Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  418  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128210116--128210208
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46
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0
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1.31
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2.3
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0
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2.1
35
100
0
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16
2.0
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0
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0
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128226372--128226437
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30
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129
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22
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2.2
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0
100
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1.9
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64
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2
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2.4
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111
26
29
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22
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0
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3
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1.35
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2.3
17
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0
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30
5
5
58
1.41
128283993--128284190
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2.0
99
87
3
283
33
17
14
34
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
24
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34
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3
61
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26
2.3
27
80
2
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4
45
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2.1
16
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6
12
60
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2.7
205
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21
28
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2.0
45
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32
12
26
28
1.92
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16
2.1
16
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50
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6
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5
5
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1.45
128310316--128310387
35
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33
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7
90
22
18
6
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1.68
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15
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6
0
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25
7
0
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2
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4.4
177
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19
21
27
1.97
128317989--128318075
44
2.0
45
82
11
108
35
16
22
25
1.94
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45
2.2
45
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124
31
18
21
27
1.97
128318407--128319589
88
13.5
87
77
9
929
33
19
22
23
1.97
128318635--128318735
50
2.0
50
88
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148
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17
25
1.93
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131
3.1
133
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4
569
35
19
21
24
1.96
128318411--128319321
44
20.7
44
63
16
178
34
19
22
24
1.97
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18
1.9
18
88
11
54
11
8
22
57
1.61
128325588--128325697
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
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24
2.0
24
100
0
98
36
24
16
22
1.94
128331341--128331450
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128332210--128332283
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2.6
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10
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27
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0
64
1.21
128332190--128332333
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3.3
43
78
11
125
27
7
0
64
1.25
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14
7.1
15
70
21
69
26
6
0
66
1.23
128332187--128332302
20
6.2
20
69
22
74
26
6
0
65
1.23
128332250--128332304
17
3.4
16
82
14
60
27
7
0
65
1.19
128332239--128332313
20
3.9
20
77
13
61
29
8
0
62
1.23
128332207--128332317
37
3.0
37
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22
88
28
7
0
63
1.20
128335521--128335587
31
2.2
31
89
5
100
35
13
11
38
1.82
128343919--128343980
29
2.1
30
91
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101
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4
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1.53
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4
14
18
1.49
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7.7
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21
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27
1.98
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13
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20
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28
22
23
25
1.99
128358593--128358663
36
2.0
35
86
2
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42
15
16
25
1.88
128366474--128366527
28
2.0
28
88
3
83
38
22
24
14
1.91
128366493--128366565
36
2.0
37
89
2
112
35
28
20
15
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.2
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0
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2.6
44
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2
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35
13
22
27
1.92
128371724--128371857
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
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44
2.6
44
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2
149
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13
22
27
1.92
128377867--128378000
46
3.0
45
82
4
153
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14
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26
1.93
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0
110
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0
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1.94
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54
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1.94
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0
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1.93
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2.1
19
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0
0
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0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.4
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28
9
0
62
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
66
70
2
6
22
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433