Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  62  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17725197--17725279
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3.0
28
80
0
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26
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30
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3.7
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21
18
28
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1.97
17739798--17739968
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1.8
93
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0
324
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19
29
29
1.98
17743019--17743057
10
3.8
10
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69
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30
1.94
17743018--17743057
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1.9
21
100
0
80
35
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17
30
1.93
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3.2
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174
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17753306--17753344
10
3.8
10
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6
69
33
17
17
30
1.94
17753305--17753344
21
1.9
21
100
0
80
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3.8
40
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0
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29
28
20
21
1.98
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2.1
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0
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2
88
5
56
45
0
5
48
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16
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2.1
31
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4.0
23
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11
122
26
23
21
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20
3.0
20
90
0
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20
11
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1.9
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0
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25
14
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3.2
27
77
0
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29
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25
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27
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390
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8
22
27
1.83
17770857--17771134
27
10.3
27
85
2
251
31
8
21
38
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17770984--17771151
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26
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2
174
31
7
19
41
1.78
17772232--17772340
40
2.7
40
88
2
157
23
26
22
27
1.99
17772235--17772383
40
3.7
40
83
5
142
24
25
24
25
2.00
17780287--17780438
40
3.8
40
85
5
175
24
26
23
25
2.00
17784087--17784152
27
2.4
27
87
5
80
27
24
16
31
1.96
17784376--17784413
19
2.0
19
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18
13
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1.8
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22
1.98
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3.8
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11
189
30
27
19
22
1.98
17803163--17803244
41
2.0
40
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2
101
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13
28
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1.94
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72
22
23
20
32
1.98
17804896--17805023
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2.8
46
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5
125
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21
18
35
1.96
17804956--17805022
24
3.0
22
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8
98
26
20
17
34
1.96
17804929--17805018
23
4.0
22
77
11
92
26
21
16
35
1.94
17805180--17805263
20
4.2
20
76
7
73
35
9
16
38
1.81
17806978--17807021
19
2.3
19
100
0
88
25
9
27
38
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17814010--17814048
21
1.9
21
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46
23
2
28
1.65
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3.1
84
93
0
426
46
7
7
38
1.59
17818172--17818260
20
4.4
20
72
14
76
10
37
21
31
1.87
17818161--17818260
40
2.5
40
81
3
121
10
37
21
32
1.86
17818396--17818429
7
4.9
7
96
0
50
38
5
14
41
1.70
17822875--17823076
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4.1
49
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0
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33
8
27
30
1.86
17823145--17823227
37
2.2
37
93
6
141
20
20
32
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17829755--17829811
6
9.5
6
100
0
114
0
17
49
33
1.47
17829819--17829873
6
9.2
6
93
0
92
32
16
36
14
1.89
17835966--17836000
15
2.3
15
95
0
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28
5
22
42
1.76
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20
1.9
19
85
15
51
28
0
10
60
1.30
17837276--17837309
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0
0
35
0.94
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2.6
31
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119
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3
0
54
1.18
17842272--17842400
31
4.4
29
74
19
110
42
3
0
53
1.19
17854234--17854450
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4.6
46
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147
24
26
19
29
1.98
17854281--17854453
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1.9
92
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24
27
20
28
1.99
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1.9
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153
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23
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4
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23
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
90
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0
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27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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26
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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2.00
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2
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24
28
23
23
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433