Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  244  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76067290--76067354
29
2.2
29
94
0
112
30
16
27
24
1.97
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29
2.1
29
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90
20
16
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1.67
76069679--76069731
26
2.0
26
100
0
106
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15
11
39
1.83
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14
2.3
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94
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53
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0
0
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0.99
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24
2.7
23
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15
60
53
1
3
41
1.25
76079180--76079404
49
4.5
49
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2
297
30
28
16
24
1.97
76079223--76079404
101
1.8
101
91
2
305
29
28
16
25
1.97
76086503--76086633
47
2.8
48
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5
176
22
16
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34
1.95
76086500--76086652
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146
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16
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1.95
76086885--76087028
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2.0
72
95
0
261
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10
10
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1.72
76091520--76091726
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1
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21
23
18
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17
2.4
17
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4
64
10
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20
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1.9
25
86
0
69
33
25
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1.96
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20
3.0
20
97
0
109
35
11
20
32
1.89
76098713--76098767
11
5.4
11
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16
55
36
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30
1.90
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1.99
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3.8
45
79
7
188
23
21
26
28
1.99
76101274--76101444
93
1.8
93
92
0
288
23
21
26
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1.99
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25
1.9
25
86
0
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35
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14
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1.93
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20
2.0
20
100
0
78
35
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20
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1.90
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24
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0
327
28
20
22
28
1.99
76113121--76113296
46
3.8
46
77
12
198
22
20
27
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76113118--76113288
93
1.8
93
92
0
288
23
21
27
28
1.99
76114613--76114778
55
3.1
52
73
6
143
19
22
19
37
1.94
76120775--76120823
19
2.8
18
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14
50
44
4
0
51
1.20
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400
3.7
400
97
0
2748
41
15
11
30
1.83
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49
12.3
49
94
2
967
31
8
30
29
1.86
76130498--76130809
40
7.8
40
95
0
525
25
21
27
25
1.99
76134535--76134999
49
9.7
49
94
2
750
31
7
30
30
1.85
76134535--76134999
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4.8
97
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2
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31
7
30
30
1.85
76135958--76138681
400
6.8
400
96
0
4968
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12
30
1.82
76135958--76138681
801
3.4
802
96
0
5087
42
14
12
30
1.82
76139863--76139947
3
28.0
3
73
19
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64
1
3
30
1.17
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12
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12
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16
73
65
1
3
30
1.17
76139868--76139927
18
3.2
18
82
13
75
63
1
3
31
1.20
76139863--76139944
25
3.2
27
70
19
77
64
1
3
30
1.18
76140286--76140319
18
1.9
17
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5
50
64
29
0
5
1.17
76140506--76140532
4
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4
100
0
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22
0
0
77
0.76
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3.2
16
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5
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7
5
25
1.45
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399
64.5
400
96
2
47785
42
14
11
30
1.82
76143667--76143718
16
3.2
16
91
5
79
61
7
5
25
1.45
76144882--76144933
16
3.2
16
91
5
79
61
7
5
25
1.45
76146489--76146540
16
3.2
16
91
5
79
61
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5
25
1.45
76148096--76148147
16
3.2
16
91
5
79
61
7
5
25
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76149311--76149362
16
3.2
16
91
5
79
61
7
5
25
1.45
76150916--76150967
16
3.2
16
91
5
79
61
7
5
25
1.45
76152927--76152978
16
3.2
16
91
5
79
61
7
5
25
1.45
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16
3.2
16
91
5
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7
5
25
1.45
76155749--76155800
16
3.2
16
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5
25
1.45
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16
3.2
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91
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5
25
1.45
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16
3.2
16
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5
79
61
7
5
25
1.45
76159393--76159424
16
1.9
17
93
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57
62
9
6
21
1.47
76160981--76161032
16
3.2
16
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79
61
7
5
25
1.45
76162593--76162644
16
3.2
16
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79
61
7
5
25
1.45
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16
3.2
16
91
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79
61
7
5
25
1.45
76165015--76165042
14
2.0
14
100
0
56
57
7
0
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1.26
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1.9
13
100
0
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16
32
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1.90
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0
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80
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3
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16
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16
2
1.01
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0
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12
19
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1.87
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18
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25
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27
8.8
27
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6
160
25
12
22
40
1.88
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2.2
27
87
0
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6
25
38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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81
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0
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6
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35
1.81
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27
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0
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1.81
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3.5
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2.00
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48
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0
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27
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35
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
23
27
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433