Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  392  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121916788--121916813
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2.2
12
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0
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40
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28
20
23
1.99
121919040--121919190
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1.9
80
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1.99
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0
30
0
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4
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2
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291
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30
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5
55
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30
1.9
31
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3
102
25
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1.20
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2.1
15
100
0
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50
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0
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3
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100
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2
0
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11
73
11
54
27
26
1
44
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121951288--121951337
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2.4
21
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121953006--121953066
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2.0
30
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0
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0
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20
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18
16
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1.92
121956739--121957301
247
2.3
247
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18
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1.9
153
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0
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0
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2
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0
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0
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3
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0
0
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17
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75
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112
17
0
7
75
1.04
121977861--121977931
35
2.0
35
91
5
117
16
0
8
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1.05
121977866--121977940
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2.1
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98
22
0
6
70
1.10
121978283--121978361
35
2.3
34
91
2
122
20
10
49
20
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121978965--121979302
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5.7
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70
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258
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14
26
1.94
121979042--121979239
53
3.5
53
69
22
170
36
22
14
26
1.92
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2.8
116
96
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584
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23
14
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1.93
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0
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13
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0
58
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13
13
1.45
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218
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20
17
27
1.95
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19
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2
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100
0
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0
0
48
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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177
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1
6
27
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122080185--122080297
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1.31
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4.1
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1.36
122091576--122091686
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122092021--122092182
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6.6
24
77
14
113
57
4
5
32
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433