Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr06 132263754 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  30  of  433  ( 51894 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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40
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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10
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1.57
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7846054--7846156
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11.2
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0
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503
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32
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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127
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2.0
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
7869266--7869334
29
2.4
29
97
2
131
71
2
20
5
1.20
7869928--7870108
48
3.8
48
85
2
229
28
18
24
28
1.98
7875471--7875531
32
1.9
32
96
0
113
44
14
9
31
1.78
7875616--7875681
23
2.9
23
73
10
64
40
1
0
57
1.08
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6
4.8
6
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8
51
3
16
0
80
0.85
7878820--7878849
13
2.4
13
94
5
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3
16
0
80
0.85
7885474--7885523
24
2.1
24
100
0
100
16
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24
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1.95
7886002--7886054
17
3.1
17
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54
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0
41
1.18
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1.9
223
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14
34
1.83
7888072--7888142
25
2.9
25
77
10
83
16
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22
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19
2.2
20
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2.2
22
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2
20
1.18
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25
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25
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7903444--7903539
50
1.9
50
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0
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17
28
18
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1.94
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478
2.2
477
93
0
1768
26
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1.95
7916382--7916412
6
5.0
6
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19
48
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1.49
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1.93
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6.5
6
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0
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2.0
20
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0
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1.03
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27
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27
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3
18
50
1.63
7931292--7931351
9
6.7
9
78
0
66
28
3
18
50
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7934713--7934808
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1.9
49
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2
120
41
13
6
38
1.70
7935010--7935086
31
2.5
31
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0
109
28
11
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1.53
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138
2.3
138
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0
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8
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1.77
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1.9
17
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0
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0
0
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1.88
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2.0
59
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1.97
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2
20.5
2
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0
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0
0
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3.2
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25
1.81
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1.90
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12
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0
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0.87
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27
2.1
27
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0
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10
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1.67
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19
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18
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1.58
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21
2.0
21
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9
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34
1.85
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20
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0
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1.12
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24
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13
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0
3
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1.18
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2
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2
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0
0
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7988003--7988133
18
7.1
18
71
23
60
60
0
5
33
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7988039--7988152
20
5.7
20
74
18
78
60
0
3
35
1.14
7988089--7988170
29
2.9
30
77
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1
1
32
1.09
7988039--7988161
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3.1
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119
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0
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0
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14
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1.47
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0
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45
74
13
252
25
28
18
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433