Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr06 132263754 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  393  of  433  ( 51894 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122092022--122092182
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181
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4
5
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3.0
139
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0
739
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10
28
1.79
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28
2.1
28
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6
66
30
16
5
47
1.69
122104045--122104103
29
2.1
28
81
9
66
30
16
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1.69
122110034--122110098
25
2.6
26
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73
10
9
1
78
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2.4
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100
0
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11
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30
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122114793--122115011
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5.4
41
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322
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24
21
16
1.94
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0
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2.0
46
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0
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30
2
25
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18.1
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72
7
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21
0
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2.2
24
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12
58
58
1
1
38
1.20
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6.1
44
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8
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27
20
24
27
1.99
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128
2.2
128
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386
26
20
24
28
1.99
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2.1
16
100
0
68
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5
50
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120
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15
25
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221
2.0
221
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0
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2.0
557
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122139005--122139041
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5.6
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59
0
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1.35
122139009--122139047
20
2.0
20
94
0
69
58
0
25
15
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
18
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1
0
31
1.03
122143174--122143215
9
4.8
9
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52
61
2
0
35
1.09
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30
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87
40
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7
44
1.62
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65
2.0
65
100
0
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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2.0
17
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17
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44
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2.0
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26
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2.9
279
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20
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23
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13
52
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4
18
27
1.68
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14
2.0
15
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6
51
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0
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6
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0
2
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2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
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170
2.0
171
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28
16
18
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1.93
122184406--122184565
43
3.8
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7
137
28
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1.93
122191870--122192023
43
3.6
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181
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2.0
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113
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6
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4.2
26
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33
5
24
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2.1
15
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3
45
1.45
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1.9
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0
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16
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1
21
1.06
122225737--122225773
17
2.2
17
95
0
65
5
18
29
45
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122228659--122228738
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1.9
42
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0
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16
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23
1.96
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3
100
0
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33
0
0
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0.92
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65
22
4
6
66
1.33
122229976--122230004
13
2.3
13
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51
31
10
6
51
1.62
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1.9
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89
0
89
17
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39
15
1.90
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1.9
30
88
0
87
17
29
40
12
1.86
122233297--122233660
198
1.8
198
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23
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1.97
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10.2
5
76
19
54
25
0
1
73
0.94
122233674--122233725
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25
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5
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1.08
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1
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13
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19
2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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22
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20
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1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.94
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25
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433