Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  108  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33145481--33145539
28
2.1
28
84
6
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30
16
1
50
1.55
33148555--33148628
31
2.4
30
81
16
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54
4
0
41
1.19
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20
1.9
20
88
0
58
36
28
13
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1.91
33164578--33164685
54
2.0
54
96
0
198
25
17
21
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1.95
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4.5
26
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19
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23
21
21
33
1.97
33172740--33172818
28
2.8
28
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0
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29
1.91
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2.3
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10
108
29
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1.98
33194766--33194824
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4.3
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1
10
44
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33194772--33194824
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1.42
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22
1.9
21
85
14
57
39
0
14
46
1.45
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23
2.0
23
86
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51
6
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22
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1.8
92
89
1
270
21
21
29
28
1.98
33212378--33212456
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2.3
35
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14
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44
1
5
49
1.32
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44
2.1
44
86
8
125
22
21
21
33
1.97
33213553--33213644
47
2.0
47
86
4
132
23
20
22
32
1.98
33213549--33213653
47
2.2
47
81
3
131
21
19
24
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1.96
33213707--33213856
39
3.9
39
82
0
185
39
11
12
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1.78
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13
100
0
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7
0
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100
0
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29
9
16
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219
2.0
224
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4
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25
13
22
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3.0
111
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15
16
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1.89
33231010--33231084
37
2.0
37
97
0
141
26
12
10
50
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33231704--33231755
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1.9
27
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0
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19
5
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1.73
33239592--33239662
35
2.0
35
94
0
124
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14
18
35
1.90
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2
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2
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48
0
0
51
1.00
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3
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0
28
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2.0
41
92
0
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7
12
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1.69
33249184--33249213
11
2.7
11
94
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51
50
0
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40
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33249564--33249604
19
2.0
22
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43
19
2
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33251840--33251877
20
1.9
20
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0
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18
13
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1.89
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24
2.2
25
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3
76
40
18
20
21
1.92
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52
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10
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22
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1.96
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164
21
17
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1.96
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2.0
50
93
0
169
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13
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1.83
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1.9
73
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3
222
47
10
2
38
1.54
33288035--33288133
28
3.5
28
83
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110
27
14
26
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1.94
33295245--33295343
28
3.5
28
84
4
119
29
14
25
31
1.94
33299019--33299101
26
3.3
26
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39
1.61
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2.2
50
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211
44
3
13
37
1.62
33303666--33303810
47
3.1
46
74
5
139
22
13
28
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1.93
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27
3.9
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95
16
11
37
35
1.84
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18
1.9
18
94
0
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17
2
8
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1.23
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16
1.9
16
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35
22
0
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1.54
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20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33312268--33312312
23
1.9
23
86
4
63
22
22
13
42
1.88
33312381--33312635
55
4.8
54
76
8
195
20
24
18
36
1.95
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44
2.0
44
93
0
153
27
2
27
42
1.67
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9
3.1
9
100
0
56
32
10
0
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1.9
21
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41
2
0
56
1.13
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26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
33330346--33330420
26
2.8
26
84
8
80
34
20
12
33
1.89
33330524--33330636
27
4.2
27
82
3
120
16
24
23
35
1.95
33330522--33330636
54
2.1
54
87
3
160
16
24
23
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1.95
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47
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0
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18
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1.81
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46
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256
22
19
28
29
1.98
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93
2.9
93
94
0
460
22
20
28
28
1.98
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13
186
22
19
27
30
1.98
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2.4
25
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10
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0
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0
0
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0
0
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0
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21
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2
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34
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21
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3
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1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
28
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433