Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  58  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16550991--16551098
51
2.1
51
87
0
153
27
21
12
38
1.89
16553364--16553549
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3.8
46
76
10
165
29
29
16
24
1.96
16554614--16554697
21
4.0
20
75
10
69
39
25
17
17
1.92
16554904--16554987
28
3.0
28
87
1
114
45
29
4
20
1.71
16556488--16556607
51
2.4
51
89
0
177
25
22
13
38
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16558403--16558494
45
2.0
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100
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23
41
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21
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2
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45
1.23
16559188--16559289
13
6.8
14
70
25
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2
0
45
1.23
16559262--16559324
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15
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1
46
1.20
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48
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22
114
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3
0
42
1.24
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60
0
12
0
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2.6
16
88
7
57
0
14
0
85
0.60
16560088--16560128
8
5.1
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85
8
57
0
14
0
85
0.60
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8
11.2
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18
50
66
1
3
29
1.14
16560441--16560484
20
2.2
20
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0
52
68
4
0
27
1.09
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9
6.8
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3
29
1.24
16560544--16560613
29
2.4
29
79
6
81
60
5
2
31
1.35
16560962--16561192
84
2.7
84
90
2
347
38
20
9
31
1.86
16561385--16561429
12
3.8
12
82
5
56
20
17
11
51
1.75
16561515--16561558
24
1.9
23
86
9
63
34
13
9
43
1.76
16561754--16561801
18
2.6
18
76
3
60
58
0
4
37
1.18
16561754--16561842
37
2.4
37
81
9
110
61
0
3
34
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16561766--16561823
20
3.1
19
73
7
55
67
0
3
29
1.07
16562908--16563043
41
3.5
39
78
7
132
32
24
16
26
1.96
16563183--16563222
15
2.5
17
84
12
57
47
10
0
42
1.37
16563507--16564088
194
3.0
195
93
1
963
32
20
3
43
1.69
16565270--16565352
10
8.6
10
73
14
68
28
2
0
68
1.02
16565260--16565344
27
3.1
27
71
17
84
32
2
0
64
1.06
16565263--16565348
28
3.0
29
76
8
86
32
2
0
65
1.06
16565268--16565319
8
6.0
8
84
10
59
26
1
0
71
0.97
16565298--16565360
21
3.2
20
80
6
67
26
3
1
68
1.14
16565261--16565350
29
3.1
29
77
7
94
31
2
0
66
1.04
16565470--16565648
91
2.0
92
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1
270
34
8
21
35
1.84
16565464--16565673
91
2.3
91
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269
34
8
20
36
1.84
16565952--16565990
12
3.3
12
82
7
53
35
0
0
64
0.94
16566115--16566177
30
2.1
30
96
0
117
57
9
3
30
1.46
16566609--16566690
28
2.9
29
77
14
89
41
0
1
57
1.06
16566625--16566662
17
2.2
18
85
4
51
39
0
2
57
1.12
16566642--16566695
20
2.7
20
80
8
65
44
0
1
53
1.11
16566516--16566697
9
19.2
9
68
18
77
38
1
1
58
1.18
16567414--16567481
26
2.5
25
79
13
73
64
4
8
22
1.40
16571591--16572180
293
2.0
291
97
0
1117
42
18
10
28
1.83
16578538--16578681
39
3.7
39
88
0
216
21
29
22
26
1.99
16578529--16578680
78
1.9
79
90
1
243
23
28
23
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16581524--16581704
59
3.1
56
78
8
191
48
13
16
22
1.80
16581849--16581890
20
2.2
19
86
4
57
26
2
0
71
0.98
16581885--16581918
16
2.1
16
88
5
50
47
0
0
52
1.00
16581916--16582074
85
1.8
86
85
10
227
47
1
5
44
1.37
16583558--16583592
16
2.1
17
89
5
54
42
2
11
42
1.55
16585244--16585354
44
2.6
43
77
11
118
33
23
15
27
1.95
16590243--16590298
21
2.8
20
89
5
78
17
32
32
17
1.94
16591734--16591787
27
2.0
27
100
0
108
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33
18
1.67
16601008--16601039
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4.0
8
91
0
55
46
25
25
3
1.67
16601741--16601818
38
2.0
39
85
7
106
29
15
24
30
1.95
16608563--16608590
13
2.2
13
100
0
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17
28
39
14
1.89
16616182--16616400
120
1.8
121
92
1
377
32
20
17
29
1.95
16627863--16627887
13
1.9
13
100
0
50
48
20
0
32
1.50
16631095--16631175
24
3.4
24
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10
105
22
22
18
37
1.95
16631346--16631425
19
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19
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4
72
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0
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23
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16637408--16637573
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27
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2.00
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2
122
30
27
14
28
1.95
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18
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18
83
12
57
14
26
41
17
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16651511--16651761
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18
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109
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14
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1.89
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18
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0
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1.84
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0
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26
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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37
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1.98
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1.94
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3.3
22
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25
68
28
30
15
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16794185--16794476
50
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25
1.97
16794185--16794476
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2.9
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381
30
26
17
25
1.97
16794185--16794476
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1.97
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0
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16
36
40
8
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433