Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  32  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8301673--8301724
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0
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17
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2.4
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22
2.6
22
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2.1
30
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0
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1
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2.0
28
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0
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100
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4.8
9
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8
54
38
0
4
56
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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2
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2
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0
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0
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10.0
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100
0
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0
0
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2.8
21
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70
35
1
6
56
1.35
8343273--8343325
21
2.5
21
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0
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1
9
54
1.43
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25
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11
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5
4
55
1.42
8343437--8343481
20
2.1
22
84
8
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33
2
4
60
1.29
8343437--8343499
22
2.9
22
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2.0
22
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2.2
33
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4
123
28
17
4
50
1.64
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2.1
40
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100
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19
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4.5
88
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19
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15
2.2
15
94
0
57
15
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69
1.34
8365857--8366250
87
4.4
88
80
9
374
28
15
19
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1.92
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2
0
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0
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3.2
24
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11
74
35
1
4
58
1.28
8368147--8368252
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4.2
24
73
15
88
34
1
4
58
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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68
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57
1.26
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2.2
40
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106
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1
4
59
1.25
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3.1
24
78
20
84
32
2
5
59
1.34
8368233--8368337
23
4.8
21
76
20
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34
4
3
57
1.38
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9
4.8
9
86
11
52
38
0
4
57
1.20
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2.1
18
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2
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0
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0
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0
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3
7
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1.44
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3.2
22
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5
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56
1.20
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19
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17
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0
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13
12
39
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8392211--8392271
21
3.0
21
69
11
56
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22
16
31
1.96
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34
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15
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0
0
54
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2.0
30
93
0
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28
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38
1.84
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29
2.4
29
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2
2
32
1.24
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2.5
22
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44
3
1
50
1.31
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10
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10
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10
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8405225--8405355
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68
1.21
8405297--8405322
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2.0
13
100
0
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20
2.9
20
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26
0
5
67
1.11
8405317--8405370
9
5.8
9
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8
72
25
0
5
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1.11
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11
2.3
11
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50
16
0
8
76
1.02
8405307--8405369
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29
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5
110
22
1
4
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1.13
8405268--8405370
9
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1.98
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20
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26
1.98
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28
1.9
28
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26
1.98
8433558--8433625
30
2.3
30
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27
29
26
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1.97
8434341--8434424
7
11.6
7
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25
50
46
1
1
51
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
22
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8
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14
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13
2.0
13
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0
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7
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20.5
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0
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0
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26
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0
184
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2.1
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1.79
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16
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19
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20
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19
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19
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1.38
8461687--8461798
28
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27
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21
6
5
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1.34
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2.7
27
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0
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18
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1.83
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41
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1.9
49
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0
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26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8473532--8473593
25
2.5
24
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10
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74
1
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2.2
29
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0
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25
2.5
24
80
7
72
74
1
17
6
1.10
8482655--8482719
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2.2
29
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0
112
30
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13
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0
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0
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2.9
26
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0
134
31
5
26
36
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433