Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  6  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1729872--1730250
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0
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0
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2.6
28
78
2
87
21
36
20
22
1.96
1759069--1759142
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
1761144--1761198
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7
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3
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1.23
1761652--1761744
10
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23
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2
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1.40
1767350--1767392
20
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21
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6
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0
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24
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2.3
17
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4
51
50
5
0
44
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1787923--1787977
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2.2
26
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1
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2.1
31
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2
112
26
0
12
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12
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0
0
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0.92
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2.0
26
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1
0
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1.08
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25
22
25
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33
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38
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2
296
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26
21
21
1.98
1794990--1795191
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2.6
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296
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29
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10
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0
0
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3.0
12
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0
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27
25
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1.77
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5.2
72
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406
28
17
21
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1821399--1821748
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2.5
142
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456
28
18
22
31
1.97
1822831--1822869
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2.3
17
86
8
53
17
10
0
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1.12
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2.0
29
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22
10
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6
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0
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16
16
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11
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11
100
0
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17
2.7
16
78
7
52
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11
0
79
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21
2.5
20
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6
57
32
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
13
100
0
50
4
32
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1.47
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2.4
24
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0
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26
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8
61
1.42
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23
3.2
22
74
23
64
36
1
2
60
1.20
1845361--1845434
25
3.0
24
81
15
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35
1
2
60
1.19
1845356--1845416
18
3.2
18
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17
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1
1
59
1.17
1845356--1845430
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2.0
39
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2
60
1.20
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2
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2
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2
63
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2.1
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100
0
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9
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2.8
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17
30
21
1.96
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3.1
131
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2
571
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17
30
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1.96
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24
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1.42
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11
57
35
12
7
45
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1894989--1895018
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
1895202--1895264
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2.2
28
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5
72
14
11
3
71
1.26
1897664--1897728
9
6.8
9
75
13
58
60
1
3
35
1.22
1897691--1897742
27
1.9
27
92
0
86
57
1
3
36
1.28
1904995--1905295
92
3.3
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80
6
279
31
9
13
45
1.76
1918434--1918713
141
2.0
141
90
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438
27
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20
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1918897--1919308
142
2.9
142
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1
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28
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1919505--1920200
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141
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20
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51
0
10
0
90
0.47
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118
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361
32
19
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21
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6
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28
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15
2.1
15
94
0
55
28
15
12
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2
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0
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48
0
0
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1.00
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2
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0
50
52
0
0
48
1.00
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15
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2
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1.24
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19
2.2
20
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34
2
2
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1.21
1943833--1943869
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20
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1.04
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104
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13
2.9
14
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13
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54
0
0
45
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16
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0
0
40
0.97
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18
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4
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51
0
2
46
1.14
1968380--1968437
28
2.1
28
84
12
75
56
6
3
32
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1968616--1968758
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76
84
10
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1
2
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1.22
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15
2.4
15
90
9
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47
44
8
0
1.33
1977249--1977297
25
2.0
25
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4
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63
8
0
28
1.23
1977261--1977325
25
2.9
23
82
15
75
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9
0
24
1.21
1977287--1977325
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20
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71
10
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1.12
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2.00
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24
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23
2.00
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4
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1.32
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2.6
26
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0
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19
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1
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1.23
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10
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0
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0
0
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1.9
19
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24
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0
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24
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1.41
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1.43
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0
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0
0
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3.8
11
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0
57
57
4
14
23
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2042609--2042667
22
2.7
22
78
0
73
66
5
10
18
1.40
2042653--2042700
22
2.2
22
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0
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1.26
2043727--2043811
42
2.0
42
100
0
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57
4.7
57
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0
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25
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2049208--2049509
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24
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23
26
2.00
2050144--2050200
22
2.5
24
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1
5
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1.9
13
100
0
50
12
32
32
24
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433