Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  417  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127946093--127946139
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2.1
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0
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37
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1.79
127950486--127950647
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6.2
26
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0
261
37
24
5
32
1.79
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2.0
21
90
0
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1.84
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2.0
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2.1
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2.6
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1.98
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2.5
131
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2.0
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3
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127984551--127984605
28
2.0
28
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0
74
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32
1
25
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127984565--127984620
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3
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12
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1.9
19
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3.2
26
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1.81
128017754--128017913
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3.1
52
94
0
275
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1.81
128020367--128020441
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10.1
7
77
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1
0
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1.06
128020367--128020441
30
2.6
27
80
17
87
38
1
0
60
1.06
128020385--128020442
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34
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1.04
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2.1
27
83
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40
1
0
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17
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31
3
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1.22
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24
22
10
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24
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3.8
209
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4
939
30
18
21
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128038806--128038873
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4.5
10
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2
0
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1.06
128038800--128038874
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23
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14
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0
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182
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6
33
1.81
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50
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14
2.1
14
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0
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66
3
6
23
1.30
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4.3
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4
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15
26
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24
2.0
24
86
0
67
44
4
19
31
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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0
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3
0
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29
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1
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1.37
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7
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0
0
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0
1
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2.0
27
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6
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5
7
54
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1
3
30
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433