Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr06 132263754 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  7  of  433  ( 51894 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2068444--2068604
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80
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0
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28
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15
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1.9
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15
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0
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10
0
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22
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329
40
15
22
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1.90
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13
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55
0
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0
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0
0
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2.1
34
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8
79
53
2
2
40
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
17
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5
52
38
5
0
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1.24
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20
2.7
18
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19
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0
0
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20
2.2
20
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0
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2.1
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36
0
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2.0
51
100
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11
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42
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26
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30
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49
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49
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31
4.8
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2.3
15
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0
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52
0
2
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4.9
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99
2.0
99
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364
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9
8
44
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20
2.0
20
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17
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2.2
60
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43
20
12
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1.86
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16
2.8
15
79
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50
48
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2.0
60
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222
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15
14
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1.87
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25
2.2
24
82
3
61
24
1
5
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2.4
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0
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22
2.0
22
100
0
90
46
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4
26
1.70
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19
2.0
20
85
4
55
52
0
7
40
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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42
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0
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100
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2.0
22
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2.3
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14
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100
0
50
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9
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2.0
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19
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2.0
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23
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38
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124
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24
13
22
39
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2269215--2269807
263
2.3
257
94
2
1033
25
14
22
36
1.93
2269645--2270084
72
6.1
71
68
11
288
25
16
21
36
1.94
2269856--2270095
74
3.3
72
77
10
254
26
17
20
35
1.95
2270090--2270782
79
8.8
76
69
18
229
29
18
19
32
1.95
2270090--2270250
74
2.1
77
87
5
231
28
19
21
31
1.97
2269929--2270725
165
4.9
165
85
8
921
28
18
20
33
1.96
2270089--2270807
77
9.1
76
68
18
242
29
17
19
32
1.95
2270442--2270949
72
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76
76
10
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29
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19
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2270931--2270992
30
2.1
30
90
6
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19
9
29
41
1.83
2271681--2271716
16
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16
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4
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2
8
0
0.59
2271712--2271745
15
2.3
15
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5
52
61
32
0
5
1.20
2272042--2272080
11
3.5
11
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51
0
12
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0.83
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3
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0
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0
0
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16
2.0
16
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0
55
50
9
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23
2.2
25
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1
0
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19
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5
0
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22
100
0
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1.79
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23
2.5
22
77
11
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58
1
5
34
1.32
2286619--2286661
17
2.5
17
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0
77
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0
11
4
0.78
2286620--2286660
11
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83
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59
85
0
12
2
0.70
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21
2.0
21
85
9
57
41
2
2
53
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2292219--2292266
18
2.7
18
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9
53
22
2
2
72
1.05
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21
2.0
22
85
4
59
45
11
16
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1.82
2299940--2299999
23
2.6
23
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1
0
31
1.01
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1.9
28
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3
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3
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0
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20
12
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1.88
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0
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2.9
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7
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1
2
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1.20
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0
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0
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17
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65
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0
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0
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0
0
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1.00
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75
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35
4.6
35
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9
167
32
11
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32
1.90
2335999--2336069
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2.0
19
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5
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2.8
28
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0
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0
0
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2.0
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0
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25
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14
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2.2
20
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0
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0
47
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2.1
19
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0
60
35
0
2
61
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2364356--2364394
20
2.0
20
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0
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0
2
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0
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0
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3
4
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1.30
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2.1
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0
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20
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0
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0
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0
0
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0
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0
0
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15
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1.46
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3.1
30
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1
170
54
3
7
35
1.45

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433