Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  19  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5115454--5115578
27
4.6
27
84
2
135
48
14
1
36
1.54
5121222--5121277
21
2.7
21
80
5
60
30
17
48
3
1.65
5121666--5121827
43
3.8
43
95
0
290
22
31
19
25
1.98
5122100--5122157
27
2.1
27
87
0
80
29
13
5
51
1.63
5123923--5123971
21
2.3
21
85
0
71
44
12
14
28
1.81
5125062--5125089
6
4.7
6
100
0
56
82
0
17
0
0.68
5127947--5127976
15
2.0
15
93
0
51
23
0
43
33
1.54
5130635--5130686
18
2.9
17
72
8
50
21
3
1
73
1.10
5133182--5133222
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
5144167--5144318
39
3.8
39
92
4
236
32
25
21
21
1.98
5145096--5145122
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
5146755--5146788
17
2.0
17
100
0
68
47
17
5
29
1.71
5148872--5149011
46
3.0
46
88
4
203
20
21
15
42
1.89
5149000--5149024
13
1.9
13
100
0
50
16
28
24
32
1.96
5149146--5149225
42
1.9
42
94
0
142
32
23
16
27
1.96
5151169--5151217
3
17.3
3
76
19
52
69
0
2
28
1.00
5151175--5151213
11
3.5
11
92
0
69
69
0
2
28
1.02
5151176--5151217
19
2.2
19
87
8
59
71
0
2
26
0.98
5151187--5151262
20
3.7
21
77
10
68
59
6
1
32
1.32
5152809--5152937
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
5160196--5160324
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
5163365--5163494
48
2.7
48
81
3
145
31
25
16
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5166222--5166271
21
2.4
21
80
9
59
18
30
38
14
1.89
5166974--5167010
6
6.0
6
93
6
65
81
0
2
16
0.81
5166974--5167010
19
2.0
18
94
5
65
81
0
2
16
0.81
5169220--5169261
2
21.5
2
95
4
77
47
0
0
52
1.00
5170365--5170416
3
17.7
3
88
11
81
32
0
0
67
0.91
5170997--5171035
7
5.6
7
100
0
78
43
12
0
43
1.42
5171379--5171437
31
1.9
31
82
6
75
37
0
8
54
1.31
5171517--5171570
17
3.2
16
85
12
65
37
3
0
59
1.15
5173682--5173760
8
8.9
9
82
12
85
34
1
1
63
1.11
5173674--5173760
46
1.9
45
92
2
147
33
1
2
63
1.15
5174516--5174543
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
5187006--5187050
3
15.0
3
100
0
90
33
0
0
66
0.92
5193300--5193435
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
5194922--5194974
26
2.0
25
82
13
63
39
22
11
26
1.88
5199848--5199881
17
1.9
17
88
5
50
14
47
23
14
1.82
5199951--5199984
17
1.9
18
94
5
61
14
35
26
23
1.94
5203740--5203769
2
15.0
2
100
0
60
50
50
0
0
1.00
5205464--5205545
19
4.2
20
83
9
98
36
18
7
37
1.79
5205482--5205512
5
6.2
5
100
0
62
38
22
0
38
1.54
5215098--5215172
36
2.0
37
87
10
109
56
4
2
37
1.32
5215414--5215442
3
9.7
3
100
0
58
31
0
0
68
0.89
5224113--5224171
30
2.0
30
96
0
109
44
15
13
27
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5224195--5224275
37
2.2
37
80
4
92
35
4
3
55
1.39
5231132--5231161
14
2.1
14
100
0
60
13
0
33
53
1.40
5231239--5231283
24
2.0
24
91
8
76
15
0
8
75
1.03
5231241--5231279
17
2.3
17
86
0
60
17
0
5
76
0.96
5231689--5233138
721
2.0
726
94
1
2552
20
21
25
32
1.97
5240246--5240274
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
5240456--5240499
3
14.3
3
85
4
61
70
0
0
29
0.88
5240834--5240940
7
15.7
7
68
20
50
57
0
4
38
1.20
5240872--5240936
21
3.1
21
78
8
62
61
0
4
33
1.16
5240874--5240934
28
2.2
29
77
19
67
59
0
4
36
1.19
5240956--5240986
12
2.5
13
89
10
55
64
0
0
35
0.94
5240961--5240991
16
2.0
15
93
6
53
64
0
0
35
0.94
5241294--5241391
18
5.5
18
86
4
137
36
12
11
39
1.78
5241294--5241400
35
3.0
35
93
4
169
37
13
10
39
1.78
5244328--5244370
11
3.7
11
76
11
50
16
23
2
58
1.50
5244327--5244377
24
2.1
24
100
0
102
17
25
3
52
1.61
5247892--5248049
17
8.8
18
74
19
93
36
12
14
36
1.84
5247899--5248049
35
4.2
35
93
2
248
37
13
13
35
1.84
5248359--5248392
12
2.9
11
87
12
50
35
0
0
64
0.94
5248360--5248468
21
5.3
21
66
20
61
36
2
0
59
1.18
5248357--5248387
16
2.0
16
93
6
55
35
0
0
64
0.94
5248408--5248555
7
21.4
7
67
22
57
36
5
0
58
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5250203--5250246
20
2.2
20
87
0
61
45
20
4
29
1.71
5250214--5250254
20
2.0
20
95
0
73
39
17
4
39
1.71
5252260--5252430
93
1.8
93
88
0
261
30
28
19
22
1.98
5252252--5252421
46
3.7
46
75
13
159
31
28
18
21
1.97
5252353--5252438
46
1.9
45
85
4
120
33
29
16
20
1.95
5255728--5255886
46
3.5
45
79
14
159
23
30
20
25
1.98
5255771--5255982
46
4.6
46
81
5
216
22
31
19
26
1.98
5255771--5255987
92
2.4
91
82
4
249
23
31
18
25
1.98
5261756--5261816
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
5266515--5266571
2
28.5
2
100
0
114
49
0
0
50
1.00
5266667--5266706
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
5266869--5266893
9
2.8
9
100
0
50
24
12
0
64
1.27
5270211--5270259
15
3.0
17
77
22
52
65
6
0
28
1.16
5273667--5273719
20
2.7
19
80
5
61
28
3
5
62
1.35
5273616--5273720
55
1.9
54
84
5
140
28
2
4
63
1.29
5273616--5273724
19
5.8
19
73
11
91
28
2
4
64
1.27
5275059--5275168
26
4.2
26
89
0
175
33
5
23
37
1.78
5276954--5277239
136
2.1
137
95
0
511
24
18
25
32
1.97
5279218--5279267
26
2.0
25
88
4
73
66
8
6
20
1.40
5279746--5279821
19
3.7
21
84
6
66
40
18
6
34
1.76
5279773--5279870
19
5.2
19
90
7
155
35
16
9
38
1.80
5279773--5279870
36
2.6
37
88
9
144
35
16
9
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5279993--5280028
7
5.3
7
96
3
65
13
0
0
86
0.58
5280994--5281514
54
9.6
55
72
15
356
31
16
18
33
1.93
5281115--5281352
113
2.2
105
84
6
296
31
15
18
34
1.92
5281220--5281514
156
1.9
162
87
5
440
31
17
19
31
1.95
5284803--5285058
131
2.0
131
91
4
419
34
19
18
26
1.95
5286496--5286982
130
3.7
130
85
4
363
35
17
18
28
1.93
5286622--5287019
130
3.1
130
91
1
609
34
17
17
29
1.93
5287556--5287603
17
2.6
18
90
9
71
62
4
8
25
1.41
5290091--5290280
43
4.3
43
68
9
114
28
23
18
29
1.98
5289952--5290594
132
4.9
132
89
1
880
28
23
18
30
1.97
5302492--5302949
130
3.5
130
89
0
628
34
19
17
27
1.95
5303502--5303549
17
2.6
18
90
9
71
62
4
8
25
1.41
5307416--5307465
21
2.2
23
82
10
59
58
2
14
26
1.47
5307458--5307670
27
8.3
26
64
18
81
58
1
15
24
1.45
5307528--5307584
21
2.6
23
75
13
66
57
0
15
26
1.38
5307469--5307635
76
2.2
76
85
2
219
59
1
14
25
1.43
5307469--5307579
49
2.3
49
81
9
120
58
1
14
25
1.46
5307593--5307633
17
2.5
17
80
15
50
60
0
12
26
1.31
5307522--5307678
76
2.1
76
86
4
228
57
0
15
26
1.42
5307743--5307873
21
6.4
20
71
20
78
66
0
12
20
1.24
5307795--5307831
17
2.2
17
90
9
58
67
0
5
27
1.12
5307824--5307873
5
9.6
5
82
8
64
66
0
18
16
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5307818--5307874
16
3.6
16
83
9
62
64
0
15
19
1.28
5308174--5308257
19
4.1
20
78
14
73
66
0
7
26
1.17
5308185--5308253
16
4.9
15
77
22
62
71
0
7
21
1.10
5308196--5308243
24
2.0
24
100
0
96
70
0
8
20
1.12
5308180--5308295
43
2.7
43
81
9
130
65
0
9
24
1.28
5308195--5308253
14
4.4
14
79
20
72
69
0
8
22
1.15
5308201--5308289
24
4.0
23
71
20
64
66
1
11
21
1.30
5311701--5311734
17
2.0
17
88
11
52
73
0
0
26
0.83
5311701--5311734
18
1.9
17
88
5
50
73
0
0
26
0.83
5311988--5312045
22
2.6
22
81
7
64
41
17
5
36
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433