1.90
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17.0
2
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0
50
44
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5
50
1.26
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38
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118
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10
15
23
1.75
130231506--130231584
34
2.4
33
78
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86
43
0
3
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1.19
130233229--130233364
58
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43
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17
25
1.85
130233258--130233364
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3.6
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16
27
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2
16
0.95
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1.9
92
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0
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35
14
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28
1.92
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20
2.1
19
85
4
53
60
2
0
37
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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33
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6.8
6
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0
55
4
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19
1.72
130294053--130294093
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3.4
12
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0
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4
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43
19
1.72
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1.9
18
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0
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8
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1.79
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30
0
0
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0
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3
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177
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0
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1.60
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130340084--130340278
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2.0
22
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0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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58
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0
0
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0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
0
51
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433