Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  11  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3058334--3058380
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127
17
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1
70
1.23
3058333--3058425
17
5.2
17
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13
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2.0
36
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2
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3
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2
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1
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2.3
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102
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2.2
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28
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0
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2.0
22
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0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
50
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2
0
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0
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2.0
37
85
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100
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4
5
21
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18
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9
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0
9
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0.88
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3.8
13
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0
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0
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22
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3072260--3072374
54
2.1
54
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153
37
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22
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26
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252
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18
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100
0
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22
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0
3
31
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2.2
17
100
0
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34
5
34
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1.79
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40
2.0
39
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2
102
19
6
61
12
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2.0
23
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60
39
0
2
58
1.10
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24
2.0
24
83
8
60
42
0
2
55
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21
2.1
21
100
0
90
64
4
4
26
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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42
4
6
46
1.48
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51
0
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0
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0
2
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4
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6
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2
2
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0
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0
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0
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100
0
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216
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16
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214
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4
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17
16
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1.92
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103
21
6
3
68
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3152048--3152103
25
2.3
24
84
3
67
19
3
5
71
1.21
3161791--3161893
10
10.7
9
71
13
62
61
2
1
33
1.22
3161840--3161882
18
2.3
18
84
11
52
58
4
2
34
1.32
3161792--3161893
39
2.6
38
77
10
100
60
2
1
34
1.23
3162087--3162199
10
11.5
10
68
23
53
29
3
2
64
1.24
3162088--3162209
29
4.2
28
77
9
84
29
4
3
63
1.29
3162118--3162192
39
1.9
39
84
10
100
32
2
4
61
1.28
3162128--3162225
29
3.4
29
77
8
110
32
4
5
58
1.39
3165115--3165251
68
2.0
67
97
1
256
27
16
16
39
1.90
3167640--3167708
23
3.1
21
69
18
59
21
0
18
59
1.38
3171269--3171298
15
2.0
15
93
0
51
66
3
0
30
1.07
3172532--3172558
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
3189453--3189484
10
3.4
10
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12
50
37
0
0
62
0.95
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25
2.7
24
78
9
67
58
1
1
38
1.17
3199162--3199236
9
8.3
9
74
11
55
32
6
44
17
1.75
3199159--3199236
27
2.9
28
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32
6
43
17
1.75
3206578--3206658
26
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26
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4
27
1.75
3206567--3206657
45
2.0
45
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0
182
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28
1.81
3217614--3217670
30
2.0
30
86
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36
22
7
33
1.81
3224281--3224314
17
1.9
18
88
5
52
61
5
0
32
1.20
3225834--3225877
17
2.4
18
85
14
56
72
2
2
22
1.07
3230078--3230112
18
2.0
18
88
5
54
54
5
8
31
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3232938--3233031
31
3.0
32
92
4
147
77
13
3
5
1.06
3232938--3233031
32
3.0
32
89
7
140
77
13
3
5
1.06
3233225--3233263
17
2.3
17
86
8
53
17
10
0
71
1.12
3233485--3233541
29
2.0
29
82
6
71
22
10
7
59
1.54
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11
2.7
11
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0
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0
0
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12
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12
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0
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25
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1.77
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27
2.3
28
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13
67
59
4
3
32
1.34
3243923--3244025
38
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4
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1.37
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2.5
35
79
3
97
51
4
6
37
1.49
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10
3.5
10
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14
54
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2
8
0
0.61
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2.2
16
90
9
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0
8
2
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30
2.1
30
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99
41
29
9
19
1.83
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14
2.2
14
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0
53
58
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1.58
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70
4.5
75
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8
370
32
18
17
31
1.95
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377
33
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30
1.94
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2.1
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7
222
32
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1.97
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163
90
4
905
33
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1.96
3246428--3246598
74
2.3
76
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5
249
32
20
19
27
1.97
3246578--3246612
14
2.5
14
90
0
52
57
5
20
17
1.60
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73
5.9
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71
14
290
35
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17
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1.95
3246588--3247038
71
6.3
71
71
12
309
37
20
17
24
1.94
3247038--3247300
70
3.7
71
83
5
347
37
22
14
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3246877--3247467
257
2.3
256
95
2
1038
36
22
14
25
1.93
3254189--3254290
37
2.6
38
76
20
104
57
3
4
33
1.38
3254367--3254404
2
19.0
2
88
0
58
52
2
0
44
1.14
3254511--3254605
39
2.4
39
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3
102
52
4
6
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1.46
3255157--3255191
15
2.3
15
90
9
54
0
8
2
88
0.61
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3.0
42
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12
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1.92
3257332--3257451
47
2.6
47
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1
143
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31
90
0
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25
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5
190
25
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1.93
3260220--3260269
22
2.3
22
86
6
66
58
10
22
10
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433