Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  304  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94947759--94947823
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22
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39
3.9
39
86
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22
1.98
94971479--94971602
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39
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25
32
20
22
1.98
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28
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1.84
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2.4
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27
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21
27
25
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2.7
120
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21
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24
24
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4.0
46
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0
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31
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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40
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26
2.00
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28
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21
1.98
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27
20
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1.98
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22
2.00
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2.0
102
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32
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1.91
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29
19
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1.98
95046774--95046943
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1.8
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93
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295
28
28
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84
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215
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1.83
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4.6
27
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2
169
41
20
7
30
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95065756--95065895
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1.80
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1.9
81
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218
40
19
9
30
1.83
95065772--95065922
54
2.8
54
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162
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19
9
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1.83
95065878--95065938
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2.3
27
94
2
106
42
16
14
26
1.87
95066559--95066655
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3.5
28
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153
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20
1.79
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46
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29
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1.99
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1.95
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2.7
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35
18
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20
1.95
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6
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15
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23
18
12
45
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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28
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
20
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
1
30
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433