Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  44  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11889595--11889651
3
19.0
3
87
0
51
3
22
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40
1.71
11889591--11889641
18
2.8
18
81
0
66
5
17
33
43
1.73
11889592--11889650
15
3.9
15
84
0
73
3
20
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42
1.69
11890386--11890423
12
3.2
12
88
0
58
0
21
36
42
1.53
11890377--11890420
15
3.1
15
81
15
58
0
18
36
45
1.49
11893531--11893563
2
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2
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0
0
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11894065--11894131
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0
0
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1.00
11894100--11894137
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0
0
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57
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2.3
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26
0
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100
0
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2.2
34
90
5
112
12
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2.0
22
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0
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44
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20
17
1.87
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15
90
5
52
32
5
17
44
1.73
11915224--11915339
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3.6
34
83
8
147
42
0
15
41
1.53
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0
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18
2.0
18
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38
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27
25
1.84
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15
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15
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19
50
44
0
1
53
1.11
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2.6
22
83
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51
0
0
48
1.00
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16
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16
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3
3
22
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1.18
11925250--11925342
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2.1
44
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3
5
18
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1.16
11925294--11925329
17
2.1
17
90
10
56
0
8
2
88
0.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11925294--11925327
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11
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8
50
0
8
2
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0.62
11925975--11926551
88
7.0
83
70
16
281
36
18
16
27
1.93
11926143--11926204
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
11926299--11926333
14
2.6
14
90
4
54
51
5
14
28
1.65
11926351--11926691
72
4.5
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81
6
380
32
19
17
30
1.95
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171
2.9
167
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682
31
20
18
29
1.96
11926723--11926865
72
2.0
73
88
5
218
27
22
18
30
1.97
11926797--11926970
91
2.0
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86
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244
33
20
20
26
1.97
11926886--11927024
73
1.9
74
89
3
217
28
23
20
28
1.99
11926873--11929827
194
14.8
197
67
21
861
37
22
14
25
1.93
11927089--11927247
72
2.2
71
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237
40
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15
22
1.91
11927253--11927514
70
3.8
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325
37
22
14
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1.92
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3.0
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81
13
265
37
22
15
24
1.92
11927554--11927774
78
2.9
80
78
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232
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21
15
25
1.93
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1.9
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195
35
23
15
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1.94
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4.9
120
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10
465
36
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14
26
1.93
11927778--11928183
70
5.7
71
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527
37
22
14
25
1.92
11927778--11928183
71
5.7
69
84
4
506
37
22
14
25
1.92
11927778--11928183
141
2.9
141
94
1
688
37
22
14
25
1.92
11928292--11928458
72
2.3
73
87
5
243
41
20
14
22
1.90
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141
4.9
125
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14
435
36
22
14
25
1.93
11928458--11928863
72
5.7
71
82
6
511
37
22
14
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11928458--11928863
142
2.9
142
94
1
674
37
22
14
25
1.92
11927253--11929401
680
3.2
678
97
1
4013
37
22
14
25
1.92
11928905--11929067
86
1.9
86
85
2
229
38
21
15
23
1.92
11929138--11929401
70
3.8
70
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5
347
38
22
14
25
1.91
11929138--11929401
141
1.9
140
89
2
413
38
22
14
25
1.91
11929436--11929658
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3.1
70
83
5
306
38
22
14
25
1.92
11928975--11929825
258
3.3
257
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2
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37
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14
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1.92
11934877--11934912
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3.0
12
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5
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1.77
11936886--11936932
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2
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0
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48
0
2
48
1.13
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5
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16
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15
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0
0
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50
1.14
11948076--11948115
17
2.3
18
86
4
55
27
0
5
67
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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26
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27
1.99
11974012--11974129
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62
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24
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1.99
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0
55
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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50
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12088099--12088151
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0
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433