Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  396  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122907400--122907458
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1.9
31
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0
0
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0
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2.3
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0
87
39
0
2
58
1.10
122928035--122928081
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20
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38
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2.0
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0
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5
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26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
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12
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11
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3
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2
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68
20
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3
2
34
1.28
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11
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0
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1
0
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22
58
61
0
1
36
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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28
2.1
29
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66
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3
8
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15
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2.0
25
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16
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23
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100
0
58
41
0
0
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20
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1.99
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3.7
28
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85
26
19
27
26
1.99
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1.9
30
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18
25
31
24
1.98
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2.4
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4
58
27
32
18
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1.97
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12.9
11
72
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40
14
21
1.91
123037100--123037142
22
1.9
23
85
4
61
27
32
20
18
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123040681--123040711
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1.9
16
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3
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1.42
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2.6
20
79
5
54
62
1
0
35
1.06
123042415--123042471
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5.6
10
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10
62
59
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0
38
1.08
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2.4
19
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13
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1.23
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14
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137
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2.1
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24
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2.8
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10
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21
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0
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3
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35
2.0
35
100
0
142
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15
5
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1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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5.1
40
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25
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2.5
80
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1
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26
21
27
25
1.99
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40
5.1
40
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4
223
26
21
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24
1.99
123144358--123144561
80
2.5
80
81
1
248
26
21
27
24
1.99
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1.9
20
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46
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0
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.9
229
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2.0
20
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0
17
0
82
0.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123217687--123217754
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1.52
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0
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29
11
8
50
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433