Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  358  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112466788--112466887
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5.9
17
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61
49
3
4
44
1.36
112466788--112466843
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3.0
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21
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1
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1.30
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17
2.0
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5
54
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0
0
28
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3.7
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6
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4.9
19
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8
152
35
16
10
37
1.84
112467921--112468010
35
2.5
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10
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11
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112467942--112467997
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15
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35
16
10
37
1.83
112468366--112468565
45
4.5
45
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1.94
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3.5
78
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4
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24
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1.97
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3.7
21
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40
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6
35
1.75
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19
4.9
19
90
8
152
35
16
10
37
1.84
112480837--112480926
35
2.5
37
89
10
143
35
15
11
37
1.83
112480858--112480913
17
3.5
15
88
9
60
35
16
10
37
1.83
112482176--112482205
15
2.0
15
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0
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6
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3.9
45
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27
28
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22
1.99
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43
2.0
43
84
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115
27
29
18
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1.98
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15
2.2
15
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10
50
60
12
0
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17
19
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35
5.1
35
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2
207
34
22
13
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22
2.0
22
100
0
90
46
8
17
26
1.78
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28
2.0
28
86
6
80
10
21
36
31
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112508458--112508487
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2.1
14
100
0
60
36
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13
16
1.88
112513393--112513440
17
2.7
18
81
9
55
20
41
10
27
1.85
112513570--112513650
23
3.6
23
71
3
83
32
28
11
28
1.91
112513770--112513867
14
6.8
15
80
5
96
31
24
15
28
1.95
112513770--112513860
29
3.2
29
83
6
87
31
26
15
26
1.96
112516548--112516684
49
2.8
49
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10
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3.5
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1
234
41
13
15
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1.86
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4.9
40
88
1
263
28
28
19
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1.98
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2.0
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0
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0
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0
100
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0
34
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2
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2
100
0
54
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0
0
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13.5
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100
0
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51
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48
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1.00
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2.3
15
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5
50
18
3
33
45
1.65
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2.0
22
81
0
52
18
2
36
43
1.63
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28
69
24
90
37
0
17
45
1.53
112570687--112571324
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640
39
14
16
28
1.89
112571111--112571151
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2.9
14
77
0
55
51
4
12
31
1.60
112570687--112571309
251
2.5
247
84
3
775
39
15
17
28
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112574930--112575139
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5.2
40
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2
305
21
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24
25
1.99
112581578--112581680
29
3.6
29
81
2
118
23
16
32
28
1.96
112589566--112589668
29
3.6
29
81
2
118
23
16
32
28
1.96
112595278--112595343
21
3.0
21
77
16
78
27
1
16
54
1.51
112596599--112596651
26
2.0
26
92
0
88
60
1
1
35
1.19
112604180--112604230
21
2.4
21
93
6
86
33
33
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3
1.76
112610611--112610635
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100
0
50
48
0
0
52
1.00
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1.9
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25
25
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26
25
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22
1.99
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21
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23
1.99
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1.9
80
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2
183
22
30
24
22
1.99
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128
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1.9
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183
22
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22
1.99
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8
128
21
29
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21
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52
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0
11
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1.40
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20
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2.2
21
100
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.97
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408
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9
42
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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7.9
9
72
16
64
35
9
20
35
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433