Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  96  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29189824--29189882
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2.0
30
100
0
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20
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16
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30
1.96
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3.2
40
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2
172
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29
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1.99
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39
2.8
39
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145
23
25
28
22
1.99
29204286--29204411
40
3.2
38
84
10
155
22
24
29
23
1.99
29212678--29212837
29
5.5
30
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8
222
27
25
13
33
1.94
29212678--29212837
59
2.8
57
89
4
223
27
25
13
33
1.94
29227448--29227595
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3.5
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18
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0
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0
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50
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3.0
29
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1
140
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14
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4.5
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85
0
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16
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2.5
16
91
0
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17
25
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42
1.88
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2.9
29
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1
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16
83
0
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11
20
20
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2.1
61
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4
159
45
11
2
40
1.52
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39
5.7
39
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25
22
26
25
2.00
29250297--29250517
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2.8
78
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8
259
25
23
26
24
2.00
29250349--29250552
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2.6
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11
223
26
22
26
24
2.00
29262141--29262363
40
5.6
39
86
6
265
25
21
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29266958--29266988
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2.1
15
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0
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12
12
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29269571--29269611
21
1.9
22
85
14
59
56
4
7
31
1.48
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11
6.0
11
69
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50
58
8
0
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1.29
29270189--29270240
21
2.4
22
83
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70
57
9
1
30
1.42
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44
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18
23
21
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2.3
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22
21
21
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1.96
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1.9
130
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316
20
19
23
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1.95
29272414--29272667
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165
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18
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3.1
9
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0
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21
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21
26
25
2.00
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5.2
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199
26
22
26
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2.00
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2.0
21
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58
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1.38
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2
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0
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0
0
46
1.00
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17
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100
0
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19.6
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67
15
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63
3
2
30
1.24
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35
2.0
35
82
5
86
59
2
0
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1.12
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39
2.5
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75
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3
27
1.26
29299580--29299697
28
4.1
29
72
16
95
65
3
3
27
1.25
29299618--29299725
29
3.8
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10
94
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2
5
30
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90
2.4
88
87
5
303
32
9
21
36
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29300077--29300285
87
2.4
88
87
4
298
32
9
21
37
1.85
29308282--29308366
37
2.3
37
83
0
107
20
12
24
42
1.87
29313773--29313823
26
2.0
26
96
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93
19
15
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54
1.68
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19
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19
75
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2
4
31
1.28
29314506--29314560
20
2.7
21
77
8
60
63
1
5
29
1.27
29314496--29314636
10
14.2
10
68
14
53
61
2
4
30
1.31
29314464--29314598
29
4.6
29
73
15
109
59
2
2
34
1.28
29314586--29314630
21
2.1
21
84
8
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62
2
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28
1.33
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35
1
0
62
1.06
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0
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200
19
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18
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100
0
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1.83
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21
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0
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Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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30
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433