Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  386  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120456561--120456654
32
2.9
32
98
0
179
45
2
0
52
1.12
120456561--120456716
64
2.6
60
81
14
155
45
2
1
50
1.23
120457658--120457707
21
2.5
21
83
6
68
30
16
20
34
1.94
120459110--120459156
19
2.5
19
100
0
94
17
29
36
17
1.92
120459640--120459730
38
2.4
38
100
0
182
20
12
36
30
1.89
120465758--120465801
22
2.0
22
100
0
88
36
18
9
36
1.82
120466157--120466181
13
1.9
13
100
0
50
32
16
12
40
1.84
120467256--120467312
20
2.9
20
87
7
73
36
0
3
59
1.14
120467265--120467326
20
3.0
20
83
9
70
43
0
1
54
1.09
120467278--120467326
23
2.3
20
83
13
62
48
0
0
51
1.00
120467425--120467463
14
2.9
14
88
3
62
53
0
7
38
1.30
120467410--120467524
34
3.3
34
80
16
119
53
0
3
42
1.17
120467475--120467522
22
2.1
23
92
3
80
54
0
2
43
1.12
120471576--120471605
12
2.5
12
94
0
51
50
0
3
46
1.18
120472993--120473148
42
3.7
42
85
5
190
28
27
14
28
1.95
120473036--120473191
42
3.6
43
86
5
181
28
27
14
28
1.95
120472991--120473160
84
2.0
84
83
6
211
29
27
14
28
1.95
120473035--120473243
47
4.7
46
80
12
186
29
26
15
28
1.96
120473267--120473415
31
4.8
30
85
4
199
25
26
20
28
1.99
120473391--120473518
50
2.5
51
88
3
188
25
21
18
34
1.96
120475980--120476051
34
2.1
34
100
0
144
27
19
13
38
1.90
120476044--120476110
32
2.1
32
100
0
134
28
0
17
53
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120477534--120477764
3
76.7
3
84
9
269
65
0
3
31
1.08
120478433--120478463
14
2.2
14
94
0
53
83
0
9
6
0.79
120479171--120479386
44
4.8
44
69
16
163
26
24
20
28
1.99
120479157--120479654
143
3.5
143
84
3
695
27
23
19
30
1.98
120479548--120479655
45
2.4
45
78
4
121
23
24
22
30
1.99
120479548--120479670
44
2.8
44
75
3
113
24
24
21
29
1.99
120480493--120480524
12
2.6
13
85
14
50
0
15
0
84
0.63
120480914--120480957
3
14.7
3
100
0
88
31
0
0
68
0.90
120481245--120481287
20
2.2
19
83
4
50
44
9
20
25
1.81
120483455--120483513
29
2.0
29
96
0
109
30
11
10
47
1.73
120483907--120484111
3
68.7
3
76
9
170
62
0
5
31
1.23
120483936--120484111
54
3.3
54
84
4
214
62
0
5
31
1.21
120484780--120484813
13
2.6
13
90
9
52
85
0
8
5
0.75
120485124--120485163
20
2.0
20
90
0
62
22
22
47
7
1.76
120485584--120485720
42
3.3
42
86
0
175
15
21
18
44
1.86
120485588--120485699
21
5.3
21
72
0
98
15
23
16
44
1.86
120485642--120485710
21
3.3
21
79
0
75
14
21
20
43
1.87
120486195--120486664
230
2.0
230
99
0
931
31
4
24
40
1.76
120489994--120490049
23
2.3
22
82
14
58
58
0
3
37
1.15
120492312--120492351
18
2.1
19
86
13
55
35
0
2
62
1.09
120494357--120494402
19
2.4
20
85
7
69
41
4
0
54
1.20
120494820--120494872
28
2.0
27
85
10
74
39
7
3
49
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120502287--120502326
20
2.0
20
85
0
53
40
2
15
42
1.60
120504285--120504363
36
2.2
36
82
4
90
55
8
16
18
1.66
120505122--120505171
24
2.1
24
100
0
100
46
8
16
30
1.75
120505935--120505968
16
2.3
15
90
10
52
79
5
2
11
1.02
120507874--120507919
15
3.1
15
100
0
92
19
6
19
54
1.66
120508662--120508711
24
2.1
24
100
0
100
46
8
16
30
1.75
120514363--120514391
6
5.0
6
91
8
51
0
17
13
68
1.20
120514846--120514882
1
37.0
1
100
0
74
0
0
0
100
0.00
120516649--120516801
9
15.8
9
66
20
69
30
3
2
63
1.26
120516650--120516711
19
3.3
19
82
13
74
24
0
3
72
0.99
120516651--120516724
20
3.8
19
80
8
78
22
2
2
71
1.11
120516651--120516723
29
2.5
28
82
10
83
21
2
2
72
1.10
120517202--120517230
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
120519283--120519325
19
2.3
19
88
4
61
37
2
0
60
1.10
120519278--120519327
20
2.5
20
81
12
59
42
2
0
56
1.11
120526253--120526277
6
4.2
6
100
0
50
16
0
0
84
0.63
120526796--120526842
19
2.5
19
100
0
94
51
0
4
44
1.21
120526763--120526873
19
5.8
19
78
7
64
60
4
2
32
1.31
120527081--120527190
29
3.8
28
77
9
105
33
6
0
60
1.22
120527079--120527197
27
4.1
30
76
14
108
32
5
0
61
1.20
120527079--120527237
30
5.4
29
72
14
105
32
5
0
61
1.19
120527157--120527201
18
2.4
19
81
11
56
33
2
0
64
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120529958--120529986
15
1.9
15
100
0
58
44
0
27
27
1.54
120531267--120531323
26
2.2
26
100
0
114
43
24
0
31
1.54
120533570--120533598
15
1.9
15
100
0
58
24
0
34
41
1.55
120534835--120534995
53
3.3
49
76
10
150
26
14
27
31
1.95
120538487--120538528
15
2.6
17
82
17
54
35
0
0
64
0.94
120542307--120542364
30
1.9
30
89
0
89
37
10
5
46
1.60
120544664--120544713
23
2.1
24
85
3
66
68
2
6
24
1.23
120545738--120545772
6
5.8
6
90
10
54
82
0
17
0
0.66
120557884--120557939
26
2.2
26
93
0
94
37
25
5
32
1.78
120561949--120562053
18
5.5
18
69
12
57
15
24
24
35
1.94
120561951--120562051
39
2.6
39
91
0
166
13
25
23
36
1.92
120562721--120562778
28
2.2
26
81
12
64
68
3
3
24
1.20
120564501--120564874
185
2.0
185
90
2
590
30
17
10
41
1.83
120571551--120571624
35
2.1
34
82
7
87
45
4
5
44
1.45
120573796--120573830
2
18.0
2
94
5
63
51
0
0
48
1.00
120573944--120573975
12
2.6
12
95
5
55
68
6
0
25
1.12
120577041--120577171
38
3.4
38
82
0
154
38
29
19
12
1.89
120582243--120582273
16
1.9
16
93
0
53
70
9
9
9
1.33
120583516--120583558
23
1.9
23
85
4
61
39
6
13
39
1.72
120584280--120584350
29
2.3
31
83
11
85
29
14
19
36
1.91
120588714--120588746
14
2.4
14
90
10
50
57
0
6
36
1.23
120592237--120592283
3
15.7
3
100
0
94
68
0
0
31
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120603437--120603472
17
2.1
17
94
0
63
80
0
0
19
0.71
120609352--120609392
14
2.9
14
89
7
57
78
7
9
4
1.10
120611037--120611087
25
2.0
27
84
7
70
33
0
1
64
1.05
120611533--120611666
60
2.2
61
85
4
182
32
0
11
55
1.42
120612457--120612938
219
2.3
208
88
4
714
39
10
7
43
1.67
120615179--120615263
33
2.6
33
82
0
107
11
47
16
24
1.80
120622369--120622414
19
2.2
20
85
11
58
4
28
0
67
1.10
120633747--120633804
22
2.7
21
82
15
57
17
13
1
67
1.32
120633850--120633891
22
1.9
22
85
0
57
26
2
7
64
1.32
120634633--120634668
2
17.0
2
88
11
54
47
5
0
47
1.25
120635389--120635429
19
2.2
19
100
0
82
46
0
4
48
1.23
120635784--120635826
19
2.2
19
91
4
68
27
4
0
67
1.10
120637301--120637428
25
5.1
25
78
1
114
35
18
16
28
1.93
120637324--120637428
25
4.2
25
80
4
131
37
15
17
30
1.90
120637900--120637948
23
2.1
23
92
0
80
24
26
8
40
1.83
120639622--120639665
19
2.2
19
88
8
61
59
11
2
27
1.44
120642665--120642717
24
2.2
24
96
3
99
52
20
3
22
1.62
120653816--120653856
4
10.2
4
94
0
64
24
4
24
46
1.72
120658430--120658597
40
4.2
40
77
3
151
22
26
23
27
2.00
120665997--120666035
16
2.4
16
95
0
69
17
5
43
33
1.72
120666419--120666586
40
4.2
40
77
3
151
22
26
23
27
2.00
120669469--120669523
25
2.2
26
83
9
69
61
7
5
25
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120669726--120669752
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
120671542--120671628
30
2.9
30
77
1
95
33
19
13
33
1.91
120678841--120678887
17
2.8
17
84
9
60
51
4
17
27
1.64
120678951--120679156
53
3.9
52
78
6
198
35
16
22
25
1.94
120679975--120680032
20
2.9
20
97
0
107
12
31
36
20
1.89
120680514--120680550
13
2.8
13
91
4
56
51
21
0
27
1.48
120681978--120682019
21
2.0
21
90
0
66
16
9
0
73
1.08
120682136--120682205
3
23.7
3
91
8
117
65
0
1
32
1.01
120685573--120685615
5
8.4
5
85
14
61
79
0
2
18
0.85
120685573--120685615
16
2.8
15
86
6
59
79
0
2
18
0.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433