Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   

This is table  10  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2829700--2829925
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30
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2829700--2829925
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220
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30
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2.4
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30
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2836411--2836466
16
3.4
16
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32
3
32
32
1.75
2836406--2836475
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2.1
34
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0
131
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220
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6
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9
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1.8
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15
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2863160--2863287
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2.2
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175
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0
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1.9
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2.5
41
79
9
102
23
18
17
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
43
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38
26
6
27
1.82
2869851--2870242
41
9.6
41
84
5
381
25
18
22
33
1.96
2869851--2870242
122
3.2
122
80
4
439
25
18
22
33
1.96
2875306--2875360
16
3.4
16
94
0
101
36
7
27
29
1.84
2875346--2875434
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2.0
46
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5
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32
15
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107
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107
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7
440
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19
19
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2891020--2891198
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2.7
16
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0
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44
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144
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23
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2
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2
90
0
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0
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1.23
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3
40
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33
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127
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5
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1.19
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30
2.0
30
90
6
93
42
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6
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1.79
2933395--2933429
14
2.6
14
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4
54
51
5
14
28
1.65
2933324--2933485
88
1.8
88
89
2
254
37
19
16
26
1.92
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78
3.1
77
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7
288
35
18
17
29
1.93
2933505--2933826
168
1.9
164
85
5
441
33
19
18
28
1.96
2933656--2933881
75
3.0
75
85
5
287
31
22
18
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
27
1.94
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1.9
55
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153
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19
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1.89
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3.8
141
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4
910
38
20
15
24
1.92
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54
1.9
55
84
5
144
38
19
14
27
1.90
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13
2.5
13
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4
50
58
8
11
20
1.59
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71
2.5
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219
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23
13
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2
15.5
2
93
0
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0
3
48
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31
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3
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1.09
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2.5
33
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85
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2
46
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4
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14
50
45
0
2
52
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3.8
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10
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2.0
26
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12
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110
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9
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1.62
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2.0
33
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19
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28
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64
1
1
32
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2966102--2966205
36
3.0
33
78
14
95
62
0
4
32
1.16
2966068--2966199
22
6.0
22
69
18
62
62
0
3
33
1.19
2968803--2968882
30
2.8
29
77
9
92
47
0
1
51
1.08
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22
2.8
22
80
2
61
68
6
6
18
1.33
2971419--2971559
3
46.7
3
74
12
101
57
1
7
34
1.35
2971559--2971590
16
2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
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16
2.8
15
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59
62
0
6
30
1.21
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3
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3
100
0
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0
0
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3
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100
0
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0
0
34
0.93
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27
2.7
29
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10
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50
19
5
24
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205
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204
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2495
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22
18
29
1.97
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15
3.5
14
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24
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1.82
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22
2.8
22
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2
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68
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6
18
1.33
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3
20.0
3
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0
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0
1
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16
2.0
16
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0
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21
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16
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0
6
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0
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0
0
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1.60
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35
2.1
35
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0
123
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15
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16
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6
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20
2.5
19
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0
4
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1.21
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31
2.0
31
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3
86
45
6
6
41
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3000964--3001008
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2.0
23
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0
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8
6
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2.1
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100
0
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0
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0
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12
2.1
12
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0
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0
0
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20
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4
0
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1.15
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1.9
18
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0
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2.0
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54
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2.4
29
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11
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1.66
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22
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23
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20
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0
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0
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0
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17
1.9
17
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11
50
21
6
0
72
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3043168--3043205
2
19.0
2
88
0
58
44
0
5
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3043262--3043310
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3.2
16
72
16
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2
4
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1.30
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3.2
13
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30
0
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1.15
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1.24
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433