Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  48  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13147433--13147466
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11
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50
41
0
8
50
1.34
13151346--13151414
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1.9
35
82
11
86
52
10
0
37
1.36
13153360--13153541
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4.0
46
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20
24
14
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1.90
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11
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64
0
0
35
0.94
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2.3
24
87
3
76
60
1
0
37
1.07
13157158--13157188
16
1.9
16
100
0
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51
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19
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13157624--13157657
16
2.1
16
88
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50
0
11
11
76
1.02
13158112--13158237
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7
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25
25
20
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0
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0
0
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0
0
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1.00
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2.0
23
87
8
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6
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56
1.45
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1.9
23
85
0
61
47
9
0
43
1.35
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18
2.1
18
94
0
65
45
0
2
51
1.15
13185629--13185673
23
2.0
23
100
0
90
44
4
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1.56
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21
2.0
21
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1.85
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11.2
6
83
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42
0
57
0
0.98
13188742--13188807
11
5.6
11
82
14
71
42
0
57
0
0.98
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1.9
46
93
0
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43
19
16
20
1.88
13197143--13197218
22
3.5
22
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3
100
13
26
18
42
1.87
13197825--13197857
16
2.1
16
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50
75
0
24
0
0.80
13198721--13198855
40
3.4
39
79
7
157
24
17
25
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13203068--13203136
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16
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15
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55
0
1
43
1.08
13205894--13205970
26
3.0
27
88
9
108
38
22
20
18
1.93
13213525--13213664
27
5.2
28
90
5
184
35
22
24
17
1.96
13215284--13215445
26
6.2
26
97
0
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5
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7
100
0
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15
55
0
28
1.41
13229671--13229810
27
5.2
28
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5
184
35
22
24
17
1.96
13231426--13231483
26
2.2
26
93
0
98
36
24
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20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
13246267--13246406
27
5.2
28
88
5
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35
22
24
18
1.96
13248025--13248108
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3.2
26
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0
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25
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13248480--13248505
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100
0
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15
53
0
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1.42
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52
68
0
0
31
0.90
13251658--13251723
27
2.4
27
80
11
73
57
0
6
36
1.23
13253128--13253230
30
3.4
30
83
11
115
11
9
36
41
1.74
13253142--13253220
30
2.6
30
90
4
124
13
11
34
40
1.81
13253416--13253477
21
3.0
20
80
13
65
41
32
4
20
1.74
13253436--13253521
34
2.5
34
81
5
93
41
34
3
19
1.69
13253476--13253536
27
2.2
29
79
8
72
39
27
4
27
1.77
13262288--13262326
17
2.3
17
90
0
60
20
0
23
56
1.42
13262487--13262526
17
2.6
16
88
11
57
12
0
37
50
1.41
13262504--13262729
115
2.0
114
93
2
391
41
4
18
35
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13262356--13262893
277
1.9
276
92
1
900
37
3
19
39
1.68
13262627--13263056
162
2.6
162
93
1
711
35
2
20
40
1.67
13262887--13262943
24
2.4
24
85
2
71
17
0
31
50
1.46
13262904--13262958
22
2.4
24
84
6
69
14
0
34
50
1.43
13262926--13262965
17
2.6
16
88
11
57
12
0
37
50
1.41
13262781--13263331
277
2.0
275
92
2
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37
3
20
39
1.70
13262943--13263170
115
2.0
114
93
2
386
40
4
19
35
1.72
13262356--13263515
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438
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0
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3
20
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1.69
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3.8
161
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6
820
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3
20
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1.68
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17
3.3
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0
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513
36
3
19
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1.69
13263682--13264116
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3.5
126
90
0
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18
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0
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7
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0
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0
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1.49
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10
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0
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15
84
4
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30
5
0
64
1.15
13292340--13292386
19
2.5
20
86
6
62
42
0
0
57
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.40
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3
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3
69
19
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33
3
1
62
1.18
13308424--13308518
36
2.8
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10
111
33
3
1
62
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3
0
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1.13
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0
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0
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1.98
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20
1.98
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0
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22
1.91
13351708--13352019
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1.92
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1.95
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0
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2.0
20
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1.88
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1.90
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1.8
112
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22
1.90
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2.4
42
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9
104
28
20
23
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
1.98
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0
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19
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175
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1.96
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1.96
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21
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0
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2.6
19
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28
36
1
32
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13432319--13432345
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0
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0
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9
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0
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1.53
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0
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1.42
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0
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0
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1.48
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26
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5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433