Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  411  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126662152--126662196
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2.4
18
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0
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1.17
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1.15
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9
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1.60
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2.0
30
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32
0
3
64
1.09
126666571--126666611
21
2.0
21
86
9
59
39
0
0
60
0.96
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16
2.0
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50
69
0
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21
1.15
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2.5
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3.0
130
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0
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0
0
64
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3
43
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2.2
19
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59
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0
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0
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2
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0
76
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126711121--126711186
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20
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1
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2.7
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9
83
56
0
1
42
1.07
126711125--126711208
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64
60
0
4
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2
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2
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46
3
0
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34
94
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49
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0
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95
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4.0
366
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17
26
1.97
126722718--126724190
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2.0
735
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0
2358
29
26
17
26
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4.0
127
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0
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20
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1.85
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19
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10
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1.82
126727350--126727446
36
2.5
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90
9
151
36
15
10
38
1.82
126727372--126727428
17
3.5
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15
10
38
1.82
126728033--126728646
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14.0
44
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555
27
23
16
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176
2.2
176
94
0
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28
24
15
31
1.96
126728034--126728646
132
4.6
131
88
3
718
27
23
16
31
1.96
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23
2.1
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4
10
0
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2.2
21
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3
58
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21
8
34
1.84
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19
2.9
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18
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35
17
9
37
1.83
126735231--126735273
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91
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72
34
18
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1.83
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14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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2.1
23
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62
34
0
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1.15
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17
2.1
16
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10
52
44
0
20
35
1.52
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3
19.7
3
77
17
57
62
0
3
33
1.12
126750186--126750233
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8
78
11
55
60
0
4
35
1.16
126753418--126753473
10
5.6
10
83
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66
1
8
23
1.30
126754127--126754313
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1.9
97
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30
25
14
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1.95
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1.9
16
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0
3
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0.98
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12
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1.00
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6
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1.22
126761226--126761285
20
3.0
19
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9
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1
6
23
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112
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2.1
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100
0
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26
26
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27
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0
0
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0
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4
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136
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26
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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3
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1.38
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137
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0
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19
24
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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10.8
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83
60
0
4
34
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433