Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  405  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125343361--125343391
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14
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0
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0
19
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1.56
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24
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13
115
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6
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1.44
125345327--125345445
49
2.4
50
82
8
138
31
5
5
57
1.44
125345327--125345473
49
3.0
47
79
8
136
29
5
6
59
1.44
125356131--125356191
23
2.5
24
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12
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45
4
3
45
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125356912--125357018
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2.1
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11
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125359007--125359201
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5.0
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189
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31
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0
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0
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1.00
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2.8
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12
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17
17
17
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44
8.4
43
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12
224
36
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19
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129
4.0
130
81
8
563
36
21
20
21
1.95
125377519--125378245
172
4.2
172
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5
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35
20
22
21
1.96
125377699--125378245
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6.3
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93
2
861
34
20
23
20
1.96
125377519--125378245
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2.8
259
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900
35
20
22
21
1.96
125380378--125380493
3
39.0
3
77
8
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32
6
1
58
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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0
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1.9
257
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16
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125391988--125392017
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2.0
15
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50
0
10
40
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27
2.3
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10
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125398355--125398413
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5.7
10
73
15
57
37
1
3
57
1.25
125398358--125398420
20
3.0
21
76
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34
3
3
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1.30
125417128--125417215
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113
13
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23
36
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27
4.2
26
84
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145
15
24
23
37
1.93
125423713--125423827
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2.1
54
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3
187
14
24
23
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1.93
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2.1
21
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27
0
6
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15
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0
3
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21
1.86
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22
1.9
22
90
0
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66
2
7
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1.28
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1.38
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22
2.0
22
95
0
81
46
4
20
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0
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0
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93
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5
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102
54
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5
34
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125450517--125450645
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2.1
59
81
11
145
54
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5
34
1.48
125450646--125450672
14
1.9
14
100
0
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51
0
11
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2
35
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2
17.5
2
93
0
61
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125450920--125450992
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11.8
6
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1.26
125451682--125451738
21
2.6
21
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15
53
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19
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2.0
13
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0
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15
23
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1.9
18
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0
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1.00
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9
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1.70
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47
0
0
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1.00
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66
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0
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8
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24
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3
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1.53
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2.0
19
85
10
51
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
0
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4
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41
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125496742--125497299
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23
21
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1.97
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26
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26
1.99
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26
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2.0
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26
20
26
26
1.99
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1.99
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18
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3
0
25
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
17
100
0
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5
5
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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0
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0
0
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1.83
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1.95
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7.2
44
72
8
225
31
16
24
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433