Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  95  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28805310--28805528
120
1.8
121
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3
325
26
23
26
24
2.00
28805308--28805554
80
3.1
80
82
1
208
26
23
26
23
2.00
28810460--28810494
17
2.1
17
100
0
70
54
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17
17
1.71
28811343--28811424
43
1.9
43
82
7
105
24
17
24
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1.96
28818962--28819044
37
2.2
37
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116
34
22
14
27
1.93
28819047--28819390
120
2.9
120
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4
311
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20
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30
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1.98
28828921--28829220
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151
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28
18
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28831214--28831289
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2.0
38
100
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26
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11
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1.12
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10
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5
0
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1.24
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19
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70
50
4
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2
20.0
2
94
0
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50
2
0
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1.14
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5.5
27
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173
28
14
25
31
1.95
28847951--28848054
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2
16.0
2
93
0
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50
3
0
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1.17
28855768--28855921
27
5.5
27
82
4
173
28
14
25
31
1.95
28855818--28855921
55
1.9
55
100
0
208
26
13
24
35
1.92
28858103--28858194
43
2.1
43
93
0
157
28
25
20
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21
2.0
21
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23
4
23
47
1.70
28863028--28863069
15
2.8
15
81
0
57
61
2
4
30
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28863214--28863255
20
2.2
20
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4
50
50
7
7
35
1.57
28863513--28863579
29
2.3
29
80
15
75
52
2
4
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1.37
28866223--28866266
22
2.0
22
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4
6
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28867977--28868009
10
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10
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0
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2
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0
0
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28870995--28871095
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2
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5
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0
0
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1.30
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11
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11
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50
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9
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12
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0
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0.95
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44
3.6
44
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9
163
27
18
29
24
1.98
28901287--28901324
19
2.0
20
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60
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35
2.0
35
94
0
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55
1.9
55
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129
14
28
31
25
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16
1.9
16
100
0
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48
19
19
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169
30
12
25
31
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0
215
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10
24
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1.90
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13
1.9
13
100
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28
1.41
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3.7
42
77
11
124
23
17
25
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28948785--28948906
55
2.2
55
79
0
136
27
28
26
18
1.98
28949268--28949298
15
2.1
15
100
0
62
51
6
0
41
1.27
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23
2.0
23
87
0
67
23
34
8
34
1.85
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11
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12
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50
21
34
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34
1.87
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17
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17
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22
4
0
72
1.02
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22
23
28
25
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1.9
22
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1.70
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5.6
40
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5
274
23
21
28
26
1.99
28987026--28987250
83
2.8
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83
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269
23
21
28
26
1.99
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2
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0
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25
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1.96
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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22
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1.99
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71
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3.0
20
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37
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20
32
1.86
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11
5.4
11
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38
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20
30
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22
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0
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36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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170
27
19
26
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433