Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  64  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18426023--18426150
50
2.5
51
87
7
190
35
15
22
25
1.94
18426126--18426305
31
5.8
31
90
1
245
28
18
25
27
1.98
18426330--18426494
47
3.7
46
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6
169
28
15
26
29
1.96
18426424--18426538
42
2.7
43
89
4
171
30
14
26
27
1.95
18430629--18430673
19
2.3
19
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3
63
55
6
6
31
1.52
18433313--18433374
30
2.1
30
100
0
124
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29
3
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55
35
0
0
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0.94
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20
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14
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1.93
18451052--18451168
43
2.7
43
79
6
148
29
18
17
35
1.94
18454919--18455077
43
3.7
43
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7
162
25
16
25
31
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18461286--18461423
42
3.2
42
80
11
129
31
25
17
26
1.97
18461317--18461424
44
2.5
42
80
8
112
31
27
17
23
1.97
18466726--18466783
25
2.3
25
85
11
75
63
1
13
20
1.38
18474297--18474407
55
2.0
55
82
3
134
28
29
25
16
1.96
18488496--18488720
40
5.7
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22
26
27
2.00
18488496--18488746
80
3.2
80
85
3
321
24
22
25
26
2.00
18492675--18492707
17
1.9
17
88
11
50
9
6
24
60
1.49
18499099--18499229
44
3.0
42
85
6
147
20
17
27
34
1.95
18500943--18500984
22
2.0
22
90
4
68
19
28
42
9
1.82
18501110--18501165
28
2.0
29
89
10
89
16
42
23
17
1.88
18502191--18502435
49
5.1
48
73
11
191
23
32
18
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18502171--18502449
93
2.9
93
80
6
294
24
31
17
25
1.97
18505061--18505096
18
2.0
18
94
0
63
33
25
22
19
1.97
18506502--18506725
96
2.3
96
83
3
263
25
25
18
31
1.98
18506542--18506621
23
3.4
23
63
19
56
25
25
20
30
1.99
18506401--18506736
144
2.3
141
80
8
376
25
27
17
30
1.97
18506404--18506724
48
6.7
48
78
9
239
24
27
18
29
1.98
18510524--18510563
16
2.5
16
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0
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40
5
22
32
1.76
18510722--18510783
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2.1
28
82
11
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50
1
1
46
1.20
18511626--18511686
30
2.0
30
100
0
122
29
13
9
47
1.74
18511635--18511692
30
2.0
28
87
9
82
29
15
8
46
1.75
18512063--18512128
33
2.0
33
90
0
105
10
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20
2.0
20
100
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5
10
60
1.49
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16
2.1
16
88
0
50
47
0
5
47
1.26
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15
2.1
15
94
0
55
15
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1.36
18526597--18526641
17
2.6
17
92
0
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33
15
22
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1.95
18527797--18527836
21
1.9
21
100
0
80
27
10
25
37
1.88
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20
2.0
21
85
4
57
51
2
0
46
1.14
18530914--18531022
36
3.0
36
78
2
112
14
27
23
33
1.94
18532127--18532290
25
6.6
25
68
17
81
63
4
5
26
1.35
18532127--18532403
24
11.3
26
69
15
144
62
3
5
28
1.35
18532214--18532428
97
2.3
94
84
5
265
61
4
4
29
1.35
18532212--18532451
50
5.2
44
74
15
191
62
4
4
28
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18532495--18532530
17
2.1
18
89
5
56
66
0
5
27
1.13
18533576--18533610
14
2.4
15
90
4
54
11
0
28
60
1.32
18534147--18534369
44
4.8
44
67
11
149
26
21
21
30
1.99
18533969--18534796
143
5.9
142
80
6
817
27
21
20
29
1.98
18534022--18534796
286
2.7
284
82
6
909
27
21
20
29
1.98
18535704--18535807
53
2.0
53
96
0
190
52
8
16
22
1.70
18537337--18537443
46
2.3
46
74
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117
38
16
24
20
1.93
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144
1.9
144
82
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346
31
19
20
28
1.97
18539634--18539937
24
12.2
24
72
14
176
27
5
3
62
1.36
18539605--18539829
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2.4
93
82
6
263
28
4
4
62
1.34
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5.0
21
69
19
65
22
5
5
66
1.34
18539875--18539937
25
2.5
25
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0
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0
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0
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0
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0
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51
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0
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19
9
30
1.83
18566444--18566536
43
2.2
43
78
7
100
29
22
13
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18572057--18572082
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2.2
12
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0
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26
7
38
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2.7
49
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2
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23
26
20
29
1.99
18572612--18572789
98
1.8
97
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259
24
26
20
28
1.99
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2.8
21
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5
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13
13
1.83
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100
0
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0
0
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24
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1.94
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15
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0
2
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1.11
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0
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1.97
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1.97
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1.98
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1.98
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0
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0
0
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0
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2
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0
0
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2.2
26
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9
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57
0
1
40
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18627863--18627920
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2.3
24
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5
1
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22
27
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2.00
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2
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22
1.99
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2.7
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21
29
25
23
1.99
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1.9
80
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2
183
22
30
24
22
1.99
18644208--18644315
40
2.7
38
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128
21
29
25
23
1.99
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34
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22
19
25
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26
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1.99
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2.00
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25
1.99
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25
29
22
23
1.99
18673817--18673966
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1.9
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196
24
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26
1.99
18674792--18674837
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2.5
19
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17
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1.96
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18
30
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1.97
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1.82
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23
17
24
1.96
18690128--18690236
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48
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23
17
24
1.96
18692062--18692235
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20
21
29
28
1.98
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13
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1.63
18695173--18695259
29
3.0
29
81
8
95
10
17
16
56
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18707964--18708030
13
5.2
13
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43
1.71
18707964--18708017
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2.1
26
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3
40
1.70
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12
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0
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1.58
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1.98
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1.99
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1.98
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6.5
27
76
8
122
27
14
27
31
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433