Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  2  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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4.6
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201
33
24
10
31
1.90
433393--433564
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
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1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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48
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19
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18
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2.0
20
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12
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2.0
29
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2.6
39
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5
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15
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54
5
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2.0
20
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64
0
7
2
90
0.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
30
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14
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370
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19
17
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74
14
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18
17
30
1.95
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74
1.9
75
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219
27
23
20
28
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164
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20
17
29
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209
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13
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1
1
32
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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12
10
36
1.79
594204--594238
12
2.9
12
86
0
52
28
5
25
40
1.78
600825--600852
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
602547--602587
7
5.9
7
100
0
82
58
14
0
26
1.37
607098--607127
4
7.5
4
100
0
60
23
0
0
76
0.78
611231--611269
20
2.0
20
89
0
60
43
2
7
46
1.46
613137--613220
41
2.0
41
100
0
168
52
7
4
35
1.50
614803--614856
5
10.4
5
80
6
54
50
3
3
42
1.38
614803--614836
16
2.1
16
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10
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50
0
5
44
1.26
614808--614857
21
2.4
21
81
12
59
50
6
2
42
1.38
626769--626804
16
2.2
16
90
0
54
19
2
19
58
1.52
629595--629654
29
2.1
29
96
0
111
43
21
6
28
1.78
635331--635370
20
2.2
18
86
13
55
27
0
2
70
1.01
638609--638679
21
3.3
21
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11
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45
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43
2.0
43
100
0
174
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11
4
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1.61
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22
1.9
22
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46
0
2
51
1.13
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22
2.3
20
77
16
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40
0
2
57
1.10
639892--639930
19
2.1
19
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0
60
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5
0
51
1.24
647360--647387
2
14.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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2
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2
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53
53
0
0
46
1.00
647913--647965
25
2.1
25
82
6
63
56
7
3
32
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
647926--647978
25
2.2
24
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10
63
58
9
0
32
1.30
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20
2.0
19
85
5
51
30
0
2
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1.05
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16
4.5
16
80
16
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1
41
47
1.45
649207--649272
32
2.0
34
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11
102
7
1
43
46
1.41
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3.1
131
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2
524
35
19
18
26
1.95
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17
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7
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1
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1.42
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0
6
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1.20
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17
2.4
18
77
14
54
56
9
0
34
1.31
685990--686035
20
2.2
21
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7
58
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2
6
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1.41
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17
2.0
17
94
0
59
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14
0
50
1.44
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19
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20
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1
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2.0
32
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3
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1.93
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48
2.0
48
95
0
172
26
15
17
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1.90
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2
18.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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22
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36
9
0
54
1.32
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56
2.8
55
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203
27
5
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1.76
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6
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7
50
56
0
12
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22
2.0
22
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0
68
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20
25
1.76
713484--713529
22
2.1
22
84
8
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6
1.22
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7
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7
100
0
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15
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715430--715631
31
6.5
31
87
0
269
26
24
19
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
715609--715785
50
3.5
50
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2
230
26
20
16
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1.94
718725--718883
79
2.0
77
89
2
237
30
19
20
30
1.97
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48
1.9
49
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111
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1.71
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30
2.8
29
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17
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13
2
41
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2.1
30
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2
83
21
6
18
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42
4.1
42
89
0
245
29
23
27
18
1.98
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100
0
50
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36
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100
0
50
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0
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1.50
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16
2.1
17
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5
52
55
0
2
41
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433