Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  9  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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0
50
50
0
2
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29
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56
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0
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19
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25
2.0
25
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52
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2
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2.2
19
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8
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65
27
0
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1.18
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3.9
22
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4
91
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28
1
9
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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132
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132
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22
19
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1.97
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22
19
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2.9
68
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21
22
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21
20
21
36
1.96
2693405--2694044
132
4.9
132
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7
528
21
20
21
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66
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35
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1
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1.02
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29
2.0
31
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55
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3.2
51
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211
28
23
15
32
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2.2
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95
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201
28
23
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0
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0
0
50
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1.9
18
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2
0
32
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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0
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2.1
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1.43
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6
52
33
8
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2757679--2758919
72
16.4
72
77
10
977
32
20
16
30
1.95
2757674--2759224
144
10.4
144
82
10
1643
32
20
16
30
1.95
2758402--2758541
73
1.9
73
89
2
219
30
20
16
32
1.95
2758478--2758636
86
1.9
86
88
5
243
33
20
16
29
1.95
2758394--2759224
151
5.6
146
82
10
917
31
20
16
31
1.95
2758861--2758977
58
2.0
59
91
1
191
30
25
18
24
1.98
2758923--2759228
71
4.1
73
86
8
415
32
19
16
31
1.94
2759174--2759387
89
2.4
89
82
9
253
35
21
14
28
1.93
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40
4.8
39
78
7
172
23
28
24
24
1.99
2761900--2762050
78
1.9
80
85
5
209
23
28
23
25
1.99
2769886--2770076
40
4.8
39
78
7
172
23
28
24
24
1.99
2769926--2770076
78
1.9
80
85
5
209
23
28
23
25
1.99
2775350--2775417
25
2.9
24
82
6
77
58
5
5
29
1.45
2775847--2775885
16
2.4
16
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0
51
43
28
5
23
1.75
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28
3.2
30
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7
118
20
6
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26
1.75
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22
2.0
22
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0
63
0
31
0
68
0.89
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37
2.6
37
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5
5
58
1.41
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12
3.0
12
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0
54
25
22
5
47
1.73
2782867--2782909
18
2.4
18
85
14
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41
0
4
53
1.21
2782887--2782964
3
25.7
3
82
12
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1
2
61
1.18
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3
13.0
3
88
0
60
33
5
0
61
1.18
2783273--2783297
12
2.1
12
100
0
50
32
16
0
52
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
76
90
0
228
26
15
24
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61
2.0
61
93
0
208
33
17
24
24
1.96
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137
2.0
137
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4
383
29
17
24
28
1.97
2790863--2791007
74
1.9
74
90
2
227
31
20
22
26
1.98
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92
2.0
88
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6
237
29
19
19
31
1.97
2791012--2791173
74
2.1
76
86
6
222
31
19
19
29
1.97
2790861--2791203
166
2.1
166
95
1
618
31
19
19
30
1.96
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2
20.5
2
94
0
73
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2
0
48
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2.1
14
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0
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20
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1.89
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16
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15
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0
1
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1.08
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12
2.1
12
100
0
50
40
24
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16
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17
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31
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0
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5
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5
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0
54
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0
0
22
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20
2.0
20
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5
60
63
0
0
36
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19
2.1
19
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0
0
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0.93
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24
2.0
24
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0
60
50
2
6
41
1.39
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47
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6
145
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23
15
25
1.94
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4
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4
100
0
58
0
24
0
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18
11.4
18
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18
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60
2
7
29
1.37
2814164--2814249
3
28.3
3
73
19
65
65
1
3
30
1.17
2814164--2814246
12
6.8
12
76
16
73
65
1
3
30
1.17
2814169--2814249
18
4.4
18
79
13
76
65
1
3
29
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2814164--2814250
27
3.4
27
71
19
78
65
1
3
29
1.16
2814581--2814621
21
2.0
20
90
4
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68
26
0
4
1.10
2814577--2814677
23
4.5
22
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14
82
57
32
0
8
1.36
2815129--2815890
44
17.3
44
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566
25
23
19
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1.98
2815109--2815952
132
6.4
132
97
0
1562
25
23
19
31
1.98
2816005--2816203
68
2.9
68
90
2
303
26
22
23
27
1.99
2816275--2816904
43
14.4
43
75
8
425
20
21
23
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1.96
2816308--2816916
132
4.6
132
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901
19
21
23
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1.96
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2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
2825526--2825654
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433