Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  391  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121615146--121615432
137
2.1
137
96
0
529
25
18
24
31
1.98
121616494--121616521
3
9.3
3
100
0
56
0
32
0
67
0.91
121616721--121616850
41
3.2
41
73
13
124
35
21
23
20
1.96
121616737--121616870
41
3.3
42
77
9
143
37
21
20
20
1.95
121616695--121616870
41
4.4
38
71
15
115
37
21
20
21
1.94
121616843--121617114
41
6.6
41
86
3
368
24
19
27
28
1.99
121617267--121617302
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
121617569--121617611
22
2.0
22
85
0
59
23
0
34
41
1.55
121617580--121617673
23
3.5
29
72
19
78
21
0
40
38
1.53
121617595--121617699
29
3.9
29
71
17
82
20
0
38
40
1.53
121619831--121619876
23
2.0
23
100
0
92
26
8
30
34
1.86
121622929--121622971
17
2.4
17
80
7
50
65
4
0
30
1.13
121622997--121623135
43
3.3
43
83
1
172
28
16
27
28
1.97
121624052--121624551
125
4.0
125
83
3
578
28
17
16
38
1.91
121624056--121624551
251
2.0
251
85
3
676
28
17
15
38
1.91
121624638--121624747
34
3.2
33
83
5
139
42
15
1
40
1.57
121625200--121625250
3
17.0
3
100
0
102
66
0
0
33
0.92
121625249--121625281
3
11.0
3
100
0
66
33
0
0
66
0.92
121637336--121637412
33
2.3
32
82
10
93
25
24
16
32
1.96
121637426--121637464
2
19.5
2
94
0
69
51
2
0
46
1.14
121643221--121643271
25
2.0
25
100
0
102
25
15
11
47
1.80
121648004--121648043
19
2.2
18
86
13
55
32
2
7
57
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121651016--121651078
24
2.6
24
80
5
74
36
20
25
17
1.94
121652668--121652697
12
2.5
12
94
0
51
43
10
3
43
1.54
121660008--121660225
96
2.3
96
80
6
246
26
29
18
25
1.98
121664762--121664800
2
19.5
2
100
0
78
51
0
0
48
1.00
121677798--121677828
9
3.4
9
95
0
53
16
12
19
51
1.76
121683180--121683240
9
6.3
9
71
14
50
60
3
3
32
1.29
121686695--121686723
2
15.0
2
92
7
51
48
0
0
51
1.00
121688933--121688965
15
2.3
14
94
5
57
45
0
0
54
0.99
121701243--121701302
30
2.0
30
100
0
120
50
20
10
20
1.76
121702102--121702172
31
2.4
27
78
15
79
56
5
7
30
1.49
121705129--121705153
12
2.1
12
100
0
50
16
8
0
76
1.02
121711728--121712533
44
17.8
44
70
11
394
33
15
20
30
1.94
121711727--121712346
89
6.9
89
73
10
344
32
15
20
30
1.94
121711729--121712128
131
3.0
132
76
9
371
33
15
21
30
1.93
121711998--121712527
227
2.3
225
79
4
598
33
16
19
30
1.94
121712251--121712346
45
2.1
45
90
0
147
36
15
19
28
1.93
121714220--121714244
12
2.1
12
100
0
50
16
8
0
76
1.02
121716858--121716894
3
12.3
3
94
0
65
2
32
64
0
1.07
121718550--121718588
20
2.1
18
85
9
51
69
2
0
28
1.02
121719072--121719142
29
2.4
30
83
9
92
42
14
9
33
1.78
121719306--121719342
2
18.5
2
94
0
65
51
2
0
45
1.15
121719456--121719500
2
23.0
2
95
4
83
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121722091--121722122
15
2.1
15
94
0
55
21
0
56
21
1.43
121725902--121726018
40
2.9
39
88
6
155
33
18
10
37
1.85
121726890--121726963
30
2.7
27
80
13
80
2
24
4
68
1.19
121728385--121728500
31
3.7
31
85
0
169
26
18
28
26
1.98
121728478--121728544
29
2.3
29
81
0
71
34
11
26
26
1.91
121728534--121728708
33
5.3
33
85
0
206
33
8
22
36
1.85
121732072--121732114
4
11.0
4
80
5
52
20
6
0
72
1.08
121732086--121732120
11
3.1
11
91
4
52
14
11
0
74
1.08
121732208--121732345
56
2.4
56
84
4
179
29
6
2
60
1.36
121733507--121733553
23
2.0
23
100
0
94
48
12
21
17
1.79
121736384--121736410
13
2.1
13
100
0
54
55
7
0
37
1.28
121741461--121741512
22
2.4
22
90
0
77
32
17
17
32
1.93
121742625--121742672
24
2.0
24
95
0
87
22
16
43
16
1.87
121747874--121748050
50
3.5
50
88
2
257
35
16
21
26
1.94
121748028--121748225
31
6.4
31
92
0
297
29
18
25
25
1.98
121748235--121748263
7
4.1
7
100
0
58
44
13
27
13
1.82
121756441--121756517
13
5.9
13
85
0
100
29
7
27
35
1.85
121756441--121756517
39
2.0
39
89
0
118
29
7
27
35
1.85
121763179--121763247
26
2.6
26
75
11
68
20
11
0
68
1.20
121764175--121764223
21
2.3
22
85
3
64
30
6
0
63
1.19
121777840--121777897
6
9.5
6
75
9
55
77
8
0
13
0.98
121777838--121777897
19
3.2
19
74
11
61
76
8
0
15
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121782404--121782574
93
1.8
93
94
0
306
27
29
21
21
1.98
121782396--121782571
46
3.8
46
81
10
214
28
29
21
21
1.98
121784962--121785009
15
3.2
15
80
11
62
58
14
14
12
1.64
121794834--121794867
6
5.7
6
100
0
68
0
17
32
50
1.47
121801201--121801419
47
4.7
47
72
9
160
24
28
19
26
1.99
121801205--121801412
93
2.2
95
81
2
242
25
29
18
26
1.98
121807164--121807217
27
2.0
27
85
0
72
40
7
12
38
1.72
121807436--121807775
150
2.3
150
94
0
599
25
17
26
30
1.97
121807442--121807788
50
6.9
50
81
2
401
25
17
26
29
1.98
121807442--121807830
150
2.6
149
87
4
480
26
17
26
29
1.98
121808338--121808378
5
7.6
5
84
15
55
39
0
0
60
0.96
121808337--121808371
16
2.3
15
95
5
61
37
0
0
62
0.95
121809853--121809878
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
121810176--121810200
6
4.2
6
100
0
50
16
16
16
52
1.76
121810077--121810196
45
2.7
45
92
0
195
18
19
20
41
1.90
121810363--121810514
72
2.1
72
80
7
166
38
11
14
35
1.83
121810379--121810560
18
10.1
18
75
8
138
36
12
14
36
1.84
121810587--121810655
36
1.9
36
84
0
93
43
8
8
39
1.66
121815506--121815574
35
2.0
35
88
5
104
17
13
27
42
1.86
121815509--121815602
29
3.0
29
74
16
89
19
11
27
41
1.86
121817768--121817825
29
2.0
29
96
0
107
25
3
18
51
1.62
121818991--121819019
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121820112--121820136
5
5.0
5
100
0
50
20
0
0
80
0.72
121822545--121822588
22
2.0
22
82
8
54
38
13
18
29
1.89
121822815--121823036
40
5.6
40
91
1
349
28
26
22
22
1.99
121828161--121828204
2
22.0
2
100
0
88
50
0
0
50
1.00
121830442--121830505
33
1.9
33
87
6
94
20
21
7
50
1.73
121833469--121833600
35
3.6
36
82
9
151
33
24
10
31
1.89
121840910--121841041
35
3.6
36
82
9
151
33
24
10
31
1.89
121850057--121850110
12
4.7
12
76
17
51
66
11
0
22
1.22
121850040--121850098
21
2.8
22
77
12
61
69
8
0
22
1.15
121854734--121854891
83
1.9
83
85
0
217
39
13
17
28
1.88
121854834--121854942
45
2.4
45
81
3
130
41
16
17
24
1.89
121869279--121869406
50
2.6
50
80
10
147
25
30
17
26
1.98
121869231--121869406
96
1.8
96
85
8
248
24
30
18
26
1.98
121869329--121869585
44
5.5
46
73
12
154
23
28
17
29
1.97
121873169--121873195
12
2.2
12
100
0
54
62
0
7
29
1.22
121877317--121877396
39
2.1
39
97
0
151
28
15
15
41
1.87
121878840--121878899
31
1.9
31
86
6
86
60
10
0
30
1.30
121881213--121881323
47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
121888471--121888581
47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
121894487--121894526
21
1.9
21
85
10
55
55
10
0
35
1.34
121896094--121896154
27
2.4
26
81
13
65
26
4
1
67
1.20
121897491--121897795
161
1.9
161
82
6
386
31
17
8
43
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121897643--121897940
87
3.4
86
85
3
330
32
15
11
40
1.82
121897903--121898104
81
2.5
81
80
4
205
32
9
11
46
1.74
121903270--121903299
10
3.0
10
100
0
60
10
30
0
60
1.30
121904770--121904898
50
2.5
51
88
5
190
36
15
22
25
1.93
121904874--121905053
31
5.8
31
91
2
272
27
19
27
25
1.99
121905086--121905255
47
3.6
47
88
0
243
27
14
26
31
1.95
121905226--121905340
42
2.7
43
85
4
144
30
15
25
28
1.96
121906839--121906865
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
121907103--121907285
39
4.7
39
95
0
321
22
26
20
29
1.99
121912356--121912536
39
4.6
39
91
1
292
23
26
19
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433