Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  351  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110404617--110404709
27
3.4
27
80
2
89
37
17
23
21
1.94
110405512--110405662
26
5.8
26
86
2
196
28
21
22
27
1.99
110405512--110405656
53
2.8
52
89
3
211
28
22
22
26
1.99
110405512--110405662
79
1.9
78
87
1
221
28
21
22
27
1.99
110405807--110405898
42
2.2
42
88
0
130
28
10
22
38
1.88
110420402--110420443
18
2.3
18
87
0
57
35
7
38
19
1.79
110420399--110420462
21
3.0
21
79
2
74
42
6
34
17
1.74
110431804--110431914
29
3.9
29
80
5
109
23
29
15
31
1.95
110439554--110439660
29
3.7
29
81
5
108
23
30
15
29
1.96
110447248--110447282
17
1.9
19
88
11
56
28
20
0
51
1.47
110449116--110449159
22
2.0
22
95
0
79
38
11
13
36
1.81
110452732--110452765
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
110453081--110453118
17
2.4
16
86
8
51
34
0
2
63
1.09
110453161--110453199
21
1.9
21
89
5
62
25
0
10
64
1.25
110454126--110454163
18
2.1
18
85
9
51
50
2
7
39
1.46
110454685--110454771
44
2.0
44
100
0
174
29
2
25
42
1.67
110455239--110455266
8
3.5
8
100
0
56
35
0
28
35
1.58
110457076--110457131
23
2.4
23
85
5
69
44
21
14
19
1.86
110462052--110462091
22
1.9
20
85
10
53
62
0
2
35
1.09
110462557--110462612
20
2.8
20
97
0
103
33
0
8
57
1.30
110467807--110467930
43
2.9
43
85
3
153
22
31
21
24
1.98
110469853--110469882
15
2.1
15
93
6
53
36
26
6
30
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110481087--110481156
32
2.2
32
94
0
122
31
20
24
24
1.98
110488351--110488412
28
2.2
28
82
5
72
41
14
14
29
1.85
110490040--110490102
17
3.9
17
79
6
69
63
0
3
33
1.10
110489983--110490126
48
3.0
47
77
13
136
63
0
4
31
1.20
110490038--110490102
24
2.8
22
75
17
60
63
0
3
33
1.10
110490063--110490120
29
2.0
28
83
3
71
68
1
1
27
1.08
110496757--110496909
39
3.9
39
88
0
216
23
30
21
24
1.99
110496726--110496908
78
2.3
79
89
1
269
22
29
22
24
1.99
110505043--110505088
24
1.9
24
81
0
56
73
0
17
8
1.07
110506376--110506506
29
4.5
29
78
5
122
25
17
32
25
1.97
110507955--110508044
39
2.3
39
92
0
153
23
31
20
25
1.98
110517072--110517115
17
2.5
17
88
3
61
34
0
2
63
1.07
110517072--110517118
14
3.3
14
85
8
51
34
0
2
63
1.06
110517153--110517181
15
1.9
15
100
0
58
34
0
0
65
0.93
110517293--110517496
25
8.4
24
74
18
140
33
3
4
58
1.36
110517295--110517506
23
9.0
22
77
15
128
33
3
5
58
1.38
110517294--110517496
48
4.2
48
77
14
195
33
3
4
58
1.36
110517446--110517506
20
2.9
21
80
9
79
34
4
4
55
1.43
110517462--110517508
22
2.0
22
84
8
58
34
2
4
59
1.29
110517446--110517573
50
2.4
54
74
12
133
34
4
6
54
1.46
110517646--110517680
17
2.0
18
88
5
54
28
2
2
65
1.21
110517709--110517735
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110520635--110520673
18
2.1
19
90
4
62
25
20
0
53
1.45
110520706--110520771
16
4.4
16
70
24
63
19
22
0
57
1.41
110520648--110520776
43
3.0
43
93
0
204
24
22
0
52
1.52
110521639--110521682
22
2.0
22
100
0
88
31
22
0
45
1.53
110521643--110521694
22
2.3
22
86
3
68
32
21
0
46
1.52
110525081--110525385
86
3.6
87
77
5
291
34
27
14
23
1.94
110525081--110525394
43
7.3
43
79
3
260
34
27
14
23
1.93
110525877--110525980
23
4.5
23
91
0
172
43
19
1
35
1.62
110527180--110527233
26
2.1
26
100
0
108
35
7
3
53
1.47
110529283--110529326
21
2.1
21
95
0
79
38
11
25
25
1.89
110530032--110530065
18
1.9
17
88
5
50
55
0
32
11
1.36
110530103--110530139
18
2.1
18
89
0
56
48
2
37
10
1.52
110530232--110530315
40
2.1
40
86
4
116
20
16
15
47
1.82
110530649--110530682
18
1.9
18
88
5
52
44
2
2
50
1.32
110530754--110530908
7
21.7
7
71
13
84
42
36
0
21
1.53
110530757--110530909
57
2.7
57
81
9
163
43
35
0
20
1.53
110530927--110530957
14
2.2
14
94
0
53
51
29
0
19
1.47
110531482--110531732
74
3.3
74
66
11
193
28
21
20
29
1.98
110531397--110531794
153
2.6
153
88
1
582
26
22
22
28
1.99
110531255--110531658
193
2.1
194
85
5
550
28
22
20
28
1.98
110531363--110531873
40
13.1
40
69
11
220
26
22
21
29
1.99
110531930--110531986
20
2.5
24
81
16
77
49
28
5
17
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110535905--110536012
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
110543579--110543716
37
3.7
37
93
0
222
26
31
18
23
1.98
110543887--110544072
47
4.0
47
92
0
300
26
28
11
33
1.92
110543925--110544047
22
5.3
22
64
27
67
24
30
13
31
1.94
110546976--110547083
26
4.2
26
91
2
173
36
23
7
33
1.83
110551028--110551199
93
1.8
93
94
0
308
28
29
20
20
1.98
110551021--110551196
46
3.8
46
79
12
207
29
29
20
20
1.98
110552745--110552787
21
2.0
21
86
8
61
13
2
4
79
1.00
110556689--110556736
25
2.0
24
84
11
64
64
6
0
29
1.18
110556701--110556751
17
2.8
18
78
18
61
64
5
0
29
1.17
110557241--110557267
6
4.5
6
100
0
54
18
0
37
44
1.50
110564261--110564312
20
2.4
23
75
9
56
28
7
11
51
1.65
110566788--110566881
6
15.3
6
72
16
77
47
14
19
18
1.82
110566809--110566881
31
2.4
31
97
0
137
46
15
20
17
1.84
110567003--110567106
27
3.9
26
82
6
100
38
20
22
19
1.94
110567265--110567329
22
3.0
22
80
8
78
30
23
26
20
1.98
110567717--110567992
27
10.3
26
87
5
338
26
20
18
35
1.95
110576299--110576437
33
4.2
32
75
9
111
31
5
38
24
1.77
110576463--110576493
12
2.6
12
94
0
53
25
0
45
29
1.54
110580320--110580361
22
1.9
22
85
0
57
42
0
21
35
1.53
110580821--110580947
42
3.0
42
85
1
164
33
15
21
29
1.94
110582987--110583040
27
2.0
27
96
0
99
25
20
7
46
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110589424--110589469
9
5.1
9
100
0
92
67
0
10
21
1.21
110591320--110591417
21
4.7
21
83
2
117
12
20
18
48
1.79
110591316--110591417
42
2.4
42
90
0
159
13
20
17
48
1.81
110594250--110594293
4
10.5
4
83
16
54
70
2
0
27
0.99
110596130--110596236
52
2.1
52
98
0
205
31
14
31
21
1.94
110597636--110597672
1
37.0
1
88
0
56
94
0
5
0
0.30
110607032--110607126
40
2.4
40
87
7
131
22
17
28
31
1.97
110615956--110615986
15
2.1
15
100
0
62
41
6
12
38
1.69
110619831--110619870
17
2.3
18
83
12
57
35
7
10
47
1.65
110622663--110622834
46
3.8
45
79
11
206
21
21
27
29
1.99
110622660--110622829
92
1.8
92
94
0
304
21
21
28
28
1.99
110630202--110630373
46
3.7
46
77
14
201
22
20
27
29
1.99
110630199--110630368
92
1.8
93
94
1
306
21
21
28
28
1.99
110633920--110634042
43
2.9
43
79
9
119
24
14
26
34
1.94
110635344--110635591
48
5.2
48
89
0
370
29
17
25
27
1.98
110641870--110642261
194
2.0
194
93
1
678
25
16
26
31
1.97
110642942--110643030
42
2.1
42
97
0
169
30
12
16
40
1.86
110644611--110644732
42
2.9
42
83
0
163
28
26
13
31
1.94
110648326--110648551
43
5.3
42
77
8
190
24
14
25
36
1.93
110653745--110653847
43
2.4
43
88
1
161
23
22
27
27
1.99
110658357--110658426
27
2.6
27
90
2
113
31
27
12
28
1.93
110660264--110660394
43
3.0
43
80
5
131
32
22
17
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110663086--110663146
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
110669511--110669552
10
3.9
10
85
14
57
50
28
4
16
1.66
110670235--110670404
43
4.0
43
73
9
130
32
23
17
27
1.96
110670832--110670915
37
2.3
37
95
4
152
35
20
10
33
1.87
110671798--110671838
20
2.0
20
85
9
55
17
7
4
70
1.28
110673287--110673316
14
2.1
15
93
6
53
63
13
10
13
1.52
110675631--110675669
6
6.3
6
85
5
51
79
0
2
17
0.84
110675631--110675669
19
2.1
19
90
0
60
79
0
2
17
0.84
110678596--110678718
22
5.3
22
66
24
74
37
11
26
25
1.89
110678404--110678764
141
2.6
141
86
0
472
35
11
27
25
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433