Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          433   

This is table  410  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126389099--126389207
26
4.2
26
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1
175
35
24
5
33
1.79
126392909--126393192
136
2.1
135
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0
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31
25
18
24
1.97
126393199--126393246
21
2.3
21
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7
62
33
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2
12
1.51
126393439--126393491
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
126394968--126395076
26
4.2
26
96
1
175
35
24
5
33
1.79
126395898--126396010
39
2.9
39
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108
35
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5
53
1.49
126396123--126396164
15
2.9
15
80
20
54
26
0
7
66
1.17
126406222--126407190
222
4.3
223
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16
18
32
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1178
31
16
18
32
1.93
126406222--126407190
448
2.2
442
88
4
1426
32
16
18
32
1.93
126407116--126407286
92
1.9
92
85
2
236
27
21
19
32
1.97
126407188--126407569
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78
11
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28
18
18
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126407366--126407527
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1.8
88
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236
25
17
19
36
1.94
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2.1
30
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90
19
11
27
41
1.85
126406964--126407778
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3.3
246
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6
790
28
17
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1.94
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2.6
18
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0
85
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0
4
1.08
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2
18.0
2
94
0
63
47
0
2
50
1.15
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27
2.2
29
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17
71
37
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48
1.56
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15
1.9
15
100
0
58
55
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0
37
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10
2.7
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100
0
54
40
0
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51
1.30
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2.1
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61
47
0
0
52
1.00
126434725--126434766
18
2.3
19
83
4
50
35
4
4
54
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126440464--126440543
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1.9
41
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2
151
17
17
10
55
1.69
126447126--126447171
17
2.9
17
78
15
53
30
0
2
67
1.03
126452675--126452728
9
5.7
10
87
10
78
62
0
0
37
0.95
126452675--126452728
19
2.9
19
84
13
76
62
0
0
37
0.95
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18
1.9
18
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48
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5
42
1.41
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2.2
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0
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2.0
42
95
0
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3
26
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100
0
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0
0
50
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16.5
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100
0
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0
0
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12
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0
55
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3
0
34
1.11
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4.4
21
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29
28
28
14
1.95
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15
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2
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12
0
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126465712--126465737
13
2.0
13
100
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15
38
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126466010--126466047
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53
55
0
7
36
1.29
126467418--126467464
23
2.0
25
88
12
73
42
0
25
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126467607--126467678
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22
18
27
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1.97
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2
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100
0
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51
0
0
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54
65
0
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31
1.05
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2.6
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11
82
34
2
0
62
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126480364--126480510
80
1.9
80
82
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192
37
23
18
20
1.94
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184
41
16
13
28
1.87
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1.9
127
95
0
449
38
17
13
30
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126489007--126489046
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25
25
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2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
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17
1.9
17
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57
37
15
9
37
1.80
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2
24.0
2
86
8
60
43
0
2
54
1.12
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2.0
41
100
0
166
48
0
9
42
1.36
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2.1
22
100
0
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36
0
17
46
1.48
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510
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0
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1.00
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0
0
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2.0
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14
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0
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2
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2.3
15
90
5
52
82
0
17
0
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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6
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9
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26
8
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126521715--126521765
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2
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0
0
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126522271--126522359
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126542684--126542740
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1.92
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2.2
105
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2.0
396
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1120
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16
29
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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18
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2.0
22
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0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
20
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0
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37
0
2
60
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433