Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  403  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124943934--124943999
21
3.1
21
72
12
55
46
21
3
28
1.66
124943904--124943973
35
2.0
36
88
2
106
51
24
0
24
1.49
124944118--124944159
21
2.0
20
86
4
57
26
7
30
35
1.83
124944113--124944175
27
2.3
28
88
2
92
25
6
30
38
1.81
124946640--124946704
21
3.1
21
72
18
55
41
0
3
55
1.15
124949387--124949496
26
4.2
26
97
0
193
36
25
5
32
1.79
124953876--124953966
47
1.9
47
95
0
164
37
13
20
28
1.90
124957652--124957727
38
2.0
38
89
0
116
47
32
11
7
1.69
124964590--124964652
31
2.1
29
85
5
81
49
4
1
44
1.33
124965165--124965289
64
2.0
63
93
6
220
35
3
5
56
1.39
124965172--124965307
64
2.1
64
86
8
204
35
2
5
56
1.36
124972471--124972533
30
2.1
31
85
8
85
36
0
9
53
1.33
124975975--124976017
15
2.9
15
76
10
52
32
0
6
60
1.23
124978677--124978921
130
1.9
132
86
1
350
31
19
15
33
1.93
124978677--124979153
131
3.6
128
78
5
404
28
19
17
34
1.95
124981084--124981160
18
4.3
18
77
6
66
40
11
14
33
1.82
124983866--124983906
16
2.6
16
78
17
50
21
2
4
70
1.18
124985180--124985217
8
4.8
8
84
9
51
34
0
0
65
0.93
124985187--124985237
26
2.0
24
81
7
57
47
0
0
52
1.00
124987290--124987348
31
2.0
29
90
6
91
35
6
10
47
1.64
124987293--124987359
29
2.2
31
84
5
84
37
8
11
41
1.73
124993129--124993172
22
1.9
24
90
9
74
75
0
0
25
0.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
124993132--124993165
18
1.9
17
94
5
59
76
0
0
23
0.79
124999872--124999913
16
2.4
18
88
7
61
50
0
0
50
1.00
125006189--125006310
61
2.1
58
93
4
208
47
16
9
27
1.76
125012365--125012489
62
2.0
62
100
0
250
38
19
9
32
1.84
125012472--125012528
29
2.0
29
92
0
96
45
14
12
28
1.80
125012534--125012558
5
5.0
5
100
0
50
0
20
0
80
0.72
125013965--125014096
65
2.0
66
94
1
230
34
15
18
31
1.92
125020928--125020978
23
2.2
24
85
3
68
25
1
9
62
1.36
125021250--125021298
2
24.5
2
100
0
98
51
0
0
48
1.00
125024525--125024572
2
25.0
2
83
8
64
47
0
4
47
1.21
125024525--125024564
11
3.7
11
90
3
64
50
0
2
47
1.14
125029138--125029177
3
13.3
3
100
0
80
67
0
0
32
0.91
125030461--125030899
77
5.7
77
89
3
591
33
20
16
28
1.95
125030458--125030899
233
1.9
231
87
5
649
33
20
16
28
1.95
125030784--125031015
116
2.0
119
88
3
353
31
21
15
31
1.95
125030904--125031085
75
2.5
75
87
1
251
31
20
16
31
1.95
125048695--125049206
80
6.6
78
89
3
761
28
17
22
31
1.96
125048702--125049159
157
2.9
157
92
0
772
27
16
22
33
1.96
125049356--125049467
45
2.5
45
94
0
188
29
18
24
27
1.98
125050518--125050563
3
15.3
3
100
0
92
32
0
0
67
0.91
125051265--125051315
17
3.0
17
72
11
50
27
9
15
47
1.77
125053982--125054053
8
8.1
8
72
18
54
63
1
0
34
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125053982--125054053
19
4.1
17
76
15
74
63
1
0
34
1.03
125053989--125054051
27
2.3
27
81
10
76
63
1
0
34
1.04
125054225--125054290
29
2.3
28
78
2
69
69
4
0
25
1.07
125054236--125054288
19
2.8
18
83
11
61
73
3
0
22
0.99
125058909--125058956
18
2.7
19
87
12
75
62
0
0
37
0.95
125058889--125058980
9
10.0
10
71
14
65
64
1
3
31
1.17
125059118--125059156
17
2.3
16
91
8
60
74
2
0
23
0.94
125059107--125059157
17
2.9
17
80
16
59
72
3
0
23
1.01
125059107--125059159
27
2.0
27
84
0
70
73
3
0
22
0.99
125060650--125060716
18
3.7
18
75
15
66
65
2
0
31
1.07
125060643--125060707
9
6.9
10
71
15
50
63
1
0
35
1.04
125060646--125060708
26
2.3
26
86
5
81
63
1
0
34
1.04
125061721--125061753
9
3.7
9
88
12
50
75
0
0
24
0.80
125061723--125061802
18
4.5
18
67
7
56
67
2
1
28
1.11
125061760--125061868
9
12.1
9
66
22
52
62
2
2
32
1.24
125061922--125061975
19
2.9
19
81
8
58
61
0
3
35
1.14
125062745--125062774
15
2.0
15
100
0
60
53
6
0
40
1.27
125062760--125062806
23
1.9
26
87
12
73
55
4
4
36
1.39
125063281--125063317
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
125063429--125063503
24
2.8
26
80
11
73
54
4
6
34
1.45
125063635--125063693
12
5.2
11
73
20
50
64
0
3
32
1.10
125063636--125063684
15
3.1
15
82
11
53
63
0
4
32
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125064781--125064883
23
4.5
23
90
2
136
18
0
35
45
1.50
125065863--125065924
30
2.1
30
84
0
79
46
4
32
16
1.68
125065916--125066041
6
21.0
6
80
0
99
39
1
40
18
1.60
125065924--125066040
54
2.2
54
92
0
189
41
1
39
17
1.60
125071073--125071144
21
3.2
21
64
21
56
38
9
25
26
1.86
125071072--125071196
46
2.7
46
89
0
187
40
12
22
24
1.88
125072808--125072914
28
3.8
28
92
0
160
29
25
10
34
1.89
125077873--125078082
28
7.5
28
72
5
172
29
34
18
17
1.94
125077843--125078084
56
4.2
57
90
3
371
29
35
17
17
1.93
125080056--125080115
28
2.2
26
77
11
66
28
25
10
36
1.88
125080071--125080164
28
3.4
28
92
0
143
28
25
11
34
1.91
125081645--125081742
46
2.1
46
90
0
151
42
16
23
17
1.88
125084339--125084454
26
4.2
26
80
16
142
31
8
23
36
1.85
125084360--125084428
34
2.0
34
94
0
120
31
11
20
36
1.88
125084339--125084454
60
1.9
60
96
0
214
31
8
23
36
1.85
125091265--125091321
19
3.2
19
77
18
61
66
0
8
24
1.20
125091371--125091483
18
6.1
18
67
19
63
64
2
3
29
1.24
125091365--125091441
37
2.2
33
82
13
93
62
1
3
32
1.22
125097657--125097701
22
2.0
22
100
0
90
26
17
17
37
1.93
125099903--125099928
12
2.2
12
100
0
52
7
15
30
46
1.74
125099963--125100117
40
3.8
40
86
1
148
32
20
21
24
1.97
125099952--125100241
41
7.1
40
85
3
319
33
21
22
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125100966--125100992
13
2.1
13
100
0
54
48
7
7
37
1.59
125105090--125105245
84
1.9
83
82
1
195
32
14
26
27
1.94
125123184--125123214
6
5.2
6
96
0
53
32
32
0
35
1.58
125126166--125126199
7
4.9
7
92
0
59
41
0
2
55
1.15
125132129--125132199
22
3.1
21
76
21
72
42
0
1
56
1.08
125132135--125132184
12
3.8
13
73
19
50
42
0
2
56
1.11
125132151--125132246
34
2.8
33
79
16
106
36
1
1
61
1.10
125132165--125132206
21
2.0
22
86
9
61
40
0
2
57
1.12
125132196--125132239
22
2.1
21
80
12
54
31
2
2
63
1.19
125132217--125132246
14
2.1
14
93
0
51
30
0
0
70
0.88
125132285--125132347
17
3.7
17
74
16
67
50
0
6
42
1.27
125132295--125132360
34
1.9
34
100
0
132
57
0
6
36
1.23
125132305--125132362
18
3.3
18
72
18
68
62
0
3
34
1.12
125132341--125132397
22
2.6
23
83
8
75
57
1
1
38
1.19
125132350--125132441
36
2.6
33
76
23
98
56
1
1
41
1.13
125132385--125132465
24
3.5
23
77
14
85
55
1
0
43
1.07
125132392--125132481
47
1.9
47
84
8
121
58
0
0
41
0.98
125132405--125132480
22
3.2
23
77
19
77
60
0
0
39
0.97
125134385--125134426
16
2.6
17
85
7
52
54
0
0
45
0.99
125134371--125134435
26
2.5
27
75
9
73
44
0
0
55
0.99
125134553--125134605
16
3.3
16
86
0
79
30
11
3
54
1.53
125136894--125136951
29
2.0
29
93
0
98
36
15
13
34
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125139266--125139300
15
2.3
15
95
0
61
62
11
0
25
1.28
125141204--125141254
25
2.0
25
100
0
102
33
11
19
35
1.88
125141617--125141708
30
3.3
29
71
22
88
15
43
5
35
1.69
125141608--125141790
6
30.5
6
68
2
71
14
41
2
40
1.60
125141595--125141736
54
2.6
54
80
0
158
14
40
3
40
1.63
125141687--125141789
24
4.5
24
75
14
101
13
39
0
45
1.50
125141608--125141790
42
4.5
42
74
10
164
14
41
2
40
1.60
125141672--125141845
66
2.6
66
80
0
168
14
39
3
43
1.62
125143417--125143497
37
2.2
36
82
8
92
29
7
1
61
1.31
125143486--125143575
26
3.6
23
77
16
74
22
2
1
74
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433