Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  29  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7491608--7491681
20
3.8
20
73
18
66
29
1
4
64
1.20
7491603--7491679
9
7.7
10
71
14
52
29
1
3
64
1.19
7491601--7491681
29
2.8
29
75
9
92
30
1
3
64
1.19
7494342--7494441
30
3.4
30
91
2
166
28
49
4
19
1.66
7494342--7494484
29
4.8
29
80
8
155
27
47
4
20
1.69
7494342--7494484
59
2.4
59
83
6
166
27
47
4
20
1.69
7494977--7495190
25
8.5
25
69
16
113
33
6
4
56
1.43
7494991--7495104
16
7.4
15
65
25
53
35
4
3
57
1.36
7495339--7495387
16
3.0
17
79
8
57
30
2
2
65
1.15
7496911--7496946
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
7505223--7505397
71
2.5
69
85
3
217
28
13
23
34
1.93
7505397--7505549
72
2.1
72
87
3
220
22
14
22
40
1.90
7505538--7505562
13
1.9
13
100
0
50
24
12
0
64
1.27
7505495--7506116
140
4.4
140
96
0
1102
25
16
19
37
1.93
7505960--7505993
13
2.5
13
90
4
50
20
11
8
58
1.59
7506047--7506350
79
4.0
75
89
3
385
31
17
19
31
1.95
7506047--7507087
75
12.9
75
71
17
404
28
17
19
34
1.95
7506272--7506444
94
1.8
94
86
2
249
27
20
19
32
1.97
7506344--7507083
77
9.2
77
73
14
482
27
17
19
35
1.94
7506706--7506767
30
2.1
30
90
6
99
19
9
29
41
1.83
7506124--7507053
250
3.8
244
81
8
913
28
17
19
33
1.95
7506770--7506938
88
1.9
87
84
5
225
30
17
16
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7507078--7507114
14
2.8
13
84
8
56
10
13
8
67
1.41
7507879--7508053
30
5.8
30
88
1
219
27
47
4
21
1.68
7508621--7508774
25
6.0
25
70
15
80
34
5
3
55
1.42
7508641--7508722
28
2.8
30
76
9
80
30
6
3
59
1.39
7508924--7508983
24
2.5
24
86
5
77
30
1
3
65
1.19
7508931--7508972
8
5.5
8
94
2
61
30
0
4
64
1.14
7508931--7508979
16
3.1
16
85
11
66
30
0
4
65
1.11
7513844--7513889
21
2.2
21
84
0
56
43
21
17
17
1.88
7519410--7519489
31
2.5
32
77
20
87
50
1
2
46
1.23
7520935--7520987
18
2.7
20
77
14
65
60
0
0
39
0.97
7522810--7522855
23
2.0
23
83
8
58
43
6
15
34
1.72
7525254--7525312
21
2.7
22
75
19
70
20
3
6
69
1.26
7532028--7532145
43
2.8
42
92
1
191
20
19
31
28
1.97
7532021--7532161
43
3.3
41
85
5
183
24
21
28
25
1.99
7536384--7536495
57
2.0
57
89
0
170
29
0
23
46
1.58
7536396--7536508
9
12.2
9
79
5
118
30
0
21
46
1.57
7536384--7536508
57
2.2
57
86
0
169
30
0
21
47
1.57
7536552--7537222
241
2.8
241
97
0
1263
32
14
18
34
1.90
7537288--7537338
10
5.4
10
75
13
54
35
17
0
47
1.48
7537281--7537334
27
2.0
27
100
0
108
40
14
0
44
1.46
7537382--7537430
23
2.1
23
88
7
73
38
16
12
32
1.86
7540948--7540999
19
2.7
20
84
6
70
32
1
38
26
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7541996--7542039
15
3.0
14
90
6
61
31
2
20
45
1.64
7542209--7542264
29
1.9
29
92
0
94
19
8
35
35
1.83
7542789--7543005
41
5.4
39
84
6
215
23
21
19
35
1.96
7542789--7543016
81
2.8
80
80
10
241
23
22
19
34
1.96
7550345--7550402
31
2.0
28
83
16
73
50
17
3
29
1.62
7561950--7562031
39
2.1
39
97
0
155
36
26
10
25
1.89
7564633--7564792
13
12.3
13
75
10
130
45
3
15
36
1.62
7564645--7564792
40
3.8
40
83
7
126
45
2
14
37
1.59
7564645--7564761
40
2.9
41
86
6
143
46
2
15
35
1.60
7567607--7567713
25
4.2
25
96
2
187
37
24
5
32
1.79
7567607--7567713
51
2.1
50
94
1
187
37
24
5
32
1.79
7573382--7573489
26
4.2
25
92
2
171
37
23
5
34
1.78
7573896--7573920
10
2.5
10
100
0
50
92
0
8
0
0.40
7573880--7573949
36
1.9
36
88
5
106
80
11
2
5
1.00
7573878--7573939
19
3.4
18
74
19
58
79
12
3
4
1.02
7573898--7573953
29
1.9
29
89
7
87
80
8
3
7
1.01
7574221--7574268
13
3.7
13
80
5
53
72
4
0
22
1.01
7578789--7578815
12
2.2
12
100
0
54
25
22
7
44
1.79
7580057--7580413
140
2.5
139
81
8
427
27
18
21
32
1.97
7580054--7580456
71
5.6
71
78
8
406
28
17
21
32
1.96
7581217--7581285
35
1.9
35
85
8
95
76
11
4
7
1.12
7581480--7581518
17
2.3
17
86
8
53
17
10
0
71
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7582035--7582064
11
2.7
11
89
0
51
40
0
0
60
0.97
7585220--7585263
15
2.9
16
81
18
58
50
4
22
22
1.67
7585688--7585892
39
5.3
39
89
0
302
30
19
16
33
1.94
7586124--7586213
18
4.9
18
87
5
128
36
11
15
36
1.83
7586124--7586213
35
2.5
36
90
7
146
36
11
15
36
1.83
7586520--7586553
12
2.9
11
87
12
50
35
0
0
64
0.94
7586521--7586628
21
5.3
21
70
14
68
37
2
0
60
1.12
7586518--7586548
16
2.0
16
93
6
55
35
0
0
64
0.94
7586526--7586634
7
15.4
7
72
19
50
36
3
0
59
1.15
7589632--7589670
16
2.6
15
88
8
53
58
0
2
38
1.12
7594022--7594060
18
2.2
18
90
0
60
2
20
7
69
1.26
7594657--7594776
62
1.9
62
82
0
150
25
25
25
24
2.00
7603186--7603276
46
2.0
46
95
0
164
3
34
4
58
1.34
7605823--7605896
34
2.3
33
79
9
80
50
5
4
40
1.44
7605976--7606021
20
2.3
20
81
3
58
54
4
2
39
1.32
7607891--7608104
49
4.3
49
81
3
257
28
27
19
24
1.98
7607922--7608102
100
1.8
101
88
1
283
28
25
19
25
1.99
7612515--7612548
17
2.1
16
88
5
50
5
35
0
58
1.22
7621220--7621287
26
2.6
27
83
6
86
41
1
1
55
1.18
7623007--7623049
17
2.6
16
82
17
52
44
4
2
48
1.36
7629347--7629409
30
2.1
30
93
0
108
23
1
15
58
1.46
7629664--7629694
16
1.9
16
93
0
53
35
48
9
6
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7630894--7630941
19
2.5
19
79
3
51
33
6
2
58
1.35
7630894--7631089
10
20.0
10
65
17
54
32
4
3
60
1.33
7631196--7631234
7
5.0
8
90
9
55
41
0
0
58
0.98
7631523--7631586
32
2.0
32
100
0
128
50
9
3
37
1.51
7631523--7631577
19
3.2
19
66
28
59
45
10
3
40
1.57
7631525--7631593
32
2.2
32
94
0
120
52
10
2
34
1.50
7632309--7632362
13
4.1
13
84
13
74
77
0
22
0
0.76
7632309--7632361
27
2.0
25
92
7
88
77
0
22
0
0.77
7633050--7633102
21
2.6
20
83
16
65
66
0
33
0
0.92
7635973--7636009
14
2.6
14
95
0
65
24
10
13
51
1.73
7636364--7636522
33
4.8
33
80
6
106
30
9
41
18
1.82
7636366--7636535
66
2.6
66
81
3
173
31
9
41
17
1.81
7636417--7636575
66
2.4
66
86
0
219
31
12
40
15
1.85
7636417--7636584
33
5.1
33
82
0
174
30
11
41
16
1.84
7639542--7639574
14
2.4
14
94
0
57
51
0
0
48
1.00
7661823--7661892
25
2.8
26
79
10
74
28
0
2
68
1.04
7670361--7670913
204
2.7
204
91
1
881
30
18
22
28
1.97
7672334--7672367
16
2.1
16
89
10
52
29
2
0
67
1.05
7672335--7672389
28
2.0
27
82
10
67
30
1
0
67
1.01
7672354--7672411
28
2.1
28
83
6
73
36
0
1
62
1.06
7672363--7672472
22
5.4
19
68
20
55
33
2
2
60
1.25
7676050--7676081
4
8.0
4
100
0
64
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7688597--7688760
71
2.3
71
97
0
310
18
28
18
34
1.95
7688597--7688794
71
2.8
70
90
3
267
20
28
18
32
1.96
7703218--7703620
202
2.0
202
97
0
752
35
11
15
37
1.84
7709224--7709322
52
1.9
51
91
2
162
40
24
18
17
1.91
7709905--7709952
19
2.6
19
80
9
55
35
2
14
47
1.56
7709966--7710058
43
2.2
43
90
3
143
29
6
12
51
1.65
7714631--7714678
19
2.6
19
80
9
55
35
2
14
47
1.56
7714692--7714784
43
2.2
43
92
3
152
27
6
13
51
1.66
7714901--7714926
13
2.0
13
100
0
52
23
30
7
38
1.83
7717905--7717933
14
2.1
14
100
0
58
86
0
13
0
0.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433