Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  353  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111027111--111027547
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2.0
219
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3
774
29
29
9
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111031038--111031088
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3.3
15
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0
1
54
1.11
111032538--111032890
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2
426
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1.96
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3.4
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1.98
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2.2
18
90
0
60
74
0
5
20
1.01
111042621--111042708
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2.0
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19
19
26
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1.95
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19
2.2
19
100
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82
56
12
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26
1.56
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19
2.1
19
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0
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42
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2.4
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38
1.71
111055306--111055365
14
4.2
14
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4
93
36
6
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40
1.75
111055511--111055545
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0
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0
0
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2.2
22
92
0
80
48
20
4
26
1.67
111056880--111056952
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2.5
30
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10
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50
20
4
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1.65
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22
2.4
22
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0
95
51
3
17
26
1.62
111076376--111076466
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2.4
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78
20
100
49
3
0
47
1.18
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59
43
15
0
40
1.47
111076588--111076655
26
2.6
25
78
21
77
44
14
0
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1.45
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2.1
16
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20
2
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1.68
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10.0
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0
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0
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0.80
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2.0
19
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0
23
0
76
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2.0
40
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14
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48
3
1
46
1.28
111095224--111095326
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111101698--111101727
2
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2
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0
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0
0
50
50
1.00
111106022--111106055
6
5.7
6
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0
50
17
0
50
32
1.47
111108270--111108315
23
2.0
23
86
0
65
67
0
0
32
0.91
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16
2.7
16
78
17
52
35
0
4
59
1.19
111114380--111114434
24
2.3
24
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6
67
67
0
0
32
0.91
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17
2.6
16
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7
57
73
0
0
26
0.84
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2.9
16
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9
58
73
0
0
26
0.84
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4.6
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138
26
23
27
22
2.00
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2.4
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4
186
23
24
29
22
1.99
111125216--111125399
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
111125256--111125444
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
111136418--111136452
17
2.0
18
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5
63
40
20
0
40
1.52
111136737--111136945
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5.1
41
78
2
213
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29
20
18
1.96
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31
2.1
31
96
0
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25
28
12
34
1.92
111139747--111139773
13
2.1
13
100
0
54
22
25
29
22
1.99
111152853--111152889
19
2.0
19
89
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58
56
5
0
37
1.22
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14
2.7
15
85
11
57
0
26
2
70
0.99
111153412--111153455
21
2.2
20
84
11
56
34
6
0
59
1.24
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10
3.6
10
81
18
51
41
10
0
48
1.37
111153477--111153523
23
2.0
23
87
0
67
42
8
2
46
1.46
111153485--111153561
33
2.3
32
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14
84
40
9
1
49
1.43
111153464--111153570
56
1.9
56
100
0
214
42
9
1
46
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111158704--111158734
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12
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0
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74
0
25
0
0.82
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2.6
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69
11
101
25
19
23
31
1.98
111177457--111177496
15
2.6
15
88
4
53
70
2
0
27
1.01
111179793--111179873
31
2.6
31
92
0
126
23
23
12
40
1.88
111197705--111197998
146
2.0
146
97
0
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39
25
4
31
1.75
111201290--111201484
24
8.1
24
94
0
345
36
25
17
20
1.94
111205259--111205323
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2.1
31
94
0
112
30
26
16
26
1.97
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2.0
43
86
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120
23
24
2
50
1.61
111210581--111210801
114
1.9
115
93
2
383
30
21
5
42
1.75
111212253--111212317
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2.2
30
94
2
114
3
9
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80
1.01
111222202--111222250
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2.3
21
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0
71
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2
0
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1.02
111234260--111234333
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3.3
23
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9
71
27
22
16
33
1.95
111234235--111234333
23
4.3
23
72
8
67
27
22
16
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1.95
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2.0
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17
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20
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27
5.0
28
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22
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1.85
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0
0
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1.83
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27
2.0
26
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10
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Percent
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Score
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143
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
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1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
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1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433