Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  209  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65587487--65587544
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21
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2
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20
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3.2
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8
81
27
27
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1.96
65593234--65593332
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13
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1.18
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27
2.0
25
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13
63
71
1
18
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1.19
65593238--65593321
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2.0
43
83
6
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70
3
20
5
1.24
65595245--65595287
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2.5
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27
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13
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2.0
248
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106
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0
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0
0
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27
15
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1.96
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2.5
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100
0
54
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14
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1.86
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5
11.0
5
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20
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3
17
1
77
1.00
65609441--65609497
16
3.7
14
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3
17
1
77
1.00
65609441--65609508
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2
17
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30
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1.80
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2.9
31
81
5
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29
23
15
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65624324--65624358
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13
95
4
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8
8
5
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1.13
65630768--65630814
15
3.2
15
72
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51
29
0
25
44
1.54
65630759--65630820
29
2.1
30
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27
0
29
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1.55
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24
2.1
24
88
0
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17
13
13
1.70
65631731--65631770
16
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16
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52
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1.74
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0
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32
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17
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13
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31
1.72
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28
3.0
28
80
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22
4
1.23
65649597--65649640
13
3.2
13
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70
2
22
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1.17
65650612--65650660
21
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18
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58
0
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1.37
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24
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56
15
23
21
39
1.92
65654781--65654829
21
2.4
20
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71
14
22
22
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1.90
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13
2.2
13
100
0
58
27
0
10
62
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65660090--65660197
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4.2
26
92
0
180
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25
36
1.81
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26
2.0
26
82
7
63
39
20
15
24
1.91
65671594--65671632
18
2.1
19
85
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53
7
23
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66
1.30
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17
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77
1.00
65671755--65671811
16
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15
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1
17
3
77
1.00
65671755--65671816
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3.0
21
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16
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1.02
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29
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0
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1.56
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24
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24
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0
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0
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Copy
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Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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Period
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Copy
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Score
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T
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0
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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8
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433