Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr06 132263754 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  132263754

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   

This is table  366  of  433  ( 51894 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114917587--114917784
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
114927282--114927324
21
2.0
21
91
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18
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48
1.76
114932969--114933008
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2.1
19
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4
53
35
15
5
45
1.68
114933319--114933414
48
2.0
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0
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18
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1.98
114934704--114934750
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2
2
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114935939--114936003
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2.0
32
96
0
121
38
24
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29
1.83
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22
2.2
21
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58
36
21
8
34
1.84
114938898--114938976
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4.2
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10
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1.82
114938899--114938986
36
2.4
35
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117
35
15
10
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40
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25
25
23
26
2.00
114940694--114940913
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2.7
79
79
5
228
24
25
23
26
2.00
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28
2.8
26
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4
85
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22
37
1.84
114945519--114945599
26
3.2
26
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10
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37
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4
32
1.78
114950960--114951004
19
2.3
19
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54
28
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2
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1.33
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1.9
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0
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29
1.88
114955400--114955460
21
2.8
21
80
5
68
37
26
21
14
1.92
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2.5
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80
7
106
39
21
19
19
1.93
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2.3
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79
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174
36
19
1
43
1.59
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17
2.2
17
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9
51
36
21
0
42
1.53
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2
100
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50
0
0
50
1.00
114956904--114956928
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2.8
9
100
0
50
56
0
8
36
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114965258--114965288
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2.5
13
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5
55
16
25
0
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114967176--114967214
18
2.0
20
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48
0
5
46
1.24
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21.0
2
90
0
66
45
0
4
50
1.23
114972973--114973073
33
3.1
33
98
0
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21
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39
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114976022--114976126
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4.3
25
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18
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35
20
20
24
1.96
114976042--114976111
22
3.1
22
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4
77
38
18
20
22
1.93
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1.9
40
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0
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28
1.84
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16
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66
3
0
30
1.08
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9
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2
1
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0
0
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1.00
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1.97
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151
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635
26
17
25
30
1.97
114982572--114982603
16
2.0
16
93
0
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0
18
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1.8
180
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503
38
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16
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1.82
114987249--114987401
41
3.7
41
83
8
184
28
24
16
29
1.97
114991921--114992094
46
3.8
46
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11
176
21
18
28
30
1.97
114991916--114992086
93
1.8
93
87
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254
21
19
28
30
1.97
114994616--114994772
43
3.7
43
76
5
158
26
16
23
33
1.96
114994609--114994787
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2.1
86
77
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182
24
16
23
35
1.94
114994926--114994981
19
2.9
19
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10
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3
23
39
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20
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34
0
23
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1.55
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15
2.1
15
100
0
62
38
12
12
35
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115005625--115005728
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2.4
43
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138
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18
24
31
1.97
115005588--115005746
43
3.7
43
77
7
153
25
18
24
31
1.98
115005900--115005955
19
2.9
19
71
10
51
33
3
23
39
1.72
115005912--115005949
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1.9
20
84
10
51
34
0
23
42
1.55
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2.5
20
100
0
100
12
34
36
18
1.87
115011260--115011419
42
3.8
42
81
5
173
30
23
15
30
1.95
115011260--115011419
84
1.9
84
81
10
193
30
23
15
30
1.95
115012939--115012984
24
2.0
23
83
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58
10
6
28
54
1.60
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2.3
14
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41
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0
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1.16
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0
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1.08
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1.10
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3.0
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24
1
4
69
1.17
115013956--115014037
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0
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8
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1.62
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15
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5
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2.6
29
89
4
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16
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25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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79
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1.97
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3.2
39
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1
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20
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1.96
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2.3
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1.98
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2.6
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1.95
115067517--115067673
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1.97
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23
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2.3
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3
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5
0
54
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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1.97
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115175620--115175740
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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1.98
115182900--115183020
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21
20
28
1.98
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0
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10
8
50
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433