Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  211  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65949806--65949888
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2.8
30
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16
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27
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3.2
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1.97
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5
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18
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76
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1.02
65962161--65962206
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3.1
14
82
14
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2
1.06
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12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
65962269--65962324
18
3.1
18
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3
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1.27
65962275--65962356
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2.7
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2
21
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3.2
30
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106
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27
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2.4
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5
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18
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0
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4
25
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10
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52
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10
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10
88
0
52
37
22
25
14
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20
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16
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1.97
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30
3.2
29
69
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77
27
15
26
29
1.96
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30
2.8
30
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21
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11.0
5
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20
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3
17
1
77
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65981133--65981189
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17
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1.00
65981131--65981200
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3.3
20
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18
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65982106--65982171
11
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11
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16
4
7
71
1.26
65982106--65982171
23
2.9
22
86
8
96
16
4
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71
1.26
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30
3.2
30
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28
15
26
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2.8
18
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28
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26
0
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18
2.1
19
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53
7
23
2
66
1.30
65988419--65988494
18
4.4
18
76
15
63
13
28
0
57
1.36
65990761--65990843
11
7.7
11
84
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100
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6
4
16
1.23
65990751--65990842
21
4.3
22
82
10
102
71
7
5
15
1.27
65991744--65991811
21
3.2
20
80
12
66
76
4
17
1
1.03
65991755--65991811
5
11.0
5
77
17
55
77
3
17
1
1.00
65991755--65991811
16
3.7
14
80
17
60
77
3
17
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1.00
65991859--65991889
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
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19
2.1
19
85
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53
25
35
17
22
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30
3.2
30
70
11
81
27
16
28
28
1.97
66000216--66000302
30
2.9
30
75
3
95
28
27
16
27
1.97
66001754--66001838
30
2.8
29
77
13
91
12
21
1
64
1.34
66001804--66001848
18
2.4
19
81
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56
13
17
2
66
1.34
66001814--66001838
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66001908--66001963
5
11.0
5
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17
62
3
17
0
78
0.89
66001908--66001970
16
4.2
14
80
13
72
3
17
1
77
0.97
66001912--66001959
25
1.9
26
87
8
73
4
16
0
79
0.89
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22
2.3
22
96
0
91
32
24
16
28
1.96
66008406--66008445
14
2.9
14
88
0
53
50
7
32
10
1.64
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3.2
8
100
0
52
38
0
38
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1.55
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12
4.4
12
81
4
72
68
7
5
18
1.33
66015230--66015283
25
2.2
24
86
3
72
68
7
5
18
1.33
66020489--66020527
18
2.1
18
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51
25
35
15
23
1.94
66022161--66022200
19
2.1
19
85
0
53
25
35
17
22
1.95
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14
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15
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50
3
21
5
70
1.22
66026818--66026859
13
3.1
13
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10
57
2
21
4
71
1.16
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3.2
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90
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15
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27
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1.41
66031707--66031788
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2.7
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10
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2.4
17
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0
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14
19
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1.26
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12
100
0
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12
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1
16
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30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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0
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1.96
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1.97
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77
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
28
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66099959--66100023
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1.9
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0
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16
25
33
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433