Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr06 132263754 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  128  of  433  ( 51894 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39257239--39257352
28
4.0
28
77
6
104
30
14
27
28
1.95
39258330--39258377
21
2.2
21
82
10
53
18
4
20
56
1.58
39265210--39265397
40
4.7
40
88
3
272
24
28
22
24
2.00
39266530--39266654
54
2.4
52
95
2
223
16
19
9
55
1.68
39268631--39268742
34
3.3
33
82
2
116
33
9
12
43
1.75
39268651--39268754
34
3.1
34
85
0
136
31
8
13
46
1.74
39271290--39271323
5
6.8
5
93
0
59
20
0
0
79
0.73
39273776--39273825
24
2.1
24
92
0
82
54
12
8
26
1.64
39275138--39275227
28
3.4
28
87
9
134
35
13
24
26
1.92
39275251--39275449
51
3.9
51
87
1
292
31
14
25
29
1.94
39282388--39282430
20
2.2
20
100
0
86
32
13
13
39
1.85
39283584--39283617
3
11.3
3
100
0
68
0
32
0
67
0.91
39295335--39295402
15
4.4
15
74
18
59
45
0
1
52
1.09
39295421--39295457
16
2.3
16
86
13
58
40
0
0
59
0.97
39295469--39295525
22
2.7
22
84
7
66
52
0
0
47
1.00
39296227--39296280
28
1.9
28
81
7
65
29
20
0
50
1.49
39301574--39301746
43
4.0
42
72
14
156
22
19
26
32
1.97
39303262--39303341
39
2.0
41
85
4
110
31
15
20
33
1.93
39305765--39305793
15
1.9
15
100
0
58
55
0
0
44
0.99
39308386--39308607
120
1.8
119
84
3
302
28
16
22
31
1.96
39308525--39308716
91
2.1
91
89
1
287
26
15
23
34
1.95
39308616--39309085
132
3.5
132
87
4
606
26
16
23
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39309505--39309572
29
2.3
29
85
5
93
22
1
29
47
1.60
39309505--39309612
15
7.5
13
72
14
54
20
2
31
45
1.65
39312243--39312275
15
2.1
16
88
5
50
0
15
3
81
0.80
39312342--39312392
26
2.0
26
84
0
66
39
3
5
50
1.45
39314743--39314910
41
4.1
41
73
10
119
27
29
21
21
1.98
39314757--39314902
41
3.6
41
81
7
165
27
28
21
21
1.99
39321230--39321259
14
2.1
14
93
0
51
3
6
23
66
1.30
39325512--39325931
38
11.4
38
71
11
169
31
21
12
35
1.91
39325439--39325947
35
14.0
35
69
12
204
30
20
13
35
1.91
39326497--39326530
2
17.5
2
93
6
61
52
0
0
47
1.00
39328521--39328685
43
3.8
44
76
12
164
23
15
27
33
1.95
39329326--39329378
22
2.5
22
75
12
56
30
1
24
43
1.65
39334533--39334618
43
2.0
43
100
0
172
51
6
18
23
1.70
39344519--39344671
48
3.3
45
77
9
123
26
19
30
23
1.98
39344639--39344769
50
2.7
49
82
7
149
25
19
29
25
1.98
39347276--39347697
210
2.0
210
97
0
790
37
15
5
40
1.71
39358609--39358641
13
2.4
14
90
5
50
60
0
0
39
0.97
39363640--39363676
18
2.1
18
85
14
51
32
0
8
59
1.27
39365178--39365286
54
2.0
54
98
0
209
29
12
20
37
1.90
39365266--39365346
40
2.0
40
97
0
153
39
9
20
29
1.85
39366264--39366304
21
2.0
21
85
0
55
34
7
17
41
1.77
39375960--39376004
6
7.5
6
84
0
54
46
2
33
17
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39378204--39378265
26
2.4
26
94
0
106
38
16
6
38
1.74
39388807--39388831
13
1.9
13
100
0
50
24
36
32
8
1.84
39395066--39395112
22
2.1
22
96
0
85
46
8
12
31
1.72
39404828--39404921
29
3.2
29
98
0
179
26
27
15
29
1.96
39404791--39404921
58
2.3
58
85
5
167
25
31
16
25
1.97
39408231--39408358
64
2.0
64
89
3
195
30
18
14
35
1.91
39412832--39412989
81
2.0
81
97
0
298
37
19
16
25
1.92
39413867--39413893
7
3.9
7
100
0
54
70
0
0
29
0.88
39417462--39417534
36
2.0
36
100
0
146
31
10
13
43
1.79
39427226--39427330
47
2.2
47
82
1
129
33
27
14
24
1.94
39434287--39434311
12
2.1
12
100
0
50
36
24
0
40
1.55
39434299--39434456
49
3.4
50
82
16
198
29
29
7
33
1.85
39434136--39434456
47
6.7
49
79
16
332
28
30
7
32
1.85
39434240--39434393
49
2.8
59
88
10
220
30
29
7
31
1.86
39434352--39434429
39
2.0
39
100
0
156
25
33
10
30
1.89
39434195--39434393
108
1.9
106
94
2
344
29
30
8
32
1.86
39442202--39442323
43
2.9
42
80
4
138
31
25
13
29
1.94
39447647--39447692
20
2.3
20
84
0
65
52
2
13
32
1.52
39451424--39451530
42
2.5
42
80
0
124
25
28
17
28
1.98
39453129--39453227
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
39460811--39460909
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
39466825--39467005
40
4.6
41
88
5
257
25
26
23
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39467520--39467549
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
39468443--39468485
14
3.1
14
80
6
52
58
9
2
30
1.42
39468443--39468481
13
2.9
13
84
3
51
58
10
2
28
1.44
39477748--39477848
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
39477748--39477898
40
3.8
40
84
4
180
28
22
25
23
1.99
39477744--39477915
40
4.4
38
77
10
161
29
21
26
23
1.99
39480541--39480581
20
2.0
20
85
0
55
29
21
24
24
1.99
39482134--39482287
35
4.4
35
72
9
107
44
18
8
28
1.79
39483022--39483078
30
1.9
30
85
7
80
19
14
5
61
1.51
39490318--39490478
35
4.6
35
75
0
160
41
19
8
31
1.80
39492091--39492174
42
2.0
42
97
0
159
30
20
14
34
1.92
39507395--39507449
22
2.5
22
90
0
92
36
27
21
14
1.93
39512493--39512593
40
2.5
40
93
3
177
25
28
22
22
1.99
39519587--39519684
40
2.5
40
86
5
128
22
28
23
25
1.99
39522942--39522966
13
1.9
13
100
0
50
32
0
16
52
1.44
39528155--39528185
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
39532951--39533028
35
2.2
35
97
0
147
26
17
15
39
1.90
39533383--39533499
49
2.4
49
85
5
157
23
25
20
29
1.99
39534358--39534396
20
2.0
20
85
10
53
35
20
0
43
1.52
39541855--39541879
12
2.1
12
100
0
50
40
24
16
20
1.91
39542025--39542078
20
2.7
20
85
0
72
33
16
18
31
1.93
39542126--39542186
30
2.0
30
93
0
104
37
4
18
39
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39542630--39542709
39
2.1
39
97
0
151
35
13
10
41
1.78
39545682--39545731
6
8.3
6
97
0
82
50
12
0
38
1.40
39546116--39546174
24
2.6
23
76
13
59
37
0
3
59
1.14
39547857--39547972
55
2.1
56
82
10
141
58
1
1
37
1.18
39548171--39548275
20
5.3
20
69
21
69
39
2
1
56
1.25
39548425--39548467
22
2.0
23
86
9
63
30
0
16
53
1.43
39548324--39548523
88
2.2
89
79
9
203
38
7
14
39
1.74
39549103--39549254
79
1.9
79
87
6
223
56
7
6
29
1.52
39552427--39552457
3
10.3
3
100
0
62
67
0
0
32
0.91
39553568--39554087
194
2.8
189
90
3
811
41
21
11
25
1.86
39557462--39557516
22
2.5
21
77
13
58
38
3
1
56
1.28
39561831--39561916
28
3.1
28
100
0
172
39
17
17
25
1.91
39562154--39562276
49
2.5
49
85
0
156
24
11
30
34
1.90
39567222--39567308
37
2.3
36
94
5
147
26
33
19
20
1.97
39567377--39567835
49
9.4
49
94
0
684
29
29
9
31
1.88
39567615--39567695
27
3.2
27
61
16
64
29
28
7
34
1.84
39578020--39578225
40
5.2
40
82
5
233
24
21
28
25
1.99
39586121--39586341
40
5.5
40
90
1
300
25
23
28
23
2.00
39586121--39586369
120
2.1
120
83
4
306
25
22
27
24
2.00
39590828--39591007
48
3.8
47
83
1
216
23
29
19
27
1.98
39590827--39591007
96
1.9
96
87
2
265
23
29
19
27
1.98
39593242--39593329
24
3.6
24
86
7
108
25
31
15
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39593266--39593352
24
3.6
24
85
0
102
25
32
18
24
1.97
39601827--39601962
48
2.8
48
84
2
175
21
30
20
27
1.98
39601827--39602001
48
3.7
47
77
10
149
21
30
21
26
1.98
39605891--39605936
23
2.0
23
100
0
92
39
8
8
43
1.66
39606573--39606598
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
39607658--39607686
10
3.0
10
95
5
51
72
0
0
27
0.85
39608599--39608654
16
3.5
16
75
0
58
39
5
26
28
1.78
39608839--39608961
58
2.1
58
86
3
167
53
4
0
42
1.19
39612318--39612360
16
2.5
17
85
7
52
51
0
2
46
1.13
39612324--39612382
21
2.8
21
82
10
68
55
0
1
42
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433