Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          433   

This is table  213  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66338437--66338539
30
3.5
30
71
6
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33
16
24
26
1.96
66345013--66345039
10
2.7
10
100
0
54
18
11
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40
1.85
66353969--66354013
24
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82
13
56
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1.80
66358900--66359002
29
3.6
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116
21
16
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1.95
66367950--66368032
30
2.8
30
77
12
82
28
22
15
32
1.95
66370081--66370147
20
3.3
20
64
12
55
29
32
14
22
1.94
66370059--66370148
41
2.2
41
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0
162
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25
1.93
66370985--66371009
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1.9
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100
0
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2.1
23
100
0
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29
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31
1.87
66375587--66375683
30
3.2
30
73
2
97
28
14
28
27
1.95
66378554--66378610
11
5.4
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8
64
80
5
3
10
0.98
66392012--66392051
19
2.1
19
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0
53
25
35
17
22
1.95
66395501--66395540
14
2.9
13
88
7
53
10
35
7
47
1.65
66396350--66396446
30
3.2
30
71
4
88
28
25
14
30
1.95
66398249--66398276
13
2.2
13
100
0
56
28
0
14
57
1.38
66399678--66399840
40
4.1
40
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23
20
28
28
1.99
66399678--66399840
79
2.1
79
89
2
247
23
20
28
28
1.99
66409196--66409285
30
3.0
30
70
12
78
26
24
16
32
1.96
66411335--66411417
30
2.7
30
81
9
89
13
21
1
63
1.35
66411368--66411423
18
3.1
18
76
5
51
7
19
3
69
1.27
66411393--66411417
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
66411420--66411450
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66411498--66411561
16
4.2
14
77
16
65
4
18
1
75
1.06
66412471--66412519
10
4.6
11
76
16
50
14
4
8
73
1.21
66412483--66412519
10
3.7
10
92
7
58
13
2
8
75
1.13
66414230--66414326
30
3.2
30
70
8
81
27
14
28
28
1.95
66414709--66414739
14
2.2
14
94
0
53
22
32
0
45
1.53
66419113--66419193
30
2.8
29
81
11
94
11
20
2
65
1.36
66419259--66419320
15
4.2
14
80
10
70
4
17
1
75
1.05
66419259--66419313
15
3.7
15
83
9
76
3
18
1
76
1.02
66420149--66420201
12
4.7
11
81
11
54
16
1
7
73
1.15
66420148--66420203
11
4.9
11
86
6
76
17
1
8
71
1.21
66420150--66420200
23
2.3
21
90
6
75
17
1
7
72
1.18
66421906--66422002
30
3.2
30
70
8
81
27
14
28
28
1.95
66422366--66422424
14
4.2
14
78
8
57
20
33
6
38
1.79
66432442--66432478
15
2.5
15
95
4
67
10
5
8
75
1.17
66435009--66435056
15
3.3
15
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53
29
0
27
43
1.55
66435003--66435046
14
3.1
14
74
6
52
27
0
34
38
1.57
66435003--66435062
29
2.1
29
93
0
102
28
0
30
41
1.56
66436045--66436089
14
3.3
14
78
6
56
48
15
0
35
1.45
66438569--66438614
18
2.6
18
82
0
56
13
26
0
60
1.32
66438540--66438617
24
3.2
24
76
7
86
12
26
0
60
1.33
66439911--66439958
15
3.3
15
73
5
53
29
0
27
43
1.55
66439905--66439948
14
3.1
14
74
6
52
27
0
34
38
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66439905--66439964
29
2.1
29
93
0
102
28
0
30
41
1.56
66440948--66440992
14
3.3
14
78
6
56
48
15
0
35
1.45
66443654--66443750
30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
66445719--66445816
30
3.3
30
75
0
97
27
26
16
29
1.97
66446861--66446900
19
2.1
19
85
0
53
25
35
17
22
1.95
66449069--66449116
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3.4
14
85
0
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43
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31
18
1.75
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21
3.2
19
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1
17
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1.03
66453442--66453498
5
11.0
5
76
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53
1
17
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77
1.00
66453440--66453509
20
3.3
20
77
18
72
1
18
4
75
1.04
66454412--66454460
11
4.7
11
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9
59
10
8
8
73
1.25
66457748--66457795
14
3.4
14
85
0
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43
6
31
18
1.75
66462827--66462851
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1.9
13
100
0
50
28
0
8
64
1.22
66464526--66464584
14
4.2
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8
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20
32
6
40
1.78
66471714--66471740
10
2.7
10
100
0
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40
29
11
18
1.85
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1.19
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1.95
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310
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18
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1.95
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25
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17
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1.85
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27
28
15
27
1.96
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14
3.3
14
84
6
65
48
13
0
37
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66500920--66500989
22
3.3
22
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28
60
38
14
11
35
1.82
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42
3.5
42
95
0
260
39
12
13
34
1.82
66500901--66500967
20
3.2
20
67
29
59
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8
14
35
1.78
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21
3.6
21
67
22
50
6
20
2
70
1.23
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2.7
13
95
0
61
8
5
2
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0.91
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14
3.3
14
84
6
65
48
13
0
37
1.42
66507531--66507636
42
2.5
42
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1
194
41
14
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32
1.82
66511711--66511757
20
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20
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0
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1.94
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14
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14
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0
35
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28
28
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0
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3
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0
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3
0.83
66522309--66522378
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1
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2
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1.80
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2.1
12
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0
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0
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3.1
18
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3
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1.27
66522457--66522538
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2.7
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1
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12
1.33
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2.9
30
70
6
79
28
28
14
28
1.95
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14
3.3
14
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48
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0
35
1.45
66537688--66537736
21
2.4
20
86
3
62
16
22
20
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66540583--66540644
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3
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1
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14
77
15
66
76
4
17
1
1.02
66540583--66540644
5
12.0
5
79
16
65
77
3
17
1
0.98
66540587--66540644
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1.9
30
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10
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3
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2.6
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100
0
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1.38
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2.0
37
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27
28
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100
0
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0
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1.8
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20
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1.98
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201
28
28
20
21
1.98
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2.0
30
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0
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20
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1.98
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1.8
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28
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1.98
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28
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1.14
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30
3.2
30
76
2
97
28
16
26
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66589782--66589829
14
3.4
14
85
0
60
18
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1.75
66591711--66591796
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2.9
30
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1
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1.37
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0
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0
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1.13
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0
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1.03
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0
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21
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2
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0.95
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0
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0
9
9
81
0.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          433