Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  380  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118782146--118782194
21
2.3
21
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0
62
26
28
22
22
1.99
118783847--118783884
18
2.1
18
90
0
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28
10
10
50
1.70
118787532--118787625
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2.2
43
81
7
102
27
19
24
28
1.98
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29
2.0
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100
0
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10
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118794583--118794703
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2.6
47
95
0
215
38
12
24
23
1.90
118794682--118794890
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3.9
54
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251
35
17
24
22
1.95
118795285--118795352
22
3.2
22
61
23
54
29
16
11
42
1.83
118795276--118795358
42
2.0
42
100
0
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12
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24
31
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2.0
22
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8
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17
0
1.25
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2.2
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100
0
58
31
0
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55
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4.2
40
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2
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24
26
22
26
2.00
118817341--118817507
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
118822459--118822624
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4.2
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82
3
185
24
27
22
26
2.00
118822475--118822584
39
2.8
39
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4
141
23
29
23
23
1.99
118830449--118830615
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
118839515--118839699
79
2.3
81
82
7
218
24
27
23
24
2.00
118839482--118839699
40
5.5
39
74
8
154
24
27
22
24
2.00
118849126--118849176
20
2.5
20
90
0
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15
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31
19
1.93
118853917--118853980
6
11.5
6
74
12
57
78
0
4
17
0.92
118853923--118853980
21
2.7
22
83
5
82
77
0
5
17
0.94
118853930--118853977
16
3.1
16
88
8
73
77
0
6
16
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118871427--118871464
17
2.2
17
95
0
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21
7
10
60
1.54
118871687--118871734
21
2.2
21
96
3
87
45
18
8
27
1.78
118876515--118876600
39
2.2
39
97
0
163
19
4
30
45
1.71
118878531--118878567
14
2.8
13
88
11
58
21
5
10
62
1.48
118890113--118890184
24
3.0
24
85
6
92
48
0
23
27
1.51
118890194--118890253
30
2.0
30
96
0
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36
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21
23
1.95
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2.1
32
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15
90
40
1
1
57
1.17
118897048--118897088
20
1.9
23
85
14
61
21
4
14
58
1.55
118922941--118922978
14
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81
11
51
18
13
10
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1.63
118923900--118923978
39
2.0
39
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0
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38
2.0
38
94
0
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24
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14
2.9
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11
51
57
10
13
18
1.63
118945994--118946019
4
6.5
4
100
0
52
76
0
0
23
0.78
118973314--118973353
13
3.1
13
81
0
53
35
30
7
27
1.84
118974237--118974346
57
1.9
58
84
1
150
43
10
17
28
1.82
118977272--118977443
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
118977264--118977439
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
118979968--118980018
24
2.1
24
82
13
61
68
1
3
25
1.17
118980985--118981106
44
2.8
43
81
5
145
26
16
18
38
1.92
118981653--118981716
30
2.0
34
85
14
91
32
3
6
57
1.39
118984608--118984677
6
11.5
6
73
14
63
78
4
2
14
1.02
118987703--118987912
39
5.3
39
87
1
215
21
23
26
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118987732--118987926
78
2.5
79
82
1
248
20
23
27
28
1.99
118989696--118989759
3
21.3
3
87
6
94
64
0
1
34
1.03
118989667--118989746
21
3.7
21
77
13
65
63
2
3
30
1.25
118992178--118992217
21
1.9
21
89
0
62
25
35
2
37
1.69
118993757--118993802
6
8.0
6
85
4
51
80
0
4
15
0.86
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2.8
12
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50
14
5
2
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1.09
119015947--119016082
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2.2
62
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175
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24
25
27
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16
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0
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0
0
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54
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0
0
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0.79
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2.2
19
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0
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0
0
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0
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2.5
20
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0
0
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10
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13
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Indices
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Size
Copy
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Size
Percent
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Percent
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
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Size
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433