Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  15  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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3.0
45
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153
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14
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20
26
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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28
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9
5
34
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.98
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
4211126--4211190
26
2.5
25
73
14
60
63
1
1
33
1.13
4211181--4211226
17
2.7
17
75
21
51
65
0
4
30
1.12
4211179--4211256
30
2.6
32
78
11
85
65
2
3
28
1.23
4215284--4215334
3
17.0
3
100
0
102
66
0
0
33
0.92
4215362--4215415
26
2.2
24
83
6
63
61
3
3
31
1.31
4226644--4226700
22
2.6
21
78
13
62
40
1
0
57
1.09
4226716--4226745
12
2.5
12
94
0
51
66
0
0
33
0.92
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4
6.5
4
100
0
52
23
0
0
76
0.78
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43
2.0
43
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156
40
0
16
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1.48
4231453--4231548
43
2.3
40
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10
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41
1
14
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4235376--4235425
15
3.4
15
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20
52
26
0
10
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4235736--4235760
13
1.9
13
100
0
50
24
8
0
68
1.16
4237519--4237669
53
2.8
53
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4
214
29
27
16
25
1.97
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53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
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25
2.1
24
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10
77
19
15
15
49
1.80
4257187--4257463
106
2.6
107
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4
335
25
21
22
30
1.99
4258377--4258437
22
2.7
23
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7
90
44
18
22
14
1.86
4258377--4258445
22
3.1
22
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77
44
17
20
17
1.86
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11
4.9
11
80
11
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54
0
1
43
1.11
4262028--4262072
21
2.1
21
87
4
63
51
6
2
40
1.41
4267006--4267102
45
2.3
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8
131
53
10
12
23
1.69
4266988--4267123
21
6.4
20
70
12
85
52
11
12
22
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4268585--4268641
17
3.5
17
72
13
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66
12
15
5
1.41
4268582--4268650
31
2.2
32
97
2
131
66
11
15
5
1.41
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15
2.0
15
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0
51
26
20
23
30
1.98
4275821--4275857
16
2.2
18
85
9
51
62
0
0
37
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1.9
19
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0
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2
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2.3
24
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10
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2
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1.73
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88
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7
315
36
18
16
28
1.93
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71
2.0
71
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2
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21
16
30
1.95
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90
2.5
91
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297
35
17
15
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1.91
4278892--4279123
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76
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32
18
15
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4291528--4291562
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9
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0
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2
0
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1.14
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26
3.2
26
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0
150
36
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4
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1.77
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19
1.9
19
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2
13
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1.55
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24
2.3
24
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8
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30
1.47
4294749--4294823
30
2.5
30
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10
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6
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1.40
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23
2.0
24
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4
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60
6
0
32
1.22
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29
2.2
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14
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60
7
0
32
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28
26
25
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24
3.1
20
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17
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1.28
4299302--4299385
44
1.9
44
95
4
152
47
4
11
35
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4300523--4300593
29
2.4
29
83
0
97
26
19
8
45
1.79
4303075--4303117
20
2.1
21
91
4
70
37
2
0
60
1.10
4303131--4303271
29
4.9
29
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6
198
45
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7
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1.50
4308207--4308246
19
2.0
20
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2
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17
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58
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6
0
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16
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0
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2.5
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86
6
6
0
0.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433