Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  91  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27406274--27406454
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3.0
60
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3
303
38
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0
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1.49
27410860--27410930
27
2.6
27
75
4
72
36
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29
1.83
27410914--27411037
27
4.6
27
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162
41
19
7
31
1.78
27410914--27411037
54
2.3
54
91
2
196
41
19
7
31
1.78
27411020--27411081
27
2.3
27
94
0
106
41
16
14
27
1.87
27410914--27411065
54
2.8
53
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40
19
9
30
1.82
27410914--27411066
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1.9
81
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211
40
18
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31
1.82
27414951--27415021
27
2.6
27
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1.83
27415005--27415128
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169
41
20
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30
1.79
27414989--27415128
54
2.6
53
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40
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1.80
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1.9
81
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220
40
19
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30
1.83
27415111--27415172
27
2.3
27
94
0
106
41
16
14
27
1.87
27415005--27415155
54
2.8
54
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162
41
19
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29
1.83
27418524--27418608
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2.4
35
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2
98
42
31
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11
1.81
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17
2.4
17
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7
11
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1.23
27420991--27421035
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20
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1.10
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17
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10
65
64
0
33
2
1.06
27421199--27421242
22
2.0
21
86
4
61
68
0
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2
1.02
27422765--27422882
29
4.1
29
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13
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27
1.94
27430516--27430608
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3.2
29
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1
89
31
12
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27
1.93
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28
2.7
29
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26
15
32
25
1.95
27430543--27430633
29
3.2
28
75
18
89
29
14
29
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27432319--27432371
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15
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5
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71
5
0
22
1.06
27432310--27432375
16
4.1
16
76
5
71
71
4
1
22
1.13
27432561--27432622
30
2.3
26
77
22
65
66
3
4
25
1.27
27432409--27433093
149
4.6
150
89
3
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7
6
27
1.51
27432710--27432745
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13
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2
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22
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53
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0
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28
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35
2.0
35
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2.2
44
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42
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19
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19
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0
0
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5
55
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2
0
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0
52
38
0
30
30
1.58
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26
2.1
28
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84
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8
29
1.44
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26
2.0
26
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72
60
0
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28
1.31
27456239--27456271
13
2.6
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85
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50
75
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9
1.18
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2.2
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26
1.30
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2
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2
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0
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50
0
0
50
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18
100
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2.4
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95
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50
14
20
14
1.78
27473126--27473176
20
2.7
18
82
14
59
41
1
19
37
1.63
27473961--27474145
49
3.8
49
78
9
189
25
17
29
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27476611--27476656
24
2.0
23
91
4
74
50
23
0
26
1.50
27477557--27477597
18
2.3
18
86
0
55
43
26
4
24
1.74
27479175--27479311
56
2.4
56
90
0
211
32
23
15
28
1.95
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29
4.6
29
83
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149
25
32
16
25
1.96
27487863--27488044
39
4.6
40
79
11
189
24
21
28
25
1.99
27487859--27488042
79
2.3
78
82
6
221
26
21
27
25
1.99
27495958--27496138
39
4.6
40
78
12
189
24
20
29
25
1.99
27495954--27496136
78
2.3
77
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226
25
20
28
25
1.99
27495954--27496171
78
2.8
76
77
12
217
26
20
27
25
1.99
27495956--27496171
117
1.8
117
82
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278
26
20
28
25
1.99
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2.1
31
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0
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12
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2.1
53
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149
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15
21
25
1.93
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27
4.3
27
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37
16
20
25
1.93
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2.0
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17
26
21
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1.95
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25
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1.98
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21
20
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29
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180
26
16
31
25
1.97
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40
78
7
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20
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
20
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25
1.99
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2.2
80
80
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27
20
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26
1.99
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0
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29
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2
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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20
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2
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4
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0
4
50
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27673832--27673916
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29
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0
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2.7
20
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65
1
5
26
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433