Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  8  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2388543--2388584
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22
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0
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0
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0
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0
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139
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11
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100
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0
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0
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19
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1
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1.30
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10
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1.32
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4.4
36
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11
124
44
22
8
24
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2450603--2450756
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71
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24
1.80
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19
2.2
19
84
12
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46
18
16
18
1.84
2453080--2453123
22
2.0
22
82
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0
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16
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2
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2
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80
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65
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1.20
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2.1
23
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14
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86
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20
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7
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2.2
68
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4.1
22
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21
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11
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2523101--2523142
2
21.5
2
90
4
68
52
2
0
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10
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1
0
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1.10
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3
80
10
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2
2
33
1.20
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16
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0
0
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2.3
20
100
0
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0
52
0
1.00
2524129--2524173
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4.3
11
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11
67
48
0
51
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.69
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16.2
72
74
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19
15
31
1.93
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157
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16
587
33
19
16
31
1.93
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2.8
385
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3
1635
33
19
15
31
1.93
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223
5.1
223
78
10
1000
32
19
15
31
1.94
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223
2.1
223
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2
543
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17
15
32
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4.1
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11
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57
2
0
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3
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1.25
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1
0
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176
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4
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19
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59
3
0
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1.13
2542881--2542964
17
4.7
18
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75
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3
0
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1.14
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0
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2
5
51
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2568611--2568658
16
2.9
16
78
6
51
47
12
6
33
1.66
2571341--2571382
16
2.6
16
76
23
52
35
0
0
64
0.94
2573065--2573119
28
1.9
29
85
10
78
50
0
0
49
1.00
2573065--2573123
26
2.2
28
82
11
70
54
0
0
45
0.99
2573063--2573124
28
2.2
28
80
11
74
54
0
0
45
0.99
2574479--2574524
22
2.1
21
84
4
56
50
4
4
41
1.42
2575862--2575986
29
4.2
28
78
11
108
44
19
14
21
1.86
2583205--2583244
21
1.9
21
84
0
53
57
0
0
42
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12
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12
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17
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0
0
38
0.96
2583215--2583275
15
3.8
15
73
23
52
60
0
0
39
0.97
2584076--2584118
19
2.3
19
87
0
59
44
4
0
51
1.22
2588227--2588279
20
2.8
19
76
15
56
26
1
9
62
1.36
2590169--2590266
49
2.0
49
100
0
196
10
10
20
59
1.59
2596932--2596999
11
6.4
10
75
11
55
70
4
8
16
1.29
2596943--2597003
22
3.0
20
81
11
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73
3
8
14
1.19
2602582--2602611
1
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1
100
0
60
0
0
0
100
0.00
2609787--2609961
46
3.8
46
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15
198
29
29
19
21
1.97
2609796--2609965
93
1.8
93
93
0
295
29
30
19
21
1.97
2616163--2616287
61
2.0
61
96
0
232
44
20
8
28
1.79
2621215--2621265
22
2.4
21
75
15
59
70
0
0
29
0.87
2621147--2621265
47
2.7
44
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10
107
62
1
0
35
1.11
2623698--2623784
21
4.0
23
80
10
92
37
25
21
14
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2625269--2625323
27
1.9
30
82
10
71
3
20
5
70
1.22
2625773--2625839
17
3.8
17
74
21
59
31
2
0
65
1.07
2626020--2626169
26
6.2
25
71
19
99
34
5
3
56
1.38
2626031--2626152
26
4.9
26
73
19
100
36
6
4
53
1.46
2626151--2626230
3
26.7
3
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35
2
0
62
1.09
2626331--2626406
23
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22
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13
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34
1
5
59
1.28
2626351--2626404
21
2.5
21
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17
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33
0
3
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1.12
2626311--2626458
74
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12
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4
4
58
1.38
2626445--2626500
18
2.9
20
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20
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1
7
55
1.38
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11
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11
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15
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33
0
4
60
1.24
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24
11.9
24
70
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151
33
4
4
57
1.39
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14
4.5
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74
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52
33
0
1
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1.03
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25
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24
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13
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35
5
1
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1.31
2626728--2626861
24
5.9
23
76
19
104
34
2
3
58
1.31
2632325--2632364
16
2.5
16
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15
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40
5
5
50
1.46
2632887--2632919
4
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4
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6
50
21
3
0
75
0.93
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30
2.4
31
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132
39
10
10
39
1.75
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2
22.5
2
100
0
90
48
0
0
51
1.00
2638359--2638383
10
2.5
10
100
0
50
20
8
8
64
1.46
2638432--2638604
3
57.7
3
74
14
117
26
5
2
65
1.27
2645693--2645896
86
2.4
86
85
1
266
30
19
21
29
1.97
2645768--2646071
130
2.3
130
85
0
437
28
18
24
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2645832--2646077
44
5.6
44
72
10
193
30
17
24
27
1.97
2646003--2646095
44
2.1
44
84
4
116
32
17
21
29
1.96
2646172--2646518
183
1.9
183
85
0
487
29
21
22
26
1.99
2646361--2646480
44
2.7
45
79
3
136
28
19
23
29
1.98
2646179--2646516
89
3.7
90
70
11
260
29
21
23
26
1.99
2647305--2647349
2
22.5
2
95
0
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2
0
48
1.13
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2
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2
100
0
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0
0
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100
0
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0
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0
1.00
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0
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1.90
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17
2.0
17
88
0
50
44
20
11
23
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433