Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  398  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123573668--123573775
40
2.7
38
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8
128
21
29
25
23
1.99
123582930--123582990
24
2.5
24
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5
79
21
16
27
34
1.95
123588392--123588432
22
1.9
21
85
5
55
48
14
4
31
1.65
123589038--123589083
24
1.9
24
86
8
67
43
23
13
19
1.86
123594416--123594556
27
5.2
27
80
11
173
19
24
21
34
1.97
123594413--123594556
54
2.7
54
92
4
229
18
25
22
34
1.96
123594416--123594574
81
2.0
80
82
8
198
20
25
20
33
1.97
123602376--123602480
27
3.9
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135
19
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21
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2.0
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0
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0
105
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0
0
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1.00
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2.6
29
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0
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27
14
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27
1.95
123613647--123613722
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
123613590--123613722
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
123621461--123621534
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
123621518--123621592
28
2.6
28
78
2
87
22
20
36
21
1.96
123621461--123621592
58
2.3
57
80
3
131
25
17
33
24
1.96
123628396--123628997
119
5.0
120
89
2
913
33
17
18
30
1.94
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241
2.5
241
93
0
1040
33
17
19
30
1.94
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20
2.8
20
83
11
67
37
3
0
58
1.16
123630975--123631017
20
2.2
19
88
12
61
39
0
2
58
1.11
123631407--123631465
30
2.0
30
89
0
91
30
8
3
57
1.45
123634689--123634768
41
2.0
41
94
0
142
46
1
17
35
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123645956--123646003
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17
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0
60
6
60
4
29
1.40
123646306--123646363
30
1.9
31
89
3
91
22
3
5
68
1.24
123656458--123656494
19
1.9
19
88
0
56
64
0
8
27
1.21
123659255--123659330
38
2.0
38
97
0
143
35
15
19
28
1.93
123662362--123662393
16
2.0
16
100
0
64
18
25
12
43
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123679081--123679126
8
5.5
8
80
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58
0
0
41
0.98
123679081--123679126
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2.7
18
83
16
62
58
0
0
41
0.98
123679081--123679133
26
2.0
26
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0
70
60
1
0
37
1.08
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2
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0
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0
0
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1.00
123682952--123683014
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44
7
0
47
1.32
123682937--123683013
23
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20
75
20
75
44
5
0
50
1.24
123683098--123683126
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
123683230--123683266
14
2.5
15
83
16
51
29
5
0
64
1.15
123683675--123683708
16
2.1
17
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5
52
23
11
8
55
1.63
123695068--123695288
119
1.9
119
91
1
363
33
16
19
30
1.94
123695224--123695547
83
3.9
83
90
0
486
33
18
19
28
1.96
123695586--123695773
83
2.3
82
87
2
286
36
14
19
29
1.92
123697357--123697417
22
2.9
23
79
13
60
42
6
1
49
1.38
123697342--123697417
22
3.5
22
74
10
59
42
5
1
51
1.33
123697453--123697524
25
2.9
25
77
6
67
33
5
1
59
1.29
123697625--123697665
4
9.5
4
87
12
55
26
2
0
70
0.99
123698073--123698106
16
2.1
17
88
5
52
23
11
8
55
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123698920--123698958
14
2.8
14
92
0
60
41
7
23
28
1.82
123699991--123700024
6
5.5
6
93
6
59
82
0
2
14
0.79
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3
24.3
3
97
2
137
65
0
0
34
0.93
123716289--123716358
6
11.7
6
73
14
56
20
1
4
74
1.07
123717942--123718099
43
3.7
42
73
11
142
31
24
18
25
1.98
123718480--123718509
8
3.6
8
95
4
51
60
26
0
13
1.34
123723112--123723150
20
2.0
20
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0
51
28
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5
64
1.28
123724503--123724564
6
10.3
6
81
10
65
14
3
11
70
1.27
123726432--123726565
26
5.2
26
92
0
214
32
8
23
35
1.86
123728411--123728475
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2.0
32
84
6
85
27
16
24
30
1.97
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5.2
5
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0
52
19
0
0
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0
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17
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1.96
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15
2.1
15
93
0
53
48
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1.80
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20
0
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12
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12
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0
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24
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55
2.4
55
80
5
138
16
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27
30
1.96
123793034--123793201
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4.2
40
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1
167
25
27
22
25
2.00
123793034--123793201
80
2.1
80
82
6
198
25
27
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.93
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5
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1.13
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0
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2
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0
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0
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7
141
25
17
24
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123859081--123859237
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2.2
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0
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29
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1.96
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2
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1.9
18
94
5
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58
5
8
26
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.28
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0
0
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0
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31
0
34
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433