Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  265  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82383289--82383471
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121
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2.0
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23
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10
0
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1.37
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2.1
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2.0
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1.9
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31
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2.2
30
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2
85
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23
1.96
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1.95
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2.1
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0
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1.99
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1.00
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13
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18
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0
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22
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30
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44
1.78
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40
5.2
40
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2
229
25
23
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
37
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13
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27
4.6
27
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11
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2.0
20
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9
0
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1.31
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16
25
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26
16
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1.96
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27
15
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1.96
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19
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1.9
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1.58
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17
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4
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0
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1.14
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0
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12
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11
0
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1.38
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1.24
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16
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17
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13
60
58
6
0
34
1.24
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30
2.0
30
84
15
81
28
20
3
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1.9
20
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37
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30
18
22
1.97
82558858--82559051
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47
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0
289
27
28
10
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1.90
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23
5.1
22
62
28
59
24
30
13
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82562577--82562762
40
4.7
40
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1
284
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19
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29
1.98
82562577--82562784
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2.6
80
89
3
312
23
20
27
28
1.99
82562581--82562784
40
5.1
40
91
2
277
24
20
26
28
1.99
82570827--82571051
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5.6
40
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310
26
19
25
28
1.99
82570830--82571087
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3.2
80
86
2
270
25
20
25
28
1.99
82572762--82572871
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4.3
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85
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114
29
22
20
27
1.99
82572775--82572872
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3.8
26
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1
153
28
22
22
26
1.99
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16
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1.96
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28
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1.99
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21
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1.99
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26
15
28
1.96
82626207--82626386
40
4.5
40
79
6
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24
25
23
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82626207--82626384
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80
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25
23
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2.00
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2
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54
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1
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82628407--82628607
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0
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28
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0
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2.00
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25
1.90
82660515--82660803
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25
1.90
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82660817--82660997
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20
26
26
1.99
82662485--82662718
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79
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26
20
26
26
1.99
82662485--82662718
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2
371
26
20
26
26
1.99
82662723--82662824
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3.6
27
73
10
78
22
19
28
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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57
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30
1.96
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1.94
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1.99
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26
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1.99
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0
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0
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0
251
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31
21
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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0
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23
1.98
82789776--82789938
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1.98
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1.99
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1.99
82804385--82804567
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2.3
80
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0
213
28
24
26
21
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433