Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  46  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12440536--12440621
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0
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3.7
40
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201
34
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1.99
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24
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232
26
21
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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2.1
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20
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19
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1.96
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93
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28
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2.0
16
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53
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6
34
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12564277--12564417
27
5.2
27
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171
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18
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12564259--12564420
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1.96
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29
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0.60
12633356--12633474
56
2.2
53
83
7
150
21
31
1
45
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12639955--12640000
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14
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14
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19
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10
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17
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16
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11
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18
6
12
63
1.48
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2.0
41
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0
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43
1.75
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4
72
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15
1.85
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52
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0
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30
27
9
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1.89
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21
2.8
21
78
0
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1.87
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42
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4
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43
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23
16
1.88
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29
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23
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15
29
1.95
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58
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1.96
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44
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0
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18
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1.95
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23
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1.94
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24
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1.98
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25
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25
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1.96
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24
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200
27
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21
28
1.99
12698832--12698973
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27
22
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28
1.99
12698831--12698974
71
2.0
72
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4
220
27
22
21
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1.99
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20
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33
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25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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1.64
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3
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22
22
25
1.99
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17
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0
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1.98
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1.98
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23
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1.71
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1.73
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1.98
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1.95
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1.97
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2.0
33
96
0
123
18
46
12
22
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12785368--12785550
39
4.6
39
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0
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30
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1.99
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25
1.96
12788385--12788516
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15
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1.96
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40
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1.99
12791742--12791909
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26
27
22
23
1.99
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93
93
0
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21
1.99
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28
28
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1.98
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1.99
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22
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1.99
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2.0
135
89
0
420
37
19
10
32
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433